dc.contributor.author
Pussak, Daniel
dc.date.accessioned
2018-06-07T21:14:27Z
dc.date.available
2014-09-12T07:49:05.537Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/7596
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-11795
dc.description.abstract
Cells interact with their environment via their surface. Therefore, cell
surfaces play a crucial role in cellular processes such as signaling,
communication, viral infections and adhesion. Every process on the cell
surface relies on molecular forces that are a complex interplay of chemical,
biological and physical interactions. Those interfacial interactions are
mediated by ligands and receptors and are the basis of the commonly known
‘lock and key principle’ that controls cellular behavior. However, the exact
mechanisms of such binding interactions at interfaces are not fully understood
yet. This is especially true for ligand-receptor interactions at soft surfaces
that are based on sugar ligand and protein receptor recognition. Sugar ligands
are abundant on every cell as part of the glycocalyx and take part in cell-
cell interactions such as tissue growth or viral infections although sugar
ligands have only low affinities towards receptors. Nature overcomes this
problem by using multivalency – the presentation of multiple low affinity
sugar ligands e.g. anchored to a cell membrane that then leads to a stronger,
since multivalent binding event. Understanding the interactions of sugar
ligand modified surfaces is not only relevant in biology and medicine but can
also help to use sugar ligand modification in material sciences to create e.g.
novel tissue scaffolds or antiviral coatings. Therefore, it is the broad aim
of this thesis to construct a robust experimental platform to precisely
measure surface interactions focusing on carbohydrate mediated interactions
and to elucidate the structural and physiochemical parameters that affect
those interactions at interfaces. As main parameter the adhesion between a
presenting carbohydrate ligand surface and protein receptors surface is
determined. There are several methods, like atomic force microscopy (AFM) or
surface plasmon resonance (SPR) that are suitable to quantify adhesion.
However, they require a high level of technical knowledge, rather expensive
equipment and most importantly do not allow for the straightforward variation
of the physicochemical properties of the investigated surfaces e.g. a
controlled change in mechanical properties. Therefore this work uses a novel
approach via soft, hydrogel based probes to detect carbohydrate interactions.
In the first part, the synthesis of soft colloidal probes suitable for
adhesion measurements will be presented. These soft colloidal probes are based
on a biocompatible PEG scaffolds in order to reduce non-specific interactions
and allow for surface functionalization. A surfactant free synthesis of PEG
microparticles using kosmotropic electrolytes to salt out PEG in an aqueous
solution was performed. In order to use the hydrogel probes for the analysis
of interfacial interactions, in the second part radical surface chemistry was
introduced by using benzophenone as the photoinitiator to graft polymerizable
monomers to the SCPs. With this highly versatile method, various
functionalities such as carboxy or amine groups can be directly introduced
into the PEG network. The obtained SCPs were further modified with more
complex structures such as sugars or peptides and then tested for their use as
SCPs in adhesion measurements. In the third part, the differently
functionalized SCPs were used to measure adhesion forces by Reflection
Interference Contrast Microscopy (RICM). RICM is a simple method based on
contact mechanics theory (JKR theory) which correlates the adhesion induced
elastic deformation of the SCPs directly to their surface energy. Special
focus was devoted to the measurement of sugar/lectin mediated adhesion. As a
model system; the well known interaction between mannose and ConA was
evaluated. Here the influence of the elasticity of the SCP, the surface bound
ligand concentration and the type of grafting chemistry, was evaluated in
terms of changes in the adhesion process. Then, the inhibition of the
previously characterized direct binding of mannose/ConA with different
monosaccharides was evaluated. Therefore, a new inhibition/competition assay
based on the adhesion induced elastic deformation of the SCPs was developed.
This method allowed for inhibition measurements and give fast and
straightforward access to relative affinities of a variety of sugar ligands.
In addition, more complex molecules like multivalent glycooligomers were used
as inhibitors and screened for their relative affinities, thereby analyzing
the role of multivalent ligands and their surface interactions. Finally, the
combination of RICM with AFM is presented as a new technique to measure first
adhesion forces between receptor-modified surfaces and the SCPs under
variation of loading rate, loading forces as well as the contact time. In the
same time the contact area of the adhering object can be detected. The use of
such ligand modified hydrogels as force probes is supposed to mimic the
physiological situation, where the soft hydrogel-like glycocalyx interacts
with cell receptors. Secondly it allowed studying the ability of multivalent
carbohydrates to remain bound to the receptor surface upon forced contact and
competition with a ligand presenting SCP. Different ligands such as mannose or
multivalent glycooligomers were used as inhibitors and screened for their
inhibitory potential. In general, a new method based on PEG SCPs was developed
that is suitable for the measurement of adhesion with high sensitivity
allowing the detection of very weak biological interactions. On the one hand,
physiochemical influences can be studied by measuring direct binding between
ligands on the probes and receptors on a surface. On the other hand, stepwise
inhibition of these interactions with an analyte permits the performance of an
inhibition/competition assay. Thus, IC50 values suitable for determining
relative affinities of molecules towards their binding to the corresponding
receptors can be evaluated. Based on those adhesion measurement techniques,
kinetics can be measured by combining them with AFM. Therefore, more sensitive
measurements are achieved which additionally allow the measurement of forces
between these two bodies. Future work will focus on expanding the techniques
to further ligand/receptor pairs and to develop for high throughput screenings
as a new method to determine ligand affinities. Moreover, the application of
the hydrogel probes as extracellular matrix model will be tested for direct
cell interaction studies via AFM.
