dc.contributor.author
Pepperle, Barbara
dc.date.accessioned
2018-06-07T21:44:31Z
dc.date.available
2002-04-23T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/8363
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-12562
dc.description
Kapitel Seite
Titelblatt und Inhaltsverzeichnis
1 Einleitung 1
1.1 Proteinkinase A (PKA) und protein kinase A anchoring proteins (AKAPs) 1
1.2 Die Vasopressin-vermittelte Wasserrückresorption im Sammelrohr der Niere
14
1.3 Zielstellung dieser Arbeit 16
2
Material und Methoden 17
2.1 Material 17
2.2 Methoden 31
3 Ergebnisse 78
3.1 Sequenzanalyse des Klons 2.1 78
3.2 Untersuchung der gewebespezifischen Expression der mRNA von rHt31 82
3.3 Kartierung der RII-Bindungsdomäne 84
3.4 Charakterisierung einer zweiten RII-Bindungsdomäne in rHt31 90
3.5 Nachweis einer potentiellen RII-Bindungsdomäne in hBrx 98
3.6 Herstellung von hBrx-Deletionsmutanten für Strukturanalysen 101
3.7 Expressions-Screening einer Rattennieren-cDNA-Bibliothek mit rHt31 104
3.8
Untersuchung der zell- und gewebespezifischen Expression von rHt31, hHt31 und
hBrx 108
3.9
Immunoblot und RII-overlay mit subzellulären Fraktionen von ZR-75-1-Zellen 118
3.10 Analyse der genomischen Struktur von rHt31/hHt31, hBrx und Proto-Lbc 120
3.11 Immunoblot mit dem anti-hHt31-Antikörper 3060 124
4 Diskussion 127
4.1 Charakterisierung des inserts von Klon 2.1 (rHt31) 127
4.2 Kartierung der RII-Bindungsdomäne in rHt31 128
4.3 Eine weitere RII-Bindungsdomäne befindet sich im C-Terminus von rHt31 129
4.4 hBrx als potentielles AKAP 131
4.5 Untersuchung der mRNA-Expression von rHt31 133
4.6
Die subzelluläre Verteilung von rHt31, hHt31 und hBrx in verschiedenen Geweben
und Zellinien 134
4.7 hHt31/rHt31, hBrx und Proto-Lbc sind Spleißvarianten eines Gens 136
5 Zusammenfassung
139
6 Zusammenfassung und Literaturverzeichnis
141
7 Anhang
151
dc.description.abstract
Bei dem Screening einer Rattennieren-cDNA-Bibliothek zur Identifizierung von
protein kinase A anchoring proteins (AKAPs), die potentiell an der
Vasopressin-vermittelten Wasserrückresorption im Sammelrohr der Niere
beteiligt sind, wurde der Partialklon 2.1 isoliert. Es handelt sich um das
Rattenorthologe (rHt31 1-576) des humanen AKAP hHt31, dessen vollständige
cDNA-Sequenz bisher noch nicht ermittelt wurde (Carr et al. 1992a). Die der
klassischen RII-Bindungsdomäne von hHt31 entsprechende Bindungsdomäne von
rHt31 befindet sich im Bereich der Aminosäuren 65-78. Eine zweite, niedrig
affine RII-Bindungsdomäne befindet sich im Bereich der Aminosäuren 470-576.
Durch eine Kombination von Datenbankanalysen und RACE-PCR konnte die
publizierte cDNA-Sequenz von hHt31 (3045 bp) experimentell um insgesamt 5287
bp verlängert werden. Diese Sequenz enthält die Basenpaare 10-4290 des humanen
breast cancer nuclear receptor-binding auxillary protein (hBrx) und des lbc
(lymphoid blast crisis)-Protoonkogens Proto-Lbc. Bei diesen zur Familie der
Dbl-Onkogene gehörenden Proteinen hBrx und Proto-Lbc, dessen Sequenz dem
C-Terminus von hBrx entspricht, handelt es sich daher um kürzere
Spleißvarianten von hHt31. Das hHt31-Gen befindet sich auf dem Chromosom 15,
inzwischen konntest die Sequenz des Nach Abschluß der experimentellen Arbeiten
konnte auch der Translationsstart von hHt31 ermittelt werden, dieser liegt 110
bp vor dem 5`-Ende dereigtIn dieser 8332 bp-langen Sequenz ist der
Translationsstart noch nicht enthalten. Die Basenpaare 1-2149 zeigen keine
Homologie zu bekannten Sequenzen in der Datenbank, Basenpaare 2150-5194
entsprechen der publizierten Sequenz von hHt31. Basenpaare 4052-8332 sind mit
der Sequenz des humanen breast cancer nuclear receptor-binding auxillary
protein (hBrx 10-4290) identisch. Bei den zur Familie der Dbl-Onkogene
gehörenden Proteinen hBrx und Proto-Lbc, dessen Sequenz dem C-Terminus von
hBrx entspricht, handelt es sich daher um kürzere Spleißvarianten von hHt31.
