dc.contributor.author
Hoppe (geb.Stephan), Anja
dc.date.accessioned
2018-06-07T16:55:44Z
dc.date.available
2013-04-25T11:03:05.691Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/3178
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-7378
dc.description.abstract
Aufgrund schwerer Ausbrüche der Blauzungenkrankheit in den Jahren 2006/2007 in
Deutschland in Abwesenheit des afrikanischen Hauptvektors Culicoides imicola
wurden heimische Gnitzenarten als mögliche Vektoren des Blauzungenvirus
diskutiert. Da es bisher nur wenige und zudem standortbasierte Studien zur
Gnitzenfauna Deutschlands gab, wurde ein bundesweites entomologisches
Monitoring-Projekt ins Leben gerufen. Dafür wurden an 89 Standorten, welche
sich innerhalb der Restriktionszone des Hauptausbruchsgebietes der
Blauzungenkrankheit im Jahr 2006 befanden, Milchbetriebe ausgewählt, auf denen
je eine Falle zum Fang der Zielinsekten und eine Wetterstation zur Erfassung
verschiedener Klimadaten installiert wurde. Die Auswertung der Fänge erfolgte
über den Zeitraum von März 2006 bis Mai 2007 und bestand aus der Ermittlung
der Fangzahlen, des Geschlechtsverhältnisses der Gnitzen, ihrer
artspezifischen Gruppenzugehörigkeit (Obsoletus-, Pulicaris-Gruppe, restliche
Arten) sowie ihres Ernährungszustandes hinsichtlich einer erfolgten
Blutmahlzeit. Darüber hinaus wurde von einem Teil der Proben in Zusammenarbeit
mit externen Instituten die genaue Spezies bestimmt, sowie von einem weiteren
Teil gesogener Gnitzen das Vorhandensein von BTV-8-Genom getestet. Im Zuge des
Monitorings konnte die Abwesenheit des afrikanischen Hauptvektors C. imicola
auf dem Gebiet des Seuchenausbruchs 2006/2007 bestätigt werden. Gnitzen der
Obsoletus-Gruppe gehörten zu den häufigsten Gnitzenarten, gefolgt von Gnitzen
der Pulicaris-Gruppe. BTV-8-Genom konnte v.a. in Gnitzen der Obsoletus-Gruppe,
aber auch in Gnitzen der Pulicaris-Gruppe nachgewiesen werden, womit sich
deren Vektorkompetenz bestätigte. Da auch in den Wintermonaten noch viele
Gnitzen gefangen wurden, kann eine „vektor-freie Zeit“ nicht mehr festgelegt
werden. Die Frage nach der exakten Speziesbestimmung der gefangenen Gnitzen
machte es notwendig, eine möglichst schnelle und einfach zu handhabende
Methode zu entwickeln, um heimische Culicoides-Gnitzen sicher identifizieren
zu können. Da die morphologische Differenzierung zeitraubend ist und spezielle
Fachkenntnisse zur Präparation und morphologischen Identifizierung erfordert,
bot sich die Entwicklung eines PCR-gestützten Verfahrens mit
speziesspezifischen Primern zur Identifizierung von Gnitzenarten an. Die
ribosomale DNS-Region des Internal Transcribed Spacer 1 (ITS1) wurde zur
Bestimmung speziesspezifischer Primer ausgewählt. Für die Entwicklung der
Primer wurde DNS von Gnitzen der Arten Culicoides obsoletus s.s., C. dewulfi,
C. scoticus, C. chiopterus, C. punctatus und C. pulicaris verwendet, welche im
Rahmen des entomologischen Monitorings von März 2007 – Mai 2008, gefangen
wurden. Zur Festlegung des Gold- Standards wurden Teile (Flügel, Kopf und
Abdomen mit Geschlechtsorganen) der verwendeten Gnitzen präpariert und zur
morphologischen Identifizierung auf Objektträgern fixiert. Nach Extraktion der
DNS aus den verbleibenden Körperteilen (Thorax mit Beinen und oberem Abdomen)
und Amplifikation der ITS1-Region mit den gattungsspezifischen Primern
PanCulF/PanCulR (Cêtre-Sossah et al., 2004), erfolgte die Ermittlung
potenzieller Vorwärts- Primerregionen für jede der Zielspezies mittels
spezieller Software; als Rückwärtsprimer diente der rückwärtige Primer PanCulR
aus dem gattungsspezifischen Primerpaar. Die Eignung der ermittelten Primer
wurde softwaregestützt getestet und die Synthese der Primer CulObsF2, CulDewF,
CulChioF, CulPunctF und CulPulF daraufhin bei einem Speziallabor veranlasst.
