dc.contributor.author
Evers, Jan Felix
dc.date.accessioned
2018-06-07T21:16:29Z
dc.date.available
2005-06-17T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/7650
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-11849
dc.description
0 Title page and contents 107
1 Introduction 1
2 New Methods for the Computer-Assisted 3D Reconstruction of Neurons from
Confocal Image Stacks 11
3 Progress in Functional Neuroanatomy Precise Automatic Geometric
Reconstruction of Neuronal Morphology From Confocal Image Stacks 47
4 Synaptogenic control of the Shape of Dendritic filopodia 87
5 Computational analysis of dendritic signal integration 107
6 Summary and Outlook 115
7 Zusammenfassung 117
8 Danksagung 107
dc.description.abstract
This thesis was divided into two parts. In the first part I developed novel
tools to generate precise geometric reconstructions of neuronal shapes from
confocal image stacks. These can be done semi-automatically on complex
branching neurons and can achieve a degree of precision not previously
available at the corresponding respective optical resolution. The semi-
automatic reconstruction methods are described in chapter 2.
I further established techniques for full automation of the reconstruction
process. These can be applied on 'simple' neurons (such as cerebellar Purkinje
cells) and still yield maximum precision, however they are restricted to
clearly-stained neuronal branches. Furthermore, I developed methods to
quantitatively investigate the distribution of labeled molecules (i.e.
synaptic proteins, cell surface molecules etc.) along neuronal surfaces.
Together, these new methods open up new frontiers in functional neuro-anatomy.
One example is that synapse distributions through dendritic trees can be now
estimated from light microscopy work. This work is presented in chapter 3.
In the second part of the thesis I used these novel methods to analyze the
role of dendritic filopodia for postembryonic dendritic growth and for
synaptogenesis of motorneurons during the metamorphosis of Manduca sexta. The
results are described in chapter 4 and demonstrate that two different types of
filopodia, namely shaft and tip filopodia, exist within one dendritic tree.
Both undergo a different morphogenesis during ongoing dendritic growth and
synaptogenesis. The data further indicate that shaft filopodia may mainly be
important for guiding in axon terminals which have just made contact with
dendritic filopodia, whereas the tip filopodia seem to have little to do with
synaptogenesis, but are, on the other hand, important for steering growing
dendrites through developing neuropils.
On the basis of the new methods and the results on dendrite development and
synaptogenesis within developing dendritic trees, several future challenges
can now be faced: First, one could employ the techniques to localize the sites
of input synapses not only on filopodia but throughout entire dendritic trees.
This might help to figure out the rules as to where and when synapses are
formed during postembryonic remodelling. Second, such synapses localization
analysis can be broken down according to the different transmitter types by
combining transmitter and synaptic protein immuno-cytochemistry with precise
neuronal surface reconstruction. And finally, the role of specific synapse
distribution rules through dendritic trees for adult behavior can be addressed
by theoretical computational analysis with multi-compartment modelling.
Geometric reconstructions can be equipped with the sites of various different
types of input synapses and exported into modelling software like NEURON. This
allows us to compare random synapse distributions with those found in the
tissue, and to compare rules for synapse distribution found at different
developmental stages on different dendritic geometries. Since the function of
the Motorneuron 5 in Manduca sexta is well understood at the larval and the
adult stages, this yields the unique possibility to investigate the effects on
dendritic shape and synapse distribution through this complex geometry in the
light of neuronal function, and even in a behavioral context.
de
dc.description.abstract
Diese Dissertation besteht aus zwei thematisch zusammenhängenden Teilen. Im
ersten Teil beschreibe ich die Entwicklung von Methoden, die es erlauben,
genaue geometrische Rekonstruktionen des Verzeigungsmusters anhand von
Neuronen von 3-dimensionalen Bilderstapeln zu erstellen, die mit Hilfe der
konfokalen Mikroskopie aufgenommen wurden. Die Rekonstruktion erfolgt semi-
automatisch und erzielt auch bei stark verzweigten Neuronen eine Genauigkeit,
die die optische Auflösung des entsprechenden Mikroskopie-Verfahren voll
ausnutzt. Eine derartige Genauigkeit wird von keinen anderen derzeit
erhältlichen Rekonstruktionsmethoden erreicht. Diese Ergebnisse werden in
Kapitel 2 beschrieben.
