dc.contributor.author
Frisch, Elena
dc.date.accessioned
2018-06-07T20:07:52Z
dc.date.available
2013-09-10T08:36:00.203Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/6641
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-10840
dc.description.abstract
Glykane bilden zelltypische Muster auf Zelloberflächen aus, die sich während
der Entwicklung, Differenzierung oder Erkrankung einer Zelle in
charakteristischer Weise ändern. Zurzeit wird die veränderte Glykosylierung
der humanen Glykoproteine als spezifischer Biomarkerkandidat in der Diagnose
diverser Erkrankungen wie Krebs oder Entzündungserkrankungen diskutiert
(Dennis et al. 1999; Reis et al. 2010). Im Rahmen dieser Arbeit wurde die
N-Glykosylierung des humanen Blutserums und die N- und O-Glykosylierung des
humanen Speichels analysiert. Blutserum N-Glykosylierung Die N-Glykane des
High-Mannose und Hybrid-Typs spielen eine wichtige Rolle in der Immunantwort.
Mit Hilfe des Enzyms Endo H wurden selektiv die N-Glykane des High-Mannose und
die Hybrid-Typs aus humanem Blutserum isoliert und mit MALDI-TOF-MS, MALDI-TOF
/TOF-MS, HPAEC-PAD und CE-LIF charakterisiert. Die Messmethode der CE-LIF
ermöglichte nicht nur eine schnellere Detektion von Glykanen, sondern auch die
Analyse ihrer Isomerstrukturen. Die Migrationszeiten der High-Mannosen
(Man5-9) wurden im Elektropherogramm über das Kontrollprotein RNase B
zugeordnet. Die Endo H-freigesetzten N-Glykane wurden an der HPAEC-PAD
getrennt und die erhaltenen Fraktionen an der CE-LIF analysiert, was eine
endgültige Zuordnung der neutralen und der negativ geladenen sialylierten
N-Glykane des Hybrid-Typs in den Elekropherogrammen der CE-LIF ermöglichte.
Für eine diagnostische Anwendung der Analyse des Blutserumglykoms sollte der
Schritt der Abspaltung und der Aufreinigung der Glykane kosten- und
zeiteffizient sein. Im Rahmen dieser Arbeit wurde die MAED-Methode (Microwave-
Assisted Enzymatic Digestion) zur Denaturierung der Serumproteine und zur
enzymatischen N-Glykanfreisetzung mit anschließender Aufreinigng über
selbstbefüllte SP20SS- und Graphit-Spitzen entwickelt. Die Denaturierung mit
Pronase und die Endo H-Freisetzung der N-Glykane in der Mikrowelle erfolgte
nacheinander innerhalb von 10 min (2 x 5 min; 700 Watt). Der
Aufreinigungsschritt erfolgte über selbstbefüllte SP20SS- und Graphit-Spitzen.
Außerdem sank das Elutionsvolumen von 1,2 mL bei C18/Carbograph auf 90 µL bei
SP20SS/Graphit und minimierte damit die Trocknungszeit der Lösungsmittel von 3
h auf 30 min. Insgesamt konnte die Aufbereitungszeit der Blutserum N-Glykane
von 21 Stunden auf eine Stunde reduziert werden. Aufbauend auf den Resultaten
der MAED-Methode, SP20SS/Graphit-Aufreinigung und der Messung an der CE-LIF
wurden diagnostische Untersuchungen Endo H-freigesetzter N-Glykane
durchgeführt. Ein Vergleich des Glykom von gesunden Probanden und dem von
Patienten mit diagnostiziertem Ovarial- und Colonkarzinom zeigte deutlich,
dass die beiden sialylierten Hybrid-Strukturen Neu5AcGalMan4GlcNAc2 und
Neu5AcGalMan5GlcNAc2, ausschließlich in der Patientengruppe mit
Ovarialkarzinom, unterexprimiert werden. Außerdem wurde eine Unterexpression
im zweiten und dritten Isomer der High-Mannose Man7GlcNAc bei Ovarial- und
Colonkarzinom beobachtet. Die während der PNGase F-MAED erzeugten
Oxazolinderivate wurden in Transglykosylierungsreaktionen eingesetzt. Die in
vitro Expression von Glykoproteinen könnte eine Möglichkeit für effektive und
spezifische Therapheutika gegen gezielte Erkrankungen liefern. Die
Transglykosylierungsreaktionen wurden mit Endo M durchgeführt. Das diantennäre
N-Glykan des Transferrins wurde auf die Endo H-behandelte RNase B mit Hilfe
von Endo M katalysiert. Speichel Glykosylierung Mit der MAED-Methode für die
Denaturierung der Speichelglykoproteine und der Aufkonzentrierung der
Glykopeptide über die ZIC®-HILIC Säule wurde eine schnelle Methode entwickelt,
die eine hohe Ausbeute an N- und O-Glykanen liefert. Die stufenweise
Freisetzung der N- und O-Glykane lieferte eine Fülle an strukturellen
Informationen. Die N-Glykane wurden hierzu enzymatisch (PNGase F) und die
O-Glykane chemisch (β-Eliminierung) freigesetzt und aufgereinigt. Die N- und
O-Glykosylierungen des humanen Speichels wurden massenspektrometrisch an
MALDI-TOF-MS und MALDI-TOF/TOF-MS untersucht. Dabei wurde unter anderem der
Sekretor-Status, Sialylierungs-, Sulfatierungs- und Fucosylierungsgrad
charakterisiert. Zusätzlich wurden Strukturisomere der N- und O-Glykane
untersucht. Die MALDI-TOF-MS Analyse der N-Glykane lieferte eine hohe
Strukturvielfalt an mehrfach fucosylierten und/oder sialylierten di-, tri- und
tetraantennären N-Glykanen des Komplex-, High-Mannose- und Hybrid-Typs. Die
O-Glykanstrukturen konnten von 500 bis 4000 m/z detektiert werden. In
Speichelproben mit Sekretor-Status dominierten fucosylierte O-Glykane und in
Proben mit Nicht-Sekretor-Status dominierten sialylierte O-Glykane. Außerdem
konnten core-1, core-2, core-3 und core-4, Lewis-Epitope: Lea/x-, Leb/y und
sLea/x-Epitope sowie ABH-Epitope in Abhängigkeit von der Blutgruppe
nachgewiesen werden.
