dc.contributor.author
Dach, Andrea
dc.date.accessioned
2018-06-07T16:15:37Z
dc.date.available
2003-02-06T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/2284
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-6485
dc.description
Titelblatt und Inhaltsverzeichnis
1\. Einleitung 3
1.1. Das Problem der Zytostatikaresistenz 3
1.2. Biochemische Resistenzmechanismen 3
1.3. Allgemeine Einführung in die Multidrug Resistenz (MDR) 3
1.4. Das P-Glykoprotein (Pgp) 4
1.5. Das Multidrug Resistenz-assoziierte Protein (MRP) 7
1.6. Das Lungen Resistenz-assoziierte Protein (LRP) 10
1.7. Das Kolonkarzinom 12
1.8. Aufgabenstellung 13
2\. Material und Methoden 14
2.1. Abkürzungen 14
2.2. Geräte 15
2.3. Materialien für molekularbiologische und immunhistologische Arbeiten 16
2.4. Lösungen und Puffer 17
2.5. Patientenmaterial 19
2.6. RNA-Extraktion 20
2.7. Bestimmung der RNA-Konzentration und -Reinheit 21
2.8. Reverse Transkription 21
2.9. Polymerase-Kettenreaktion (PCR) 22
2.9.1. Semiquantitative PCR 22
2.9.2. Quantitative Real-Time online PCR 24
2.10. Gelelektrophorese 25
2.11. Alkalische-Phosphatase-anti-alkalische Phosphatase-Technik (APAAP) 26
2.12. Statistische Auswertung 27
3\. Ergebnisse 28
3.1. Transkriptionsebene 28
3.1.1. Konventionelle PCR 28
3.1.2. Light Cycler 34
3.2. Translationsebene 42
3.3. Vergleich Transkriptions- Translationsebene 50
3.3.1. Light Cycler PCR versus Immunhistochemie (IHC) 50
3.3.2. Konventionelle PCR versus Immunhistochemie 53
3.4. Vergleich Light Cycler-konventionelle PCR 56
4\. Diskussion 59
4.1. Polymerase-Kettenreaktion 59
4.2. Vergleich der semiquantitativen PCR mit dem Light Cycler System 61
4.3. Immunhistochemischer Proteinnachweis 62
4.4. Vergleich Transkriptions- und Translationsebene 63
4.5. Ausblick 64
5\. Zusammenfassung 65
6\. Anhang 67
6.1. Patientendaten 67
6.2. Ergebnisse der konventionellen PCR 68
6.3. Ergebnisse der Real-Time RT-PCR 69
6.4. Schmelzkurvenanalysen der RT-PCR mit dem Light Cycler 70
6.5. Nachweis von b2M-Transkripten mit der Real Time RT-PCR 74
6.6. Abbildungsverzeichnis 75
6.7. Tabellenverzeichnis 77
7\. Literaturverzeichnis 78
dc.description.abstract
Für die Entwicklung der Multidrug Resistenz (MDR) sind im wesentlichen das
P-Glykoprotein (Pgp), kodiert von mdr1 auf Chromosom 7, das Multidrug
Resistenz-assoziierte Protein (MRP), kodiert von mrp, und das Lungen-
Resistenzprotein (LRP), kodiert von lrp, beide auf Chromosom 16 lokalisiert,
verantwortlich. Es wurden die Expressionsmuster der MDR-assoziierten Proteine
und -Gene bei 31 Kolonkarzinompatienten auf Korrelationen untersucht. Es kamen
die konventionelle semiquantitative RT-PCR, die Real-Time RT-PCR (Light Cycler
System) und die Alkalische-Phosphatase-anti-alkalische-Phosphatase-Methode
(APAAP) zur Anwendung. Es ergab sich bei der konventionellen PCR eine
eindeutig positive Korrelation für mrp und mdr1. Lrp und mrp, sowie lrp und
mdr1 korrelierten schwach positiv. Mit dem Light Cycler ergaben sich eine
eindeutig positive Korrelation für lrp und mrp. Für mrp und mdr1 zeigte sich
nur eine schwach positive Korrelation, während lrp und mdr1 nicht
korrelierten. Die positiven Korrelationen sprechen für eine Co-Regulation der
Resistenzgene. Dies trifft besonders für lrp und mrp zu, die beide auf
Chromosom 16 lokalisiert sind. Bei den Ergebnissen der Proteine wurden für Pgp
und MRP, MRP und LRP, sowie für Pgp und LRP jeweils positive Korrelationen
gefunden. Diese Co-Expression der MDR-assoziierten Proteine erschwert die
Überwindung der Resistenz mit so genannten Modulatoren. Die
Korrelationsanalysen zwischen den Ergebnissen der Gen- (Light Cycler) und der
Proteinexpression ergaben für LRP eine eindeutig negative Korrelation Bei MRP
und Pgp wurden keine Korrelationen gefunden Es konnte bei keinem der drei
Multidrug Resistenz-assoziierten Gene eine Korr. zwischen den beiden
verschiedenen PCR-Methoden nachgewiesen werden. Bei den Versuchen auf
Transkriptionsebene wurden unterschiedliche cDNA-Präparationen der einzelnen
Patientenproben verwendet, was die mangelnde Korrelation erklären könnte. Nur
beim Light Cycler kamen für alle Gene die gleichen cDNAs zur Anwendung. Somit
sind die Ergebnisse der Real-Time RT-PCR im Vergleich zur semiquantitativen
PCR zuverlässiger. Die Quantitative Real-Time RT-PCR ist schneller,
reproduzierbarer und genauer als die konventionelle semiquantitative PCR.