Im Kapitel 3 beschreibe ich die Erweiterung der semi-automatischen
Rekonstruktions-Algorithmen, um eine vollständige Automatisierung der
geometrischen Rekonstruktion ``einfach'' verzweigter Neuronen (zum Beispiel
zerebrale Purkinje-Neurone) zu ermöglichen. Diese voll-automatischen Methoden
sind auf deutlich gefärbte Strukturen beschränkt, welche jedoch dann ohne
Einbußen in der Genauigkeit rekonstruiert werden. Desweiteren beschreibe ich
Methoden, immun-histochemische Färbungen entlang der Oberfläche von Neuronen
quantitativ zu erfassen (zum Beispiel synaptisch lokalisierte Proteine oder
Zelloberflächen-Moleküle). Im Zusammenspiel ermöglichen diese Rekonstruktions-
und Quantifizierungsmethoden, neuartige Fragestellungen in der funktionellen
Neuroanatomie zu bearbeiten. Ein Beispiel ist die Analyse der Verteilung von
putativen Eingangs-Synapsen auf gesamten dendritischen Neuronverzweigungen
anhand lichtmikroskopischer Meßmethoden.
Im zweiten Teil meiner Arbeit benutze ich diese neuentwickelten
Rekonstruktions-Methoden, um die Rolle von Filopodien entlang dendritischer
Verzweigungen in Bezug auf Wachstumssteuerung und Synaptogenese zu
untersuchen. Die Ergebnisse dieser Untersuchung beschreibe ich in Kapitel 4.
Ich konnte zeigen, daß zumindest zwei unterschiedliche Typen von dendritischen
Filopodien innerhalb eines Dendritenbaumes vorkommen, nämlich solche an
dendritischen Endigungen und Filopodien entlang dendritischer Schaft-Segmente.
Beide Typen unterliegen einer entwicklungsabhängigen Morphogenese, die sich
allerdings untereinander verglichen unterscheidet. Die Ergebnisse lassen auf
unterschiedliche Aufgaben beider Typen von Filopodien schließen: Schaft-
Filopodien übernehmen hauptsächlich die Aufgabe, präsynaptische Axon-
Endigungen in Richtung Dendrit zu leiten. Filopodien an dendritischen
Endigungen hingegen haben geringen Anteil an Synaptogenese, übernehmen jedoch
hauptsächlich die Wachstums-Steuerung von Dendriten durch das sich
entwickelnde Neuropil.
Diese Arbeit bereitet die Grundlage, anhand neu entwickelter
Rekonstruktionsmethoden und der Ergebnisse zu Dendritenwachstum und
Synaptogenese in sich entwickelnden dendritischen Bäumen weitere
Fragestellungen zu bearbeiten. Zum einen können die Verteilungen von Synapsen
auf kompletten dendritischen Feldern analysiert werden. Dies kann dazu
beitragen, Regeln der zeitlichen und ortsabhängigen Synaptogenese auf sich
entwickelnden Neuronen zu untersuchen. Synapsenorte können des weiteren auf
ihre Transmitter-Spezifität hin unterschieden werden, indem man synaptisch
lokalisierte Proteine und unterschiedliche Transmittertypen immuno-
histochemisch markiert und deren räumliche Korrelation bestimmt.
Abschließend kann dann die Bedeutung von ermittelten Regeln der
Synapsenverteilung für adultes Verhalten mittels Multi-Kompartiment-Modellen
analysiert werden. Dazu werden geometrische Rekonstruktionen mit
unterschiedlichen Synapsentypen ausgestattet und in Modellierungs-Programme
wie zum Beispiel NEURON exportiert. So kann die funktionelle Bedeutung von
zufällig verteilten Synapsen mit einer Synapsen-Verteilung verglichen werden,
wie sie im Gewebe ermittelt worden ist. Auch ein Vergleich unterschiedlicher
Regeln von Synapsenverteilungen während verschiedenen Entwicklungsstufen ist
möglich. Da die unterschiedlichen Funktionen des Motorneuron 5 in Manduca
sexta in Larven und adulten Motten gut bekannt sind, eignet sich dieses Neuron
besonders, die Bedeutung von dendritischer Struktur und Synapsenverteilung in
Bezug auf neuronale Funktion zu untersuchen oder sogar mit der Aufgabe im
Verhaltenskontext zu korrelieren.
de
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
dendrite filopodia reconstruction remodelling morphogenesis development synaptogenesis
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
The role of dendritic filopodia in postembryonic remodelling of dendritic
architecture
dc.contributor.firstReferee
PD Dr. Carsten Duch
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Hans-Joachim Pflüger
dc.date.accepted
2005-06-22
dc.date.embargoEnd
2005-06-30
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2005001538
dc.title.translated
Die Rolle dendritischer Filopodien in der postembryonalen Umgestaltung der
Architektur dendritischer Bäume
de
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000001577
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2005/153/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000001577
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open access