Alle drei Proteine (hHt31, hBrx und Proto-Lbc) werden von einem Gen auf
Chromosom 15 kodiert, welches 38 Exons enthält. Mit einem Antikörper, der
sowohl rHt31/hHt31 als auch hBrx erkennt, wurden in verschiedenen Geweben und
Zellinien immunreaktive Proteine unterschiedlicher Größe detektiert. Dies
deutet auf die Existenz weiterer Spleißvarianten hin. Immunreaktive Proteine
wurden sowohl in den löslichen Zellfraktionen als auch in den partikulären und
in den Kernfraktionen nachgewiesen. In den Brustkrebszellinien ZR-75-1 und
MCF-7 wurde in allen Fraktionen ein immunreaktives Protein im hochmolekularen
Bereich (ca. 300-400 kDa) detektiert, bei dem es sich wahrscheinlich um hHt31
handelt. Die Existenz einer aufgrund der Sequenz postulierten RII-
Bindungsdomäne in hBrx konnte für die Deletionsmutante hBrx 84-378
experimentell nicht sicher nachgewiesen werden. Allerdings hat ein ca. 170
kDa-Protein in der partikulären Fraktion der ZR?75?1-Zellen, bei dem es sich
wahrscheinlich um hBrx handelt, im RII-overlay die RII-Untereinheiten
gebunden. Sowohl hHt31 als auch bei Nachweis einer RI/RII-Bindungsdomäne die
kürzere Spleißvariante hBrx können zu den multifunktionellen Adaptorproteinen
gezählt werden, welche über verschiedene Effektoren eine Vielzahl
transmembranäre und intrazelluläre Signaltransduktionsprozesse regulieren.
de
dc.description.abstract
In an attempt to isolate protein kinase A anchoring proteins (AKAPs) involved
in vasopressin-mediated water reabsorption a partial cDNA clone with an open
reading frame of 582 amino acids (rHt31 (GenBank accession number AF387102)
and 67,7 % identity to the human AKAP hHt31 was isolated. One RII binding site
was mapped to amino acid residues 65-78; a second binding site with lower RII
affinity was mapped to amino acid residues 470-576. The complete cDNA sequence
of hHt31 was determined by a combination of RACE-PCR experiments and data base
analysis. The hHt31 cDNA includes the estrogen receptor cofactor hBrx and the
RhoA GDP/GTP exchange factor proto lymphoid blast crisis (Lbc) sequences. The
human Ht31 gene was assigned to chromosome 15 (region q24-25). It consists of
36 exons and encodes hHt31 and the smaller splice variants hBrx and proto-Lbc.
A rHt31-specific probe detected in heart, skeletal muscle and renal inner
medulla mRNA transcripts of 9 kb and > 9.5 kb. The mRNA species of > 9.5 kb
may encode the rHt31 protein. An antibody directed against a common epitope in
rHt31, hHt31 and hBrx detects in the human mammary carcinoma cell lines ZR75-1
and MCF7 a protein of about 300-400 kDa, which may represent the full length
Ht31 protein. In various human tissues and cell lines the antibody detected
several proteins (60 - > 200 kDa) in the soluble and particulate fractions,
indicating the presence of multiple splice variants in different subcellular
fractions. Ht31 and its splice variants may represent a new type of
multivalent scaffold proteins, which may regulate various signal transduction
pathways.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Protein kinase A anchoring protein
dc.subject
RII-binding site
dc.subject
Rho GTPase guanine nucleotide exchange factor
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Die Klonierung und Charakterisierung des protein kinase A anchoring protein
r(rat)Ht31 aus der Rattenniere
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Walter Rosenthal
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Burghardt Wittig
dc.date.accepted
2002-05-17
dc.date.embargoEnd
2002-05-16
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2002000815
dc.title.translated
Cloning and characterization of the protein kinase A anchoring protein
r(rat)Ht31 from rat kidney
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000000654
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2002/81/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000000654
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access