de
dc.description.abstract
Durch die spezifische Wechselwirkungen an der Zelloberflächen werden viele
biologischer Funktionen gesteuert. Beispielhaft hierfür ist die
Signaltransduktion, die Adhäsion zweier Zellen oder das Anhaften eines Virus
an die Zelloberfläche. Diesen Prozessen liegt die Bindung von Liganden und
Rezeptoren an der Zelloberfläche zugrunde. Die strukturelle Komplexität der
Bindungspartner und ermöglicht eine sehr selektive Ausbildung von Bindungen
und die Steuerung einer erstaunlichen Vielzahl von Prozessen nach dem
sogenannten Schlüssel Schloss Prinzip. Die Mechanismen solcher
Bindungswechselwirkungen an Oberflächen und die physikalisch-chemischen
Einflüsse der Membran sind dabei nicht vollständig bekannt. Dies gilt
insbesondere für die Ligand/Rezeptor-Wechselwirkungen auf weichen, flexiblen
Oberflächen wie der Zellmembran oder der Glykokalyx. Die Zell-Glykokalyx ist
eine Kohlenhydrat-reiche Schicht, die jede eukaryotische Zelle umschließt. Die
spezifischen Wechselwirkungen zwischen den Zuckerliganden der Glykokalyx und
Proteinrezeptoren sind ein wichtiger Teil der Erkennungsprozesse von Zellen.
Dies ist insofern erstaunlich, da Zuckerliganden nur eine geringe
Bindungsaffinität zu ihren Rezeptoren zeigen. Die Natur löst das Problem der
geringen Affinität durch Multivalenz – dabei werden mehrere Zuckerliganden mit
ihrer geringen Affinität präsentiert, z.B. verankert an einer Zellmembran, die
dann zu einem stärkeren, da mehrwertigen, Bindungsereignis führt. Das
Verständnis von der Wechselwirkung von Zuckerligand modifizierten Oberflächen
ist nicht nur in der Biologie und Medizin relevant, sondern wird auch in den
Materialwissenschaften angewendet, um z.B. Gewebegerüste oder antivirale
Beschichtungen herzustellen. Deshalb ist es das Ziel dieser Arbeit eine
robuste Plattform für die Quantifizierung von schwachen Wechselwirkungen
zwischen weichen Oberflächen zu schaffen, um insbesondere zuckergesteuerte
Wechselwirkungen zu analysieren zu können. Dabei sollen die strukturellen und
physikalisch chemischen Parameter aufgeklärt werden, die diese
Wechselwirkungen beeinflussen können, z.B. die Weichheit der Oberfläche oder
Dichte der Zuckerliganden. Der zentrale Messparameter bei dem entwickelten
Prinzip, ist die Adhäsion, die zwischen einer Zucker- und Rezeptoroberfläche
wirkt. Es gibt mehrere Verfahren, wie die Rasterkraftmikroskopie (AFM) oder
Oberflächenplasmonresonanz (SPR), die geeignet sind, um spezifische zwischen
Biomolekülen Adhäsion zu quantifizieren. Allerdings erfordern sie ein hohes
Maß an technischem Wissen, teuren Ausrüstungen. Zudem erlauben sie nicht die
einfache Variation von physikalisch-chemischen Eigenschaften der zu
untersuchenden Objekte z.B. eine gezielte Änderung der mechanischen
Eigenschaften der bindenden Oberflächen. In dieser Arbeit wird eine neue
Methode präsentiert, welche weiche Hydrogelsonden (SCPs, soft colloidal
probes) für die Adhäsionsmessungen verwendet. Im ersten Teil dieser Arbeit
wird die Synthese dieser weichen Hydrogelsonden beschrieben. Dabei wird
Poly(ethylenglykol) (PEG) als Hydrogelmaterial verwendet, da es unspezifische
Wechselwirkungen reduziert und somit die Spezifität der Adhäsionsmessung
erhöht. Die Synthese der Sonden erfolgt durch das Ausfällen von PEG aus einer
kosmotropen Salzlösung. Um die Hydrogelsonden für Adhäsionsmessungen nutzen zu
können, wird im zweiten Abschnitt die PEG Oberfläche mittels radikalischer
Oberflächenchemie durch Verwendung von Benzophenon funktionalisiert. Dabei
entstehen Radikale am PEG Gerüst, die das Graften von polymerisierbaren
Molekülen ans PEG ermöglichen. Mit dieser Methode lassen sich eine Vielzahl an
funktionellen Gruppen wie Carboxyl- oder Amingruppen an die PEG Sonden
addieren. Diese funktionellen Gruppen können dann genutzt werden um komplexere
Moleküle wie Zucker oder Peptide an die Sonden zu binden. Im dritten Teil der
Arbeit werden Adhäsionsmessungen der funktionalisierten Sonden auf Oberflächen
mittels Reflektionsinterferometrie (RICM) gemessen. RICM ist eine optische
Methode um Kontaktflächen der adhärierenden Hydrogensonden sichtbar zu machen.
