dc.contributor.author
Droescher, Mathias
dc.date.accessioned
2018-06-07T21:19:45Z
dc.date.available
2012-01-30T10:12:10.958Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/7727
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-11926
dc.description
Inhaltsverzeichnis Abkürzungen
..................................................................................................................
1 1\. Einleitung
....................................................................................................................
4 1.1 Die zelluläre Kommunikation durch Zytokine und Interferone
................................ 4 1.2 Der JAK/STAT Signalweg
........................................................................................
5 1.3 Die Familie der STAT-Transkriptionsfaktoren
......................................................... 7 1.3.1 Der
Transkriptionsfaktor STAT1
..................................................................... 9 1.4
Die SUMO-Modifikation von Proteinen
................................................................... 12 1.4.1
SUMO-Modifikation von STAT1
.................................................................... 16 1.5
Fragestellung
.............................................................................................................
19 2\. Material
.......................................................................................................................
20 2.1 Chemikalien
..............................................................................................................
20 2.2 Puffer, Lösungen und Medien
..................................................................................
20 2.3 Antikörper
.................................................................................................................
20 2.4 Proteine und Enzyme
................................................................................................
21 2.5 Plasmide
....................................................................................................................
22 2.6 Oligo-Nukleotide
......................................................................................................
22 2.7 Bakterien
...................................................................................................................
24 2.8 Zell-Linien
................................................................................................................
24 3\. Methoden
....................................................................................................................
25 3.1 Molekularbiologische Methoden
..............................................................................
25 3.1.1 Herstellung von chemisch kompetenten Bakterien
......................................... 25 3.1.2 Hitzeschock-Transformation
von DNS in kompetente Bakterien ................... 25 3.1.3 Gewinnung
rekombinanter DNS aus transformierten Bakterien ..................... 26 3.1.4
Auftrennung und Konzentrationsbestimmung von DNS
................................. 26 3.1.5 DNS-Sequenzierung
........................................................................................
27 3.1.6 Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
.................................................................. 27 3.1.7
Einführen von Punktmutationen in Plasmide (Mutagenese)
............................ 28 3.1.8 Restriktionsverdau von DNS
........................................................................... 28
3.1.9 Ligation von DNS-Fragmenten
........................................................................ 28
3.1.10 Klonierung von STAT1-Expressionsplasmiden
............................................ 29 3.1.11 Gewinnung und
Genotypisierung genomischer DNS .................................... 29 3.1.12
Identifizierung transgener Stammzell-Kolonien
........................................... 30 3.2 Biochemische Methoden
...........................................................................................
31 3.2.1 SDS-Polyacrylamid-Gelelektrophorese (SDS-PAGE)
.................................... 31 3.2.2 Western-Blot und immunchemischer
Nachweis von Proteinen ...................... 32 3.2.3 Herstellung von
Zellextrakten
......................................................................... 33
3.2.4 Affinitäts-Anreicherung von His-SUMO1 modifizierten Proteinen
............... 33 3.2.5 Dephosphorylierungs-Kinetik von STAT-Proteinen
....................................... 34 3.2.6 Immunpräzipitation (IP)
..................................................................................
34 3.2.7 In vitro Sumolierung und Monomer-Austausch-Reaktion
.............................. 35 3.2.8 Immunozytochemie
.........................................................................................
36 3.2.9 Fluoreszenz-Mikroskopie
................................................................................
37 3.2.10 Transmissions-Elektronenmikroskopie (TEM)
............................................. 37 3.2.11 Reportergen-Analyse
.....................................................................................
38 3.3 Zellbiologische Methoden
........................................................................................
39 3.3.1 Kultivierung und Behandlung von Säugerzellen
............................................. 39 3.3.2 Transfektion von
Säugerzellen
........................................................................ 40
3.3.3 Behandlung von Zellen mit Zytokinen und Inhibitoren
.................................. 40 3.3.4 Gewinnung primärer embryonaler
Maus-Fibroblasten (MEF) ....................... 40 3.3.5 Gewinnung von
Knochenmarks-Makrophagen ............................................... 41
3.3.6 Induktion systemischer bakterieller Infektion in Mäusen
............................... 41 3.3.7 IFNγ-vermittelte Zytotoxizitäts-
Analyse von Knochenmarks-Makrophagen . 42 3.3.8 Kultivierung und Behandlung
von embryonalen Maus-Stammzellen ............ 43 4\. Resultate
.....................................................................................................................
45 4.1 Die SUMO-Modifikation reduziert die Tyr701-Phosphorylierung von
STAT1......... 45 4.1.1 Die Generierung einer für die Lys703-Sumolierung
spezifischen STAT1-Mutante
.......................................................................................................
45 4.1.2 Die strukturelle Integrität der Tyr701-Phosphorylierungsstelle wird
durch die STAT1-Mutation E705Q nicht beeinträchtigt
............................................................ 48 4.2 Die
Lys703-Sumolierung verändert die subzelluläre Verteilung von STAT1 ...........
