dc.contributor.author
Emde, Valeska
dc.date.accessioned
2018-06-07T15:12:30Z
dc.date.available
2008-09-16T09:19:36.582Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/723
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-4925
dc.description.abstract
Das Ziel dieser Studie war 1) Kolonkarzinomgewebe auf die Expression
verschiedener Cytokeratine auf Proteinebene zu untersuchen, 2) eine
Korrelation zwischen klinikopathologischen Parametern und der
Cytokeratinexpression zu erstellen und 3) das unsupervisierte hierarchische
Clustering in Kombination mit dem TMA-Verfahren als neue Methode zur
Bestimmung von Immunprofilen zu testen. Das Kollektiv umfasste 203 Patienten,
von denen 475 Gewebeproben analysiert wurden, die Primärtumore, Metastasen und
Normalgewebe repräsentierten. Die Gewebeproben wurden immunhistochemisch auf
die Expression der Cytokeratine 20, 19, 18, 17, 16, 14, 13, 8, 7 und 5
untersucht und statistisch mittels Kreuztabellen, Fisher´s Exact Test und
Kaplan-Meyer-Test analysiert. Eine unsuperversierte hierarchische
Clusteranalyse wurde zur Auswertung von 2919 immunhistochemischen Daten
herangezogen. Hierbei kristallisierten sich fünf Subgruppen mit
charakteristischer Expression von vier Biomarken (CK20, CK19, CK14 und CK8)
heraus. Clustergruppen mit negativer Expression von CK8 und CK20 waren
signifikant mit einem kürzerem Überleben (p=0,004) assoziiert. In der
Einzelanalyse der vier Biomarker zeigte sich ein signifikant kürzeres
Überleben bei Patienten mit einem Verlust der CK8 Expression (p=0,001). Bei
multivariater Analyse, nach Herausnahme von Tumorstadium und Grading, zeigte
CK8 eine höhere Signifikanz (p=0,004) als der Lymphknotenstatus. In der
Gesamtauswertung hingegen war er kein unabhängiger Marker. CK14 zeigte einen
Trend (p=0,056) zum kürzeren Überleben bei Überexpression. Das TMA-Verfahren
erwies als geeignete Methode zur Untersuchung von immunhistochemischen Daten
sowie die Clusteranalyse als geeignetes Verfahren zur Erstellung von
prognostischen und diagnostischen Signaturen.
de
dc.description.abstract
Recent cDNA expression profiling analyses indicate that within specific organ
cancers Cytokeratins (CKs) dysregulation may identify subgroups with distinct
biological phenotypes. Our objectives in this study were to test whether
cytokeratins were also distinct on the protein level, to evaluate these
biomarkers in a series of well-characterised CRCs, to apply hierarchical
cluster analysis to immunohistochemical data. Methods: Tissue microarrays
(TMA) comprising 475 CRC specimens from 203 patients were constructed to
evaluate CK5, CK7, CK8, CK13, CK14, CK16, CK17, CK18, CK19 and CK20. In total,
2919 samples were analyzed. Results: Unsupervised hierarchical clustering
discovered subgroups represented by reduced CK8 and CK20 expression, that
differed by a shorter patients` survival. The evaluation of the specific
biomarkers by Kaplan–Meier analysis showed that reduced CK8 expression (p <
0.01) was significantly associated with shorter patients’ survival, but was
not an independent factor correlated with tumour stage (pT), grading (G) and
nodal stage (pN). Also overexpressed CK14 showed a tendency to a shorter
patients` survival (p = 0,056) Conclusions: Reduced coexpression of CK8 and
CK20 may indicate an epithelial-mesenchymal transition (EMT) representing an
important step in the development of more aggressive CRCs. In addition,
multiplex analysis of TMAs together with immunohistochemistry (IHC)
supplemented by hierarchical clustering are a useful, promising and very
powerful tool for the identification of tumour subgroups with diagnostic and
prognostic signatures.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
colorectal cancer (CRC)
dc.subject
tissue microarray (TMA)
dc.subject
hierarchical clustering
dc.subject
epithelial-mesenchymal transition (EMT)
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Untersuchung von Cytokeratinprofilen und ihrer prognostischen Relevanz bei
kolorektalen Karzinomen - Eine TMA Untersuchung an 2919 Gewebeproben
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. I. Petersen
dc.contributor.furtherReferee
PD. Dr. Dr. med. M. Beil
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. T. Ried
dc.date.accepted
2008-11-21
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000005131-6
dc.title.translated
Cytokeratin profiles identify diagnostic signatures in colorectal cancer using
multiplex analysis of tissue microarrays
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000005131
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000011238
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access