Mit Hilfe der Kontaktmechanik (JKR Theorie) kann aus der elastischen
Deformation der Sonden die Adhäsionsenergie bestimmt werden. Ein besonderes
Augenmerk liegt auf der Messung von Ligand/Rezeptor Wechselwirkung von
Zucker/Proteinen an Oberflächen. Um die Anwendbarkeit der neuen Methode zu
zeigen, wurde das bekannte Zucker/Lektin-Paar Mannose und Concanavalin A
(ConA) gewählt. Die Einflüsse von der Elastizität der Sonden, der
Ligandenkonzentration sowie der Art der Funktionalisierung auf die Adhäsion
wurde evaluiert. Anschließend wurde die Inhibierung der zuvor
charakterisierten direkten Bindung von Mannose/ConA durch verschiedene
Monozucker getestet. Daher wurde eine neue Inhibitionsmessung, basierend auf
der spezifischen Adhäsion des SCPs entwickelt. Dieses Verfahren zur
Inhibitionsmessung erlaubt schnellen und einfachen Zugang zur relativen
Affinitäten einer Reihe von Zuckerliganden. Desweiteren wurden auch komplexere
Strukturen, die sogenannten sequenzdefinierten Glykooligomere auf ihre
inhibierende Wirkung getestet. Im letzten Teil der Arbeit wird die Kombination
von RICM mit AFM als neue Technik vorgestellt, um Adhäsionskräfte zwischen
rezeptormodifizierten Oberflächen und den SCPs unter Variation der
Beladungsrate, Krafteinwirkung als auch der Kontaktzeit zu messen. Die
Verwendung von ligandmodifizierten Hydrogelen als Kraftsensor soll die
physiologische Situation der weichen Glykokalyx und ihrer Wechselwirkung mit
Zellrezeptoren nachahmen. Zudem erlaubt es die Untersuchung der Fähigkeit
mehrwertiger Zucker unter Kontakt und unter Konkurrenz mit einem
ligandpräsentierenden SCP an den Rezeptoren zu binden und die Adhäsion der SCP
zu unterbinden. Verschiedene Liganden, wie Mannose oder mehrwertige
Glykooligomere wurden als Inhibitoren verwendet und auf ihre inhibitorische
Wirkung getestet. Generell wurden neue Methoden entwickelt, die mit Hilfe von
funktionalisierten PEG SCPs Messungen von Adhäsion mit hoher Empfindlichkeit
erlauben und schwache biologische Wechselwirkungen nachzuweisen. Einerseits
konnten physikalisch chemische Einflüsse durch direkte Bindungsstudien
zwischen Liganden und Rezeptoren an einer Oberfläche getestet werden,
andererseits konnte durch eine schrittweise Hemmung der Wechselwirkung durch
einen Analyten die Durchführung einer Inhibitionsmessung ermöglicht werden.
Dies ermöglichte die Etablierung eines screening assays, welcher relative
Affinitäten der Analyten entsprechend ihrer Bindung an die Rezeptoren liefert.
Basierend auf den SCP Adhäsionsmessung wurde die Kinetik durch die Kombination
mit AFM gemessen. Dadurch konnten empfindliche Messungen erreicht werden, die
zusätzlich Kraftmessungen zwischen einer weichen und harten Oberfläche
erlauben. Zukünftige Arbeiten werden sich auf die Erweiterung der Techniken
konzentrieren und weitere Ligand/Rezeptor Paare testen, sowie auf die
Entwicklung von High Throughput Screenings. Darüber hinaus wird die Anwendung
der Hydrogel SCPs als Zellmimetik für direkte Zell Wechselwirkungsstudien
mittels AFM untersucht werden.
de
dc.format.extent
VIII, 139 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
microinterferometry
dc.subject
molecular recognition
dc.subject
bio-interfaces
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie
dc.title
Synthesis and Functionalization of Soft Colloidal Probes based on
Poly(ethylene glycol) as Carbohydrate Biosensors
dc.contributor.firstReferee
Dr. Laura Hartmann
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Sebastian Seiffert
dc.date.accepted
2014-08-27
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000097449-3
dc.title.translated
Synthese und Funktionalisierung von weichen Hydrogelsonden auf Basis von
Poly(ethylenglykol) als Kohlenhydrat Biosensoren
de
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000097449
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000015776
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free
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open access