50 4.2.1 SUMO-freies STAT1 lokalisiert in Zytokin-induzierten nukleären
Partikeln . 50 4.2.2 Die subzelluläre Verteilung von STAT3 gleicht der von
SUMO-freiem STAT1
......................................................................................................................
56 4.2.3 Nukleäre STAT-Partikeln besitzen eine parakristalline Ultrastruktur
............ 59 4.3 Die Lys703-Sumolierung verhindert die Polymerisierung und
Parakristallbildung von STAT1
.....................................................................................................................
64 4.3.1 Die Polymerisierung phosphorylierter STAT1-Dimere führt zu
Parakristallen
.............................................................................................................
64 4.3.2 Auch die erzwungene Sumolierung von STAT3 verhindert die
Parakristallbildung
....................................................................................................
71 4.3.3 Die Auflösung von Parakristallen erfordert die Sumolierungs-abhängige
Blockierung der Tyr701-Phosphorylierung
................................................................ 73 4.3.4 Die
Lys703-Sumolierung induzierte Reduktion der Tyr701-Phosphorylierung ist
notwendig, aber nicht ausreichend für die Auflösung von STAT1-Parakristallen
77 4.3.5 Die Sumolierung fördert die Bildung von semi-phosphorylierten
STAT1-Dimeren
........................................................................................................
80 4.3.6 Die Bildung von STAT1-Parakristallen wird über die Sumolierungs-
abhängige Bildung von semi-phosphorylierten STAT1-Dimeren verhindert
.......... 87 4.4 Parakristalle verlängern die Dauer der Zytokin-induzierten
STAT-Aktivierung ..... 90 4.4.1 Parakristalle schützen STAT-Proteine vor der
Dephosphorylierung ............... 91 4.4.2 Parakristalle puffern die
Konzentration von aktiviertem STAT1 im Nukleoplasma
...........................................................................................................
95 4.4.3 Die Sumolierung reduziert die transkriptionelle Aktivität von STAT-
Proteinen
........................................................................................................
98 4.5 Physiologische Relevanz der STAT1-Sumolierung im transgenen Tier-Modell
..... 100 4.5.1 Generierung einer transgenen Maus, welche SUMO-freies
STAT1-E705Q unter der Kontrolle des endogenen STAT1-Promotors exprimiert
.......................... 100 4.5.2 Die Sumolierung von STAT1 reduziert die
Sensitivität von Knochenmarks-Makrophagen gegenüber IFN
........................................................ 104 5\. Diskussion
..................................................................................................................
111 5.1 Die SUMO-Modifikation reduziert die Tyr701-Phosphorylierung von STAT1
........ 111 5.2 Aktiviertes STAT lokalisiert in nukleären Parakristallen
........................................ 113 5.3 Die Polymerisierung
phosphorylierter STAT1-Dimere führt zu Parakristallen ....... 114 5.4 Die
Lys703-Sumolierung verhindert die Polymerisierung von STAT1
..................... 116 5.5 Die Sumolierung als Modulator der Löslichkeit
von Proteinen ............................... 119 5.6 Die physiologische
Bedeutung von STAT-Parakristallen und ihrer Verhinderung durch die Sumolierung
....................................................................................................
120 6\. Zusammenfassung
...................................................................................................
125 6.1 Summary
..................................................................................................................
126 7\. Literaturverzeichnis
...............................................................................................
127 8\. Anhang
........................................................................................................................
144 8.1 Die Sequenzierung der genomischen STAT1-DNS des Haushuhns
........................ 144 8.2 Veröffentlichungsnachweise
....................................................................................
145 8.3 Lebenslauf
................................................................................................................
146 8.4 Danksagung
..............................................................................................................
147 8.5 Eidesstattliche Erklärung
..........................................................................................