Für jeden dieser Primer wurde das ideale PCR-Protokoll (teilweise touchdown-
Protokoll) durch Bestimmung der optimalen MgCl2-Konzentration und Annealing-
Temperatur ermittelt. Die entwickelten Primer wurden in verschiedenen
Verfahren auf ihre analytische Spezifität und Sensitivität hin getestet. Der
Einsatz der Primer wurde mittels verschiedener Untersuchungen getestet.
Verbesserungsvorschläge für zukünftige entomologische Untersuchungen und der
Einsatz der speziesspezifischen Primer bei künftigen Studien wurden
diskutiert.
de
dc.description.abstract
Due to the severe outbreaks of bluetongue disease in the years 2006/2007 in
Germany in the absence of the main African vector Culicoides imicola, the role
of authochtonous midges as possible vectors of the bluetongue disease were
discussed. Only few local studies regarding the midge fauna of Germany existed
therefore an entomological monitoring project covering a great part of Germany
was launched. At 89 dairy farms located within the restriction zone of the
bluetongue epidemic of 2006 UV-light traps for catching target insects as well
as weather stations for collecting climate data were installed. The catches
were performed during March 2006 and May 2007 and were analysed regarding the
numbers of caught midges, their sex ratio, their belonging to the C. obsoletus
group, C. pulicaris group or other, as well as their status of blood
engorgement. Furthermore, a certain number of midges were analysed down to
species level as well as tested for BTV-8 genome by cooperating institutes.
The results of the monitoring project confirmed the abscence of the main
vector C. imicola in the region of the epidemic of 2006/2007. Midges of the C.
obsoletus group were caught most numerous, followed by midges of the C.
pulicaris group. BTV-8 genome was mostly found in midges of the C. obsoletus
group but also in some of the C. pulicaris group affirming their vector
potential. Because midges were still caught in the months of winter a “vector-
free period” could not be defined. In order to identify caught midges down to
species level, a rapid and easy applicable method for identification of
autochthonous Culicoides spp. had to be developed. Since morphological
differentiation is time-consuming and demands specialised knowledge of
preparation and identification, a polymerase chain reaction (PCR)-based
procedure in connection with species-specific primers provided a solution. The
region of internal transcribed spacer 1 (ITS1) of the ribosomal DNA was chosen
as target sequence for the development of speciesspecific primers. The DNA
used for the development of primers originated from Culicoides obsoletus s.s.,
C. dewulfi, C. scoticus, C. chiopterus, C. punctatus and C. pulicaris midges
captured during the entomological monitoring of March/April 2007 – May 2008.
In order to determine a gold standard body parts of the chosen midges (wings,
head, abdomen with genitals) were mounted on slides for morphological
identification. The DNA was extracted from the remaining parts (thorax with
legs and upper abdomen) and the ITS1-region amplified using the conservative
primers PanCulF/PanCulR (Cêtre-Sossah et al., 2004). Potential forward-primer
regions were determined with the help of DNA-software; PanCulR was kept as
reverse primer. The qualification of the potential primers was tested using
DNAsoftware and the synthezisation of the primers CulObsF2, CulDewF, CulChioF,
CulPunctF and CulPulF was carried out by a spezialised laboratory. For each
primer an optimized PCR protocol was developed by determining the ideal MgCl2
concentration and annealing temperatur; for some primers a touchdown method
was applied. Using different procedures the primers’s analytical specificity
and sensitivity was defined. The deployment of the primers was tested through
different methods. Suggestions of improvement for subsequent entomological
investigations were mentioned and the utilization of species-specific primers
in future studies discussed.
en
dc.format.extent
III, 159 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
cattle diseases
dc.subject
bluetongue virus
dc.subject
disease vectors
dc.subject
ceratopogonidae
dc.subject
molecular genetics techniques
dc.subject
polymerase chain
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::630 Landwirtschaft::630 Landwirtschaft und verwandte Bereiche
dc.title
Entomologische und molekulargenetische Untersuchungen zur Gnitzenfauna
(Diptera: Ceratopogonidae) in Deutschland
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Peter-Henning Clausen
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Dieter Mehlitz
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Heinz Mehlhorn
dc.date.accepted
2013-01-21
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000094057-9
dc.title.translated
Entomological and molecular genetic studies regarding the midge fauna
(Diptera: Ceratopogonidae) of Germany
en
refubium.affiliation
Veterinärmedizin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000094057
refubium.note.author
Mensch und Buch Verlag
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000013267
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access