dc.contributor.author
Götze, Sebastian Andreas
dc.date.accessioned
2018-06-07T22:37:38Z
dc.date.available
2014-03-25T09:56:59.004Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/9475
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-13674
dc.description.abstract
Carbohydrates are a class of structurally diverse biomolecules that surround
every cell of all living organisms. Glycans found on mammalian cells differ
significantly from saccharides presented on the surface of pathogenic
organisms. Therefore the immune system of higher animals can differentiate
self from non-self by interacting with sugars displayed on plasma membranes
and consequently raise an immune response against foreign carbohydrate
structures to eliminate pathogens. Investigating the immunogenicity of a sugar
or its interaction with a carbohydrate binding protein to assess structure-
activity relationships is difficult, because an amplification method for
glycans does not exist and isolation of reasonable quantities of single
molecular species remains challenging. Chemical synthesis of oligosaccharides
has emerged as a strategy to overcome the aforementioned obstacles. The goal
of this thesis was the generation of a library of pathogen related
carbohydrates and their employment in different in vitro and in vivo essays to
analyze their interaction with the immune system or single components thereof.
In the first part of this thesis (Chapter 2) a general and convergent method,
which features a set of fully orthogonal protecting groups allowing the
introduction of late stage modifications, was used to prepare derivatives of
glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchors and their corresponding
substructures. The synthesized compounds resemble the phosphoglycan moiety of
GPIs presented on the plasma membrane of the apicomplexan parasite Toxoplasma
gondii. All synthetic carbohydrates were equipped with either a thiol or amine
linker that enables fabrication of neoglycoconjugates and carbohydrate
microarrays. In the second part of this thesis (Chapter 3) two T. gondii-
specific GPI glycans were coupled to the carrier protein CRM197 to form two
neoglycoconjugates, which were evaluated for their immunogenic properties in
an animal model. The IgG immune response elicited by the glycoconjugates in
mice was highly specific towards the full phosphoglycans exhibiting no cross-
reactivity towards a structurally closely related mammalian GPI or
corresponding substructures. Furthermore, it was shown that the polyclonal
mouse serum recognized T. gondii tachyzoites revealing distinct differences in
the surface localization of the two glycolipids. Carbohydrate microarray
analysis of sera from humans suffering from toxoplasmosis confirmed that GPIs
of T. gondii are immunogenic and capable of inducing an early IgM response in
infected individuals (in collaboration with Prof. Dr. Uwe Groß,
Universitätsklinikum Göttingen). Taken together these results form the basis
for the development of a GPI-based vaccine against this obligate parasite and
a diagnostic tool for the detection of toxoplasmosis in humans. However,
further tests and challenge studies will be required to evaluate the
protective properties of this potential carbohydrate conjugate vaccine. In the
last part of this thesis (Chapter 4) the binding preferences of the human
lectin ZG16p, which may be involved in innate immunity, were defined by using
glycan microarray and NMR studies (in collaboration with Prof. Ten Feizi,
Glycosciences Laboratory, Imperial College, London and Dr. Yoshiki Yamaguchi,
Structural Glycobiology Team, RIKEN, Tokyo). A glycan microarray analysis
identified phosphatidylinositol mannosides (PIMs), which are major cell wall
components of some pathogenic bacteria including Mycobacterium tuberculosis,
as novel ZG16p ligands. On this account analogs of these glycolipids were
synthesized and employed in STD-NMR experiments to define binding epitopes.
These findings raise the possibility that human lectin ZG16p is involved in
the mucosal immune response by ‘opsonizing’ mycobacteria via an interaction
with PIMs on the cell surface of the pathogen. This hypothesis is subject for
future investigations.