148
dc.description.abstract
Die Regulation von STAT-Transkriptionsfaktoren ist für die Funktion von Zellen
von zentraler Bedeutung, und die Fehlfunktion dieser Proteine ist oft mit
schwerwiegenden Erkrankungen verbunden. Die STATs sind dimere Proteine, deren
transkriptionelle Aktivität die Phosphorylierung eines konservierten
Tyrosinrestes erfordert. In dieser Arbeit wird gezeigt, dass vollständig
Tyrosin-phosphorylierte STAT-Dimere über reziproke pTyr-SH2-Domänen-
Interaktionen polymerisieren können. Diese Polymerisierung ist die Grundlage
für die Bildung von Parakristallen, einer hochgeordneten Proteinstruktur in
den Zellkernen Zytokin-stimulierter Zellen. Parakristalle sind dynamische
Reservoire für aktiviertes STAT-Protein, welche dieses vor der
Dephosphorylierung schützen. Der Transkriptionsfaktor STAT3 bildet
Parakristalle während der Akute-Phase Reaktion in Maus-Leberzellen. Aber auch
STAT2 und STAT5 bilden Zytokin-abhängig nukleäre Partikel, die vermutlich
Parakristalle darstellen. Im Gegensatz dazu verteilt sich phosphoryliertes
STAT1 homogen im Zellkern und bildet keine Parakristalle. In dieser Arbeit
konnte gezeigt werden, dass dieses Verhalten durch die unter den STAT-
Proteinen einzigartige SUMO-Modifikation von STAT1 hervorgerufen wird. Die
Lys703-Sumolierung hat einen direkten Effekt: durch die Blockierung der
proximalen Tyr701-Phosphorylierung wird in der Zelle die Anzahl an semi-
phosphorylierten STAT1-Dimeren erhöht. Diese stehen in Konkurrenz zu
vollständig phosphorylierten STAT1-Dimeren und verhindern dadurch die
Polymerisierung und Parakristall-Bildung von STAT1. Darauf basierend wird ein
allgemeines Kompetitions-Modell vorgeschlagen, welches die Regulation der
Protein-Löslichkeit durch eine unverhältnismäßig kleine Fraktion an
sumolierten Molekülen beschreibt. Dieses stellt gleichzeitig die erste Lösung
für das sogenannte „SUMO-Enigma“ dar. Im Fall von STAT1 führt die Sumolierung
zu einer erhöhten Löslichkeit des Tyr701-phosphorylierten STAT1 und dessen
beschleunigter Dephosphorylierung, wodurch gleichfalls die Menge von
aktiviertem STAT1 reduziert wird. In dieser Arbeit wird zudem die Herstellung
eines Knock-in Mausstammes beschrieben, welcher SUMO-freies STAT1 exprimiert.
Makrophagen aus diesen Tieren zeigen, dass die Sumolierung von STAT1 die IFNγ-
Sensitivität von Zellen dauerhaft herabsetzt. Bislang war ein solcher
Mechanismus nicht bekannt. Durch die Ergebnisse dieser Arbeit konnte die SUMO-
Modifikation von STAT1 als ein zentraler Mechanismus der Interferon-
Signaltransduktion identifiziert werden.
de
dc.description.abstract
STAT proteins are an essential component of the immune response of cells and
their misregulation is often associated with severe diseases. In order to
elicit transcriptional activity, the dimeric STAT proteins require activation
by phosphorylation of a single tyrosine residue. In this work, it is revealed
that fully tyrosine-phosphorylated STAT dimers can polymerize via reciprocal
pTyr-SH2 domain interactions. This polymerization leads to the assembly of
paracrystals, a highly ordered protein structure in the nucleus of cytokine
stimulated cells. Paracrystals are dynamic reservoirs which protect activated
STATs from dephosphorylation. STAT3 readily forms such paracrystals in acute
phase liver cells. But also STAT2 and STAT5 form cytokine-dependent nuclear
particles which are most likely paracrystals. Activated STAT1, in contrast,
distributes homogenously in the nucleus and normally does not form
paracrystals. Here, it is shown that this is due to the unique ability of
STAT1 among the STATs to conjugate to SUMO1. The Lys703 sumoylation has one
direct effect: it obstructs proximal Tyr701 phosphorylation, which leads to an
increase in the abundance of semi-phosphorylated STAT1 dimers. These in turn
compete with their fully phosphorylated counterparts and interfere with their
polymerization into paracrystals. Based on these results, a generally
applicable competition model is proposed which describes the regulation of
protein solubility by a disproportionate small fraction of SUMO-modified
molecules. This also constitutes the first solution to the so called “SUMO-
Enigma”. In case of STAT1, the sumoylation leads to increased solubility of
the activated STAT1 and thereby to an accelerated dephosphorylation kinetics
thus diminishing the pool of the transcriptionally available STAT1. Moreover,
in this work the generation of a knock-in mice strain expressing SUMO-free
STAT1 is described. Using macrophages from these animals, it was demonstrated
that the sumoylation of STAT1 constitutively reduced the IFNγ-sensitivity of
cells. Such a mechanism was not known so far. Therefore this work identifies
the SUMO modification of STAT1 as a central instrument of interferon
signalling.
en
dc.format.extent
V, 148 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie
dc.title
Die Entdeckung Zytokin-induzierter STAT-Protein-Parakristalle
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Uwe Vinkemeier
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Volker Haucke
dc.date.accepted
2011-10-25
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000034407-9
dc.title.subtitle
Regulation ihrer Löslichkeit durch SUMO und ihr Einfluss auf die IFNγ-
Sensitivität von Zellen
dc.title.translated
The discovery of cytokine-induced STAT paracrystals
en
dc.title.translatedsubtitle
Their solubility regulation by SUMO and a mechanism to protect cells from
hyperresponsiveness to IFNg
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000034407
refubium.mycore.derivateId
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open access