dc.contributor.author
Pauli, Daniela
dc.date.accessioned
2018-06-07T16:39:33Z
dc.date.available
2006-11-01T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/2850
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-7051
dc.description
Titelblatt und Inhaltsverzeichnis
Einleitung
Material und Methoden
Ergebnisse
Diskussion
Zusammenfassung
Literaturverzeichnis
Anhang
Danksagung Eidesstattliche Erklärung
Lebenslauf
dc.description.abstract
Die Umwandlung von Glucosamin-6-Phosphat zu Fructose-6-Phosphat durch das
Enzym Glucosamin-6-Phosphat-Desaminase (GNPDA) ist ein wichtiger Schritt im
katabolen Stoffwechsel von N-Acetylglucosamin (GlcNAc) und Glucosamin (GlcN).
Normalerweise sind C. albicans-Stämme in der Lage, diese beiden Aminozucker
als Kohlenstoffquelle zu nutzen. Die Arbeitsgruppe um Tietz beschrieb
morphologisch atypische C. albicans aus Afrika, die GlcNAc und GlcN nicht
verwerten konnten und weniger virulent als die typischen C. albicans aus der
gleichen Region erschienen [Tietz et al., 1995]. Ziel der vorliegenden Arbeit
war die Suche nach Mutationen im NAG1-Gen, welches die GNPDA kodiert, oder
Veränderungen in der Genexpression, die die mangelnde Assimilation von GlcNAc
und GlcN in den atypischen Stämmen erklären könnten. Bestimmungen der
Enzymaktivität zeigten eine verminderte Induzierbarkeit der GNPDA durch GlcNAc
bei den atypischen Stämmen, jedoch ist eine Grundaktivität bei allen Stämmen
nachweisbar. Anhand der von Natarajan und Datta (1993) für C. albicans
publizierten NAG1-Sequenz wurden spezifische Primer für die Amplifizierung
dieses Gens für DNA- und mRNA-Analysen in verschiedenen typischen und
atypischen Stämmen entwickelt. Untersuchungen zur Expression des NAG1-Gens
ergaben keine signifikanten Unterschiede in der mRNA-Konzentration zwischen
typischen und atypischen (mit GlcNAc-induzierten und nicht induzierten)
Stämmen. Um nach Polymorphismen in der DNA-Sequenz zu suchen, wurden die von
typischen und atypischen Stämmen erhaltenen PCR-Produkte zunächst einer SSCP-
Analyse unterzogen. Alle GlcNAc- und GlcN-negativen Stämme, mit Ausnahme von 2
Stämmen, hatten ein identisches SSCP-Muster, während die getesteten typischen
Stämme unterschiedliche, fast individuelle SSCP-Muster zeigten. Bei der
Sequenzierung der amplifizierten NAG1-PCR-Produkte wurden bei den atypischen
Stämmen, im Vergleich zu den typischen C. albicans, drei Mutationen in der
Aminosäure-Sequenz nachgewiesen. Diese Mutationen können eine veränderte
Konformation des Enzyms und damit eine reduzierte Induzierbarkeit zur Folge
haben.
de
dc.description.abstract
The conversion of glucosamine-6-phosphate into fructose-6-phosphate catalyzed
by the enzyme glucosamine-6-phosphate deaminase (GNPDA) is an important step
in the N-acetyl-glucosamine (GlcNAc) and glucosamine (GlcN) catabolic pathway.
Normally, C. albicans strains are able to utilize these two aminosugars as the
sole carbone source. The work group of Tietz described morphologically
atypical C. albicans strains from Africa which seemed to be less virulent than
typical C. albicans strains from the same geographical area [Tietz et al.,
1995]. The objective of this study was to search for mutations in the NAG1
gene, which the GNPDA encodes, or for changes in the gene regulation that may
explain the inability of GlcNAc- and GlcN-negative strains to assimilate the
two amino sugars. The ability to induce GNPDA through GlcNAc is reduced in the
atypical strains. However, in all uninduced strains, typical and atypical, an
activity of GNPDA was detectable. Specific PCR primers, based on sequences of
the NAG1 gene published by Natarajan and Datta (1993), were designed for the
amplification of the NAG1 gene DNA and mRNA in various typical and atypical C.
albicans strains. The analysis of the gene-expression showed no significant
differences in the concentrations of mRNA in both populations (GlcNAc induced
and not induced). To test for sequence polymorphisms, the amplification
products were subjected to an sscp analysis. All GlcNAc- and GlcN-negative
strains with the exception of two strains had an identical but unique sscp
pattern, whereas all typical strains tested showed varying, almost individual
sscp patterns. Sequencing of the amplified NAG1 genes of GlcNAc- and GlcN-
negative strains did reveal three mutations in the amino acid sequence
compared to the gene amplified from typical strains, which could provoke a
change of conformation in the enzyme and therefore a reduced induction may be
the consequence.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
<i>C. albicans</i>
dc.subject
glucosamine-6-phosphate deaminase
dc.subject
n-acetylglucosamine
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Molekulare Charakterisierung des Glucosamin-6-Phosphat-Desaminase-Gens (NAG1)
in C. albicans
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. sc. med. Wolfgang Presber
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. med. Reinhard Rüchel
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. med. Michael Seyfarth
dc.date.accepted
2006-12-15
dc.date.embargoEnd
2006-11-24
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000002390-0
dc.title.translated
Molecular characterization of glucosamine-6-phosphate deaminase (NAG1) from
Candida albicans
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
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FUDISS_thesis_000000002390
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