dc.contributor.author
Shalapour, Shabnam
dc.date.accessioned
2018-06-07T22:13:06Z
dc.date.available
2010-03-09T09:26:12.008Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/9002
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-13201
dc.description
CONTENT SUMMARY 6 1 INTRODUCTION 7 1.1 Childhood acute lymphoblastic leukemia
7 1.1.1 Features of the ALL disease 7 1.1.2 Characterization of ALL 7 1.1.2.1
Immunophenotype 7 1.1.2.2 Morphology 9 1.1.2.3 Genetic aberrations 9 1.1.3
Treatment of childhood ALL 13 1.2 Hematopoiesis 18 1.2.1 Stem cells /
hematopoietic stem cells 18 1.2.3 MSC as origin of the HSC BM-niche 21 1.2.3.1
Characterization of MSC 21 1.2.3.2 Role of MSC in the physiology of BM-cells
22 1.2.3.3 Interaction of MSC and immune cells 22 1.2.3.4 Clinical
applications of MSC 23 1.3 Aberrant hematopoiesis 23 1.3.1 Leukemia stem cells
theory 23 1.3.2 Origin of leukemia cells 24 1.3.3 Leukemia cells and MSC
interaction 26 1.3.3.1 Tumor and MSC / stroma interaction 26 1.3.3. Leukemia
cell niche 26 1.3.3.3 Genetic alterations in tumor-associated stroma cells 28
1.4 Plasticity of stem cells 28 1.5 Aim and outline of the thesis 30 2
MATERIALS AND METHODS 31 2.1 Patients 31 2.2 Isolation and characterization of
MSC 31 2.3 CFU-F assays 32 2.4 Differentiation of MSC 32 2.5 Immunostaining 32
2.6 Metaphase analysis 33 2.7 Fluorescence in situ hybridization 33 2.8 Multi-
color FICTION 34 2.9 Cell lines 34 2.10 Transduction of MSC with the SV40
Large T-antigen 35 2.11 Immunoglobulin gene rearrangements 35 2.12 Sequencing
of the MLL-ENL breakpoint in MSC 36 2.13 Western blot analysis 36 3 RESULTS 37
3.1 Characterization of MSC from childhood ALL patients 37 3.2 Leukemia-
associated genetic alterations in MSC 40 3.3 TEL-AML1 fusion gene 41 3.3.1
Frequency of TEL-AML1 fusion gene in MSC of children with ALL 41 3.3.2
Detection of additional aberrations in MSC from patient 5 43 3.3.3 Frequency
of leukemia-specific IG gene rearrangements in MSC 45 3.3.4 SV40-Tag MSC from
a TEL-AML1+ patient and a healthy donor 48 3.3.4.1 Characterization of
SV40-Tag MSC 48 3.3.4.2 Frequency of TEL-AML1 and additional aberrations in
SV40-Tag MSC 49 3.4 E2A-PBX1 fusion gene 52 3.4.1 Frequency of E2A-PBX1 fusion
gene in MSC of children with ALL 52 3.4.2 Frequency of E2A-PBX1 fusion gene in
SV40-Tag MSC 53 3.5 MLL (11q23) rearrangements 57 3.5.1 Frequency of MLL-ENL
fusion gene in MSC of children with ALL 57 3.5.2 Disease time course of the
male ALL patient 10 with the t(11;21) translocation and analysis of MNC and
MSC 59 4 DISCUSSION 63 4.1 Isolation and characterization of MSC 63 4.2
Leukemia-associated genetic aberrations in MSC 63 4.3 Clonal relationship
between MSC and leukemia cells 64 4.4 Models explaining the presence of
leukemia-associated aberrations in MSC 65 4.5 Cell type specific role of
fusion genes 68 4.6 Presence of additional genetic aberrations in MSC 68 4.7
Final remarks 69 5 ZUSAMMENFASSUNG 70 6 REFERENCES 72 7 APPENDIX 88 8
ABBREVIATIONS 90 9 PUBLICATIONS 92 10 ACKNOWLEDGEMENTS 93
dc.description.abstract
Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most common cancer in childhood. The
disease is caused by malignant immature lymphocytes or their progenitors.
Therapy for children with initial ALL has proven to be quite successful (85%
long-term survival), but the treatment outcome for relapsed ALL remains
unsatisfactory (approximately 40% long-term survival). ALL subtypes can be
classified according to their immunophenotype, morphology and specific genetic
alterations using cytogenetic analysis. These genetic alterations include
structural or numerical chromosome changes such as translocations or
hyperdiploidy, deletions and amplifications. Analysis of the chromosomal
translocations and the resulting fusion genes has improved the understanding
of the biology of leukemia cells (LC). However, as previously suggested, the
understanding of leukemia pathogenesis also requires an extended knowledge of
not only the specific genetic mutations implicated, but also of the cellular
framework, in which they arise, develop and are maintained. The bone marrow
(BM) microenvironment promotes survival and differentiation of hematopoietic
stem cells (HSC) and lymphocytes. The BM contains at least two different types
of progenitor cells, HSC and mesenchymal stem cells (MSC). MSC are able to
differentiate into multiple mesenchymal lineages, including bone, cartilage,
muscle, fat tissue and BM stroma cell. MSC facilitate engraftment of HSC and
seem to persist in the BM after chemotherapy. The plasticity of MSC to
differentiate into cells of the hematopoietic lineage has been demonstrated in
mice. Furthermore, recent studies have demonstrated the reprogramming of
B-cells and other somatic cell types like fibroblasts into pluripotent stem
cells by ectopic expression of defined transcription factors, indicating the
high plasticity of virtually any cell. Therefore, we analyzed MSC from B cell
precursor ALL patients for the presence of leukemia-associated chromosomal
translocations and immunoglobulin (IG) gene rearrangements. Leukemia-specific
IG / T cell receptor (TCR) gene rearrangements and junctional regions are
widely used as clonal leukemic markers for the detection of minimal residual
disease (MRD). Leukemia cells from 10 of 49 patients showed one of the three
translocations namely TEL-AML1, E2A-PBX1 or MLL rearrangement. Leukemia-
associated aberrations were detected in MSC of these 10 ALL patients
independent of the sampling time points. Leukemia-specific IG gene
rearrangements were detected in MSC from 3 of the 8 analyzed patients. These
results suggest a clonal relationship between MSC and leukemia cells.
