dc.contributor.author
Zahn, Claudia
dc.date.accessioned
2018-06-08T00:34:45Z
dc.date.available
2014-05-05T05:59:06.783Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/12156
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-16354
dc.description
INHALTSVERZEICHNIS Abkürzungen
...........................................................................................................
6 1
Zusammenfassung...................................................................................................
9 Summary
...............................................................................................................
11 2 Einleitung
..............................................................................................................
13 2.1 Biologische Bedeutung von Eisen
................................................................. 13 2.1.1
Eisenaufnahme in den Organismus
............................................................ 13 2.1.2
Zellulärer Eisenstoffwechsel
...................................................................... 14
2.1.3 Regulation des systemischen Eisenstoffwechsels
...................................... 14 2.2 Rolle des Transferrinrezeptors
...................................................................... 15
2.2.1 Transferrinrezeptor 1
.................................................................................
15 2.2.2 Shedding des Transferrinrezeptors
............................................................ 16 2.3 Regulierte
intramembranäre Proteolyse
........................................................ 16 2.4 Zielsetzung
....................................................................................................
19 3 Material
.................................................................................................................
21 3.1 Allgemeine Hinweise
....................................................................................
21 3.2 Geräte
............................................................................................................
21 3.2.1 Zell- und Bakterienkultur
........................................................................... 21
3.2.2 Zentrifugen
.................................................................................................
21 3.2.3 Elektrophorese und Westernblot
................................................................ 22 3.2.4
ELISA
........................................................................................................
22 3.2.5 Sonstige Geräte
..........................................................................................
22 3.3 Verbrauchsmaterial
........................................................................................
22 3.4 Zell- und Bakterienkultur
..............................................................................
23 3.5 Chemikalien
...................................................................................................
23 3.6 Antikörper
.....................................................................................................
24 3.6.1 Primärantikörper
........................................................................................
24 3.6.2 Sekundärantikörper
....................................................................................
25 3.7 Proteaseinhibitoren
........................................................................................
25 3.8 Kits
................................................................................................................
25 3.9 Oligonukleotide
.............................................................................................
26 4 Methoden
...............................................................................................................
26 4.1 Zellbiologische Methoden
.............................................................................
26 4.1.1 Kultivierung von HEK293 Zellen
............................................................. 26 4.1.2
Einfrieren und Auftauen von Zellen
.......................................................... 27 4.1.3
Transfektion von HEK293-Zellen
............................................................. 27 4.1.4
Immunfluoreszenz von HEK293-Zellen
................................................... 27 4.2 Proteinbiochemische
Methoden ....................................................................
28 4.2.1 Lyse von Zellen
.........................................................................................
28 4.2.2 Konzentrationsbestimmung von Proteinen
................................................ 29 4.2.3 Gelelektrophorese
......................................................................................
29 4.2.4 Westernblot und Immunodetektion
........................................................... 31 4.2.5 Stripping
....................................................................................................
32 4.2.6 Immunpräzipitation
...................................................................................
32 4.2.7 Membranlysatpräparation
.......................................................................... 33
4.2.8 MALDI-TOF-MS
......................................................................................
33 4.2.9 Antikörperaufreinigung
.............................................................................
34 4.2.10 Enzymgekoppelter Immunadsorptionstest
............................................. 35 4.3 Molekularbiologische
Methoden ...................................................................
36 4.3.1 Agarosegelelektrophorese
......................................................................... 36
4.3.2 Restriktionsverdau
.....................................................................................
37 4.3.3 Isolierung von DNA aus Agarosegelen
..................................................... 37 4.3.4 Ligation von
DNA-Fragmenten
................................................................. 37 4.3.5
Transformation von Plasmid-DNA
............................................................ 37 4.3.6
Präparation von Plasmid-DNA
.................................................................. 38 4.3.7
Polymerasekettenreaktion
.......................................................................... 39
4.3.8 DNA-Sequenzierung
..................................................................................
39 5 Ergebnisse
.............................................................................................................
40 5.1 Charakterisierung des Flag-TfR1-NTF-V5
................................................... 40 5.2 Identifizierung des
TfR1-C Peptides und der Spalt-stelle ............................. 41 5.3
Antikörperaufreinigung
.................................................................................
44 5.4 Etablierung eines Sandwich-ELISA
.............................................................. 53 5.5 Bindung
des TfR1-C Peptids an Serum Albumin .........................................
55 5.6 Identifizierung der Protease
........................................................................... 58
5.7 Lokalisierung von TfR1-NTF und den verschiedenen SPPLs
...................... 66 6 Diskussion
.............................................................................................................
69 6.1 Entdeckung des TfR1-C-Peptid
..................................................................... 69 6.2
Entwicklung von Nachweismethoden
........................................................... 72 6.3
Intramembranäre Proteolyse von TfR1-NTF durch SPPL2a und SPPL2b ... 75 7
Literaturverzeichnis
..............................................................................................