Letztere erfordert zur Quantifizierung post-PCR Blot-Verfahren, die
zeitaufwendig und anfälliger für Kontaminationen sind. Immunhistochemische
Methoden bestimmen die Expressionsprofile von Multidrug Resistenz-assoziierten
Proteinen auf Einzelzellniveau und können so normale von neoplastischen Zellen
unterscheiden. Dies ist bei der Polymerase-Kettenreaktion nicht möglich. Die
fehlende Korrelation zwischen Transkriptions- und Translationsebene ist durch
verschiedene Faktoren, wie mRNA-Spleißvarianten, mRNA-Stabilität, post-
transkriptionelle Regulation der Proteinexpression oder Proteinstabilität
erklärbar. Es sind weitere Untersuchungen erforderlich, um die Aussagekraft
der Multidrug Resistenz-assoziierten Gene und -Proteine im Bezug auf die
Wirksamkeit von Zytostatikatherapien bei Tumorpatienten gänzlich beurteilen zu
können.
de
dc.description.abstract
Multidrug resistance (MDR) is determinated by the increased expression of
P-glycoprotein (Pgp) encoded by the mdr1 gene on chromosome 7, the multidrug
resistance-associated protein (MRP) encoded by mrp and the lung resistance
protein (LRP) encoded by lrp, both located on chromosome 16. We have examined
the correlations of the expression of the MDR-associated proteins and genes in
colon carcinoma cells of 31 patients. For that we used semiquantitative RT-
PCR, real-time RT-PCR (Light Cycler system) and the alkaline phosphatase-anti
alkaline phosphatase method (APAAP). Using semiquantitative RT-PCR we found a
strong positive correlation for the expression of mrp and mdr1 and weakly
positive correlations for lrp and mrp as well as lrp and mdr1. With the Light
Cycler System we detected a strong positive correlation for the expression of
lrp and mrp, mrp and mdr1 correlated weakly positive, however lrp and mdr1
expression levels didn't correlate at all. The positive correlation suggests a
co-regulation of the transcription of the MDR-associated genes. That applies
especially to lrp and mrp, located both on chromosome 16. At the protein
levels we found positive correlations for Pgp and MRP, MRP and LRP, as well as
for Pgp and LRP. This co-express ion of the MDR-associated proteins makes it
more difficult to reverse the resistance with modulators. We studied the
correlations between mRNA levels (Light Cycler) and protein expression and
found a strong negative correlation for LRP, but no correlations for MRP and
Pgp. The two different PCR methods showed no correlations regarding the
expression of the MDR-associated genes. This lack of correlation could be
explained by the use of different cDNA preparations for each patient in the
PCR assays. Only with the Light Cycler we used the same cDNAs for all genes.
The results of the real-time RT-PCR are therefore more reliable compared to
the semiquantitative PCR. Quantitative real time RT-PCR is a rapid, sensitive
and reliable method. Semiquantitative PCR requires post PCR handling steps for
quantification that are time-consuming and may give rise to contaminations.
Immunhistochemical methods however allow detection at the cellular level and
differentiation of tumor cells from normal tissues that isn?t possible with
PCR assays. The lack of correlation between mRNA and protein levels may be
explained by several mechanisms like different mRNA splicing, stability of
mRNA, post-transcriptional regulation of the expression of the MDR-associated
proteins or stability of the proteins. Further examinations are required to be
able to judge completely the importance of MDR-associated genes and proteins
regarding the effectiveness of cancer chemotherapy.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
multidrug resistance Pgp LRP MRP Mdr1
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Multidrug Resistenz - assoziierte Gene und Proteine in humanen
Kolonkarzinomgeweben
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. med. Ulrich Keilholz
dc.contributor.furtherReferee
PD Dr. med. Torsten Schöneberg
dc.date.accepted
2002-12-13
dc.date.embargoEnd
2003-02-21
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2003000280
dc.title.translated
Multidrug resistance associated genes and proteins in human colon carcinoma
tissues
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000001162
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2003/28/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000001162
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free
dcterms.accessRights.openaire
open access