dc.contributor.author
Hofheinz, Katharina
dc.date.accessioned
2018-06-07T22:09:02Z
dc.date.available
2014-01-17T12:28:18.686Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/8923
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-13122
dc.description.abstract
Lipoxygenasen (LOXn) sind Fettsäuredioxygenasen, die in der Pathogenese
entzündlicher und hyperproliferativer Erkrankungen eine wichtige Rolle
spielen. Sie zeichnen sich durch eine hohe Reaktionsspezifität aus, die für
die biologische Wirkung der Enzyme bedeutsam ist. Die Kristallstruktur der
meisten LOXn belegt, dass sie aus einer kleinen N-terminalen Domäne und einer
großen C-terminalen Domäne bestehen. Trotz der umfangreichen Strukturdaten ist
die mechanistische Basis der Reaktionsspezifität von LOXn und die Funktion
ihrer N-terminalen Domäne noch nicht völlig geklärt. Während die
Volumenhypothese der Reaktionsspezifität davon ausgeht, dass die Eindringtiefe
der Arachidonsäure ins aktive Zentrum die Positionsspezifität bestimmt,
postuliert die Orientierungshypothese, dass dies von der Ausrichtung des
Substrats am aktiven Zentrum abhängt, wobei alternativ das Methyl- oder das
Carboxylende der Fettsäure in die Substratbindetasche eintaucht. In dieser
Arbeit wurden die humane und die murine 5-LOX als rekombinante Enzyme in E.
coli exprimiert und ihre katalytischen Eigenschaften charakterisiert.
Anschließend wurden durch ortsgerichtete Mutagenese verschiedene
Enzymvarianten erzeugt, um festzustellen, welche Theorie zur
Reaktionsspezifität auf diese LOXn anwendbar ist. Die hier erhaltenen Daten
belegen die Anwendbarkeit der Volumenhypothese auf 5- LOXn. Durch konsekutive
Mutation kritischer Aminosäuren gelang es, die murine 5-LOX schrittweise in
ein 15-lipoxygenierendes Enzym umzuwandeln. Obwohl die Validität der
Orientierungshypothese nicht ausgeschlossen wurde, konnten keinerlei Daten
erhoben werden, welche die Anwendbarkeit dieser Hypothese wahrscheinlich
machen. Weitergehende Untersuchungen ergaben die eingeschränkte Anwendbarkeit
des G-vs- A-Konzepts für die Enantioselektivität der murinen 5-LOX. Frühere
Trunkationsexperimente an der humanen 5-LOX deuteten darauf hin, dass die
N-terminale Domäne für die katalytische Aktivität dieses Enzyms unverzichtbar
sei. Hier konnte jedoch gezeigt werden, dass gentechnische Trunkation der
murinen 5-LOX zu einer katalytisch aktiven Enzymspezies führt, die trotz
eingeschränkter katalytischer Aktivität eine unveränderte Positionsspezifität
zeigt. Diese Daten deuten auf eine regulatorische Funktion der N-terminalen
Enzymdomäne im Katalysemechanismus hin.
de
dc.description.abstract
Lipoxygenases are dioxygenases, which play an important role in the
pathogenesis of inflammatory and hyperproliferative diseases.They are
characterised by high reaction specificity that is significant for their
biological effect. The crystal structure of most LOXs shows that they consist
of a small N-terminal ß-barrel domain and a larger mostly helical catalytic
domain. Despite the existence of this data, the mechanical background of the
reaction specificity and the function of the N-terminal ß-barrel domain remain
unclear. Two hypotheses illustrating the mechanistic differences between
arachidonic acid 5- and 15-lipoxygenation exist. The space-hypothesis states
that the volume of the substrate-binding pocket determines it's positional-
specificity. On the other hand the orientation hypothesis states that the
alignment of the arachidonic acid is a critical factor. There is also the
possibility that arachidonic acid enters the substrate-binding pocket either
with the methyl terminus first or with its carboxyl group. To test the
applicability of these two hypotheses, mouse Alox5 was expressed in
Escherichia coli and its catalytic activity was characterised. Afterwards
variants of the enzyme were created by site-directed mutagenesis. The obtained
data prove the applicability of the space-hypothesis on mouse Alox5.
Consecutive mutations of critical aminoacids led to the formation of a
15-lipoxygenating enzyme from a 5-lipoxygenating enzyme. The validity of the
orientation hypothesis couldn't be expulsed nor proved. Further experiments
demonstrated the limited applicability of the G-vs-A-concept of
enantioselectivity for mouse Alox5. Former truncation experiments of the human
5-LOX indicated that the N-terminal ß-barrel domain is essential for the
funcion of this enzyme. Here it could be shown that truncation of murine Alox5
leads to an enzyme with reduced catalytic activity, but unaltered positional-
specificity. This data indicates a regulatory function of the N-terminal
domain.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
5-lipoxygenase
dc.subject
reaction specificity
dc.subject
space based hypothesis
dc.subject
orientation based hypothesis
dc.subject
membrane binding
dc.subject
N-terminal domain
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Untersuchungen zur strukturellen Basis der Reaktionsspezifität von
5-Lipoxygenasen und deren biologische Bedeutung
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. sc. med. H. Kühn
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. D. Steinhilber, Priv.-Doz. Dr. M. Hersberger
dc.date.accepted
2014-02-14
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000095154-0
dc.title.translated
Analysis of the structural basis of reaction specificity of 5-lipoxygenases
and their biological importance
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000095154
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000014062
dcterms.accessRights.dnb
free
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open access