80 8 Anhang
..................................................................................................................
89 Publikationsverzeichnis
........................................................................................
89 Lebenslauf
.............................................................................................................
90 Danksagung
..........................................................................................................
91
dc.description.abstract
Der Transferrinrezeptor 1 (TfR1) ist ein homodimeres Typ II
Transmembranprotein und vermittelt die Eisenaufnahme über die Bindung des
eisenbeladenen Transferrin in die Zelle. Die transferrinbindende
extrazelluläre Domäne wird von einem als a disintegrin and metalloproteinase
(ADAM) bezeichneten Enzym im juxtamembranen Teil des TfR1 C-terminal von
Arginin 100 geschnitten. Der dabei entstehende lösliche Transferrinrezeptor
(sTfR) dient als diagnostischer Marker für erythropoetische Aktivität,
besonders um zwischen einer Eisenmangelanämie und einer inflammatorischen
Anämie zu unterscheiden, wobei die biologische Funktion des sTfR1 unverstanden
ist. Der Verbleib des durch die Proteolyse der Ektodomäne entstandenen
membranständigen N-terminalen Fragments (NTF) des TfR1 ist unbekannt. Für Typ
I Transmembranproteine wie dem Notch- oder dem ErbB4-Rezeptor konnte eine
weitere intramembranäre Proteolyse zur Proteindegradierung oder für weitere
Signaltransduktionen nachgewiesen werden. Dies gelang für Typ II
Transmembranproteine erst im Jahr 2002 nach der Entdeckung der
Signalpeptidpeptidase ähnlichen-Proteasen (SPPL) für die Substrate
Tumornekrosefaktoralpha (TNFα), FasLigand und british dementia Protein (Bri2).
Im Laufe dieser Arbeit konnte mit Hilfe eines N-terminal Flag-getaggten und
C-terminal V5-getaggten TfR1-NTF zum ersten Mal gezeigt werden, dass das
TfR1-NTF intramembranär gespalten wird. Das dabei extrazellulär entstehende
C-Peptid des TfR1 (TfR1-Cp) wurde im Medium als oxidiertes Monomer, d. h. mit
einer intramolekularen Disulfidbrücke zwischen dem Cystein 89 und 98
nachgewiesen. Zudem konnte die Sequenz des TfR1-Cp mit Hilfe der MALDI-TOF-
TOF-MS-Analyse bestimmt werden. Die intramembranäre Proteolyse erfolgte
demnach zwischen dem Glycin 84 und dem Tyrosin 85. Weiterhin wurden
polyklonale Antikörper gegen TfR1-Cp in Kaninchen generiert und aus dem
Kaninchenserum aufgereinigt. Diese Antikörper wurden für die Etablierung eines
Sandwich-ELISA zum Nachweis des TfR1-Cp im Serum verwendet. Es konnte eine
hohe Spezifität des Sandwich-ELISA mit Hilfe eines kompetitiven ELISA, bei dem
biotinyliertes TfR1-Cp mit verschiedenen Mengen ungelabeltem TfR1 versetzt
wurde, gezeigt werden. Weiterhin wurde mit Hilfe des ELISA humanes Albumin als
Interaktionspartner des TfR1-Cp identifiziert. In dieser Arbeit konnte zudem
gezeigt werden, dass die endogene Protease für die intramembranäre Proteolyse
des TfR1-NTF ein Mitglied der GxGD-Aspartylproteasen, speziell der SPP/SPPL-
Familie ist. Weitere Experimente mit überexprimierten SPPLs oder ihren
katalytisch inaktiven Mutanten zeigten bei SPPL2a und SPPL2b eine erhöhte
Freisetzung des TfR1-Cp. Während bei der katalytisch inaktiven SPPL2b D/A
überhaupt kein TfR1-Cp detektiert werden konnte, zeigte die Überexpression der
katalytisch inaktiven SPPL2a D/A eine verringerte jedoch nicht vollständig
unterdrückte Freisetzung des TfR1-Cp gegenüber Kontrollzellen. Zudem konnte
eine Kolokalisierung der SPPL2b mit dem TfR1-NTF nachgewiesen werden, dies
gelang nicht für die SPPL2a. Dies weist auf die SPPL2b als Hauptprotease des
TfR1-NTF hin, während die SPPL2a die am Prozess unwesentlichere Protease zu
sein scheint. Ferner gelang es in einer Kooperation mit Frau Fluhrer (DZNE,
LMU, München) die intrazelluläre Domäne des TfR1 (TfR1-ICD) in Membranlysaten
von mit SPPL2b überexprimierten Zellen nachzuweisen. Die physiologische
Bedeutung der intramembranären Proteolyse des TfR1-NTF und der entstehenden
Fragmente TfR1-Cp und TfR1-ICD ist ungeklärt. Die intramembranäre Proteolyse
könnte dem Abbau des TfR1 oder weiteren Regulationsmechanismen der Zelle und
des Körpers dienen. Während die TfR1-ICD in der Zelle als zellulärer Regulator
für einen Eisenmangel fungieren könnte, könnte das TfR1-Cp als systemischer
Regulator für eine Freisetzung von Eisen aus retikuloendothelialen Makrophagen
oder den Enterozyten des Darms durch eine mögliche Stabilisierung des
Eisenexportproteins Ferroportin wirken. Dies ist rein spekulativ und müsste
noch bewiesen werden.