de
dc.description.abstract
Kohlenhydrate gehören zu einer Klasse strukturell diverser Biomoleküle, die
jede Zelle aller lebenden Organismen umgeben. Glykane die auf Säugetierzellen
vorhanden sind unterscheiden sich signifikant von Sacchariden die auf der
Oberfläche von pathogenen Erregern vorkommen. Auf Grund dieser Differenz kann
das Immunsystem höherer Tiere durch Interaktionen mit Zuckern, die auf der
Plasmamembran präsentiert sind, Fremdorganismen von eigenen Körperzellen
unterscheiden und eine Immunantwort, die Pathogene eliminiert, gegen
körperfremde Kohlenhydrate erzeugen. Die Untersuchung der Immunogenizität von
Zuckern oder ihre Wechselwirkung mit Kohlenhydrat-bindenden Proteinen, um
Struktur-Wirkungsbeziehungen zu erstellen, ist schwierig, da keine
Vervielfältigungsmethode für Glykane existiert und die Isolierung angemessener
Mengen reiner Saccharide anspruchsvoll ist. Die chemische Synthese von
Oligosacchariden wurde deshalb als Strategie gewählt um die obengenannten
Hürden zu umgehen. Das Ziel dieser Doktorarbeit war die Generierung einer
pathogen-assoziierten Kohlenhydratbibliothek und deren Verwendung in
verschiedenen in vitro und in vivo Experimenten, um ihre Wechselbeziehung mit
dem Immunsystem oder einzelnen Komponenten davon zu untersuchen. Im ersten
Teil dieser Dissertation (Kapitel 2) wurde eine generelle und konvergente
synthetische Methode, welche als Besonderheit einen Satz an vollkommen
orthogonalen Schutzgruppen aufweist und eine Einführung von verschiedenen
Modifizierungen im späten Stadium der Synthese ermöglicht, genutzt, um
Derivate von Glycosylphosphatidylinositiol (GPI)-Ankern und deren
entsprechenden Substrukturen darzustellen. Die synthetischen Kohlenhydrate
spiegeln die Phosphoglykanstruktur von GPIs wieder, welche auf der
Plasmamembran des Parasiten Toxoplasma gondii, der zu den Apicomplexa gehört,
vorliegen. Alle Verbindungen wurden entweder mit einem Thiol- oder Amino-
Linker versehen, der die Anfertigung von Glykanmicroarrays oder
Neoglycoproteinen erlaubt. Im zweiten Teil dieser Dissertation (Kapitel 3)
wurden zwei T. gondii spezifische GPI-Glykane kovalent mit dem Carrier Protein
CRM197 verknüpft, um zwei Neoglycoproteine herzustellen, deren Immunogenizität
in einem Tiermodel evaluiert wurde. Die IgG Immunreaktion, welche durch die
Glykoconjugate ausgelöst wurde, war hochspezifisch und gegen die komplette
Phosphoglycanstruktur gerichtet. Kreuzreaktionen gegen unterschiedliche
Substrukturen oder einen strukturell eng verwandten GPI-Anker, der in
Säugetierzellen vorkommt, konnten nicht festgestellt werden. Des Weiteren
konnte gezeigt werden, dass das erhaltene polyklonale Mausserum T. gondii
Tachyzoiten erkennt und es deutliche Unterschiede in der Lokalisierung der
GPIs auf der Oberfläche des Parasiten gibt. Eine Glykanmicroarrayanalyse von
Blutseren, welche von Menschen stammen, die an einer Toxoplasmose leiden,
bestätigte, dass GPIs von T. gondii immunogen sind und eine frühe IgM
Immunreaktionen in Menschen hervorrufen (in Zusammenarbeit mit with Prof. Dr.
Uwe Groß, Universitätsklinikum Göttingen). Zusammenfassend lässt sich sagen,
dass diese Resultate die Basis für die Entwicklung eines GPI-basierten T.
gondii Impfstoffes und diagnostischen Tests, der eine Toxoplasmose in Menschen
nachweisen kann, darstellen. Allerdings müssen noch weitere Untersuchungen und
Challenge Studien durchgeführt werden um die protektiven Eigenschaften dieser
potentiellen Kohlenhydratimpfstoffe bewerten zu können. Im letzten Teil dieser
Dissertation (Kapitel 4) wurde die Bindungspräferenz des humanen Lectins
ZG16p, welches möglicherweise einen Teil der angeborenen Immunantwort
darstellt, mit Hilfe von Glykanmicroarrays und NMR-Experimenten bestimmt (in
Zusammenarbeit mit Prof. Ten Feizi, Glycosciences Laboratory, Imperial
College, London und Dr. Yoshiki Yamaguchi, Structural Glycobiology Team,
RIKEN, Tokyo). Eine Glykanmicroarrayanalyse konnte Phosphatidylinositol
Mannoside (PIMs), die einen Hauptbestandteil der Zellwand von verschiedenen
pathogenen Bakterien wie beispielsweise Mycobacterium tuberculosis ausmachen,
als neue Liganden von ZG16p identifizieren. Aus diesem Grund wurden Analoga
dieser Glycolipide synthetisiert und in STD-NMR Experimenten verwendet, um
deren Bindungsepitope zu bestimmen. Die erhaltenen Ergebnisse unterstützen die
Hypothese, dass dieses Lectin eine Rolle während der Immunabwehr in der
Darmschleimhaut spielt, in dem es Mykobakterien durch die Interaktion mit den
PIMs auf deren Oberfläche “ opsonisiert“. Diese Theorie ist Gegenstand
zukünftiger Forschung.
de
dc.format.extent
XIII, 211 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
carbohydrate chemistry
dc.subject
diagnostic tools
dc.subject
structural biology
dc.subject
Toxoplasma gondii
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie::547 Organische Chemie
dc.title
Synthesis of Parasite Related Carbohydrates and their Use as Probes for
Glycobiology
dc.contributor.contact
Sebastian.Goetze@mpikg.mpg.de
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Peter H. Seeberger
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Rudolf Tauber
dc.date.accepted
2014-03-24
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000096282-4
dc.title.translated
Synthese von Kohlenhydraten parasitärer Organismen und deren Verwendung als
Sonden für die Glykobiologie
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000096282
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000014931
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access