de
dc.description.abstract
Die akute lymphoblastische Leukämie (ALL) ist die häufigste maligne Erkrankung
im Kindesalter. Die Erkrankung wird durch entartete unreife Lymphozyten oder
ihre Vorläufer verursacht. Die derzeit zur Verfügung stehenden Therapien
erreichen bei Kindern mit Ersterkrankung eine Langzeit-Überlebenssrate von
85%, aber die Heilungsaussichten nach einem Rezidiv liegen bei nur etwa 40%.
ALL-Subtypen werden anhand ihres Immunphänotyps, ihrer Morphologie und ihrer
speziellen genetischen Mutationen klassifiziert. Diese genetischen
Aberrationen beinhalten strukturelle oder numerische Veränderungen der
Chromosomen, wie Translokationen oder Hyperdiploidie, Deletionen und
Amplifikationen. Die Analysen der chromosomalen Translokationen und der daraus
resultierenden Fusionsgenen haben zum besseren Verständnis der Biologie von
Leukämiezellen beigetragen. Das bessere Verständnis der Pathogenese von
Leukämien erfordert nicht nur das erweiterte Wissen über die speziellen
Mutationen, die sie beinhalten, sondern auch über das zelluläre Netzwerk, in
denen diese Mutationen entstehen und sich entwickeln. Das Mikromilieu des
Knochenmarks (KM) fördert Überleben und Differenzierung von hämatopoetischen
Stammzellen (HSZ) und Lymohozyten. Im KM befinden sich zwei verschiedene Typen
von Vorläuferzellen, HSZ und mesenchymale Stammzellen (MSZ). MSZ haben die
Fähigkeit zu verschiedenen Zelltypen aus der mesenchymalen Linie zu
differenzieren, wie etwa zu knochenbildenden Zellen, Muskel- und Fettzellen
sowie KM-Stromazellen. MSZ erleichtern das Anwachsen von transplantierten HSZ
und scheinen auch chemoresistent zu sein. In Mäusen wurde die Fähigkeit von
MSZ auch zu Zellen der hematopoietischen Linie zu differenzieren demonstriert.
Darüber hinaus konnten neuere Studien zeigen, dass reife B-Zellen und andere
somatische Zelltypen wie Fibroblasten zu pluripotenten Stammzellen
reprogrammiert werden können, indem genau definierte Transkriptionsfaktoren in
diesen Zellen exprimiert werden. Folglich zeigen diese Daten, dass fast alle
Zellen eine hohe Plastizität besitzen. Aus diesen Gründen untersuchten wir MSZ
aus Patienten mit B-Zell-Vorläufer-ALL auf das Vorhandensein von
leukämiezellen-assoziierten chromosomalen Aberrationen und Immunglobulin-
Genumlagerungen. Die Produkte der TCR/IG-Genumlagerungen stellen leukämieklon-
spezifische Marker dar, mit denen minimale Resterkrankung (MRD) während der
Behandlung nachgewiesen werden können. Leukämiezellen aus 10 von 49 Patienten
zeigten eine von drei Translokationen, entweder TEL-AML1, E2A-PX1, oder MLL-
Rearrangement. Leukämie-assoziierte Aberrationen wurden in MSZ aus all diesen
10 ALL-Patienten nachgewiesen, unabhängig vom analysierten Zeitpunkt. Des
Weiteren konnten in 3 von 8 Patienten leukämie-assozierte IG-Genumlagerungen
detektiert werden. Diese Ergebnisse weisen auf eine klonale Verwandtschaft
zwischen MSZ und Leukämiezellen hin.
de
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
mesenchymal stem cells
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::500 Naturwissenschaften
dc.title
Leukemia-associated genetic aberrations in mesenchymal stem cells of children
with acute lymphoblastic leukemia
dc.contributor.contact
shabnam.shalapour@charite.de
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. T. Blankenstein
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. A. Pezzutto
dc.date.accepted
2010-02-15
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000016233-5
dc.title.translated
Leukämieassoziierte genetische Aberrationen in mesenchymalen Stammzellen von
Kindern mit akuter lymphoblastischer Leukämie
de
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000016233
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000007196
dcterms.accessRights.dnb
free
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open access