de
dc.description.abstract
The transferrin receptor-1 (TfR1) is a homodimeric type II transmembrane
protein and mediates the cellular iron uptake via binding of ferri-
transferrin. The extracellular transferrin binding domain is cleaved by a
disintegrin and metallo- (ADAM) protease C-terminal of arginin-100 within the
juxtamembrane region of the ectodomain. The thereby generated soluble TfR1
(sTfR1) is used as a diagnostic marker for erythropoietic activity, in
particular to discriminate between iron deficiency anemia and anemia of
inflammation, however, the physiological function of sTfR1 is unclear. The
fate of the remaining N-terminal fragment of the TfR1 (TfR1-NTF) is unknown so
far. For type I transmembrane proteins such as Notch or ErbB4 receptor, an
intramembrane proteolysis for further protein degradation or for subsequent
signaling is known. For type II transmembrane proteins, this was the case
after the discovery of new proteins in 2002 referred as signalpeptide
peptidase-like proteases (SPPL) that cleave substrates such as tumornecrosis
factor-α (TNF-α), Fas ligand and the british dementia protein (Bri2). In this
work the intramembrane proteolysis of TfR1-NTF was detected for the first time
by using an N-terminal Flag tag and a C-terminal V5 tag fused to the TfR1-NTF.
The generated extracellular C-terminal peptide of TfR1 (TfR1-Cp) was detected
as an oxidized monomer, with an intramolecular disulfide bridge between
cystein-89 and cystein-98. Furthermore, the sequence of the peptide was
determined by a fragmentation analysis via MALDI-TOF-TOF-MS, which revealed
that intramembrane proteolysis occurs between glycin-84 and tyrosin-85.
Furthermore, polyclonal antibodies against the TfR1-Cp were generated in
rabbit and purified to be used for a sandwich-ELISA that was established to
determine the TfR1-Cp amount in human serum. There was a high specificity
detected by using a competitive assay with biotinylated TfR1-Cp and different
amounts of unlabelled TfR1-Cp. In addition, human serum albumin was identified
as an interaction partner of TfR1-Cp by using the sandwich-ELISA. Moreover,
the endogenous protease for the intramembrane proteolysis of the TfR1-NTF was
identified in this work. It belongs to the GxGD-aspartyl proteases, especially
to the SPP/SPPL-family. Further experiments with overexpressed SPPLs and their
catalytically inactive mutants showed an increased release of TfR1-Cp from
cells overexpressing SPPL2a and SPPL2b. By using the catalytically inactive
mutant SPPL2b D/A, absolutely no TfR1-Cp was detectable, whereas with the
catalytically inactive SPPL2a D/A a reduced but not completely abolished
TfR1-Cp signal was observed in contrast to the control cells. Furthermore, a
colocalisation of TfR1-NTF with SPPL2b but not with SPPL2a was detected in the
plasma membrane using confocal fluorescence microscopy. This indicates that
the SPPL2b is the major protease responsible for TfR1-NTF cleavage and the
SPPL2a only the minor one. In a cooperation with Regina Fluhrer (DZNE, LMU,
Munich) it was possible to detect the intracellular domain of the TfR1
(TfR1-ICD) in membrane lysates obtained from cells with co-expression of
SPPL2b. The physiologic relevance of the intramembrane proteolysis of the
TfR1-NTF and of the released fragments TfR1-ICD and TfR1-Cp is unknown. The
intramembrane proteolysis could be useful for the denaturation of the TfR1 or
for further regulation within the cell or in body. The TfR1-ICD might be
valuable as a cellular regulator for iron deficiency whereas the TfR1-Cp could
act as a systemic iron regulator for the iron release from reticuloendothelial
macrophages or from the enterocytes in the intestine by stabilizing the iron
exporter Ferroportin, but this is speculative and has to be proven.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik
dc.title
Regulierte intramembranäre Proteolyse des Transferrinrezeptors 1
dc.contributor.contact
claudia.zahn@hotmail.de
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Hendrik Fuchs
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Petra Knaus
dc.date.accepted
2014-01-20
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000096469-2
dc.title.translated
Regulated intramembrane proteolysis of transferrin receptor 1
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000096469
refubium.mycore.derivateId
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