de
dc.description.abstract
Glycans form cell-specific patterns on cell surfaces, which alter in a typical
manner during development, differentiation or infection of a cell. Nowadays,
changes in the glycosylation are discussed as biomarkers in the diagnosis of
multiple diseases such as cancer or inflammation (Dennis et al. 1999; Reis et
al. 2010). In the present work the N-glycosylation of human blood serum and
the N- and O-glycosylation of human saliva was analysed. Blood serum
N-glycosylation High-mannose and hybrid-type N-glycans play an important role
in the immune response. Using the enzyme Endo H, high-mannose and hybrid type
N-glycans in human blood serum could selectively be released and characterised
by MALDI-TOF-MS, MALDI-TOF/TOF-MS, HPAEC-PAD and CE-LIF. Analysis of
oligosaccharide structures using CE-LIF not only led to a faster detection of
glycans, but also made an analysis of structural isomers possible.
Electropherogram migration times of high-mannose oligosaccharides were
assigned by comparison with known structures generated from control protein
RNase B. The Endo H-released N-glycan pool was seperated by HPEAC-PAD and the
obtained fractions were analysed by CE-LIF allowing for an unambiguous
identification of the N-glycan hybride-types. In order to develop diagnostic
applications based on the analysis of the human blood serum glycom, glycan
release and purification must be time- and cost-efficient. In the present work
a MAED-method (Microwave-Assisted Enzymatic Digestion) for the denaturation of
serum proteins and the enzymatical release of N-glycans with subsequent
purification over self-made SP20SS/graphite tips was developed. The
denaturation with Pronase and the Endo H release of N-glycans was performed in
a microwave during 10 min (2 x 5 min; 700 Watt). The purification step was
performed on self-made SP20SS/graphite tips. Furthermore, the elution volumes
were reduced from 1,2 mL by C18/Carbograph to 90 µL by SP20SS/graphite tips
which minimised the evaporation time of solvent from 3 h to 30 min. In summary
the time necessary for the preparation of blood serum N-glycans was reduced
from 21 hours to one hour. Based on the results obtained from the MAED-method,
SP20SS/graphite purification and CE-LIF analysis, diagnostic studies Endo H
released N-glycans could be realised. Comparison between the glycom of healthy
control and patients with ovarian and colon cancer showed that the sialylated
hybrid structures Neu5AcGalMan4GlcNAc2 and Neu5AcGalMan5GlcNAc2 were
significantly under-expressed in samples with ovarian cancer. Furthermore, in
samples with ovarian and colon cancer an under expression in the second and
third isomer of high-mannose Man7GlcNAc was observed. The oxazoline
derivatives generated in the PNGase F-MAED were used in transglycosylation
reactions. The in vitro expression of glycoproteins could provide a new route
for efficient and specific therapeutic agents against certain diseases. Endo M
catalysed the transglycoslation reaction between oxazoline derivatives and
modified RNase B protein. During the transglycosylation reaction diantennary
N-glycan of transferrin was transferred by Endo M of the Endo H treated RNase
B. Human saliva glycosylation With the MAED-method for the denaturation of
saliva glycoproteins and the concentration of the glycopeptides on a
ZIC®-HILIC column, a rapid method could be developed which provides high
yields on N- and O-glycans. The consecutive release of N- and O-glycans
afforded multiple structural informations. N-glycans were enzymatically
released (PNGase F) and O-glycans chemically (β-elimination). The N- and
O-glycosylation of human saliva was analysed by MALDI-TOF-MS und MALDI-TOF
/TOF-MS. Thereby, the secretor-status, sialylation, sulfatation and
fucosylaltion was identified and characterised. In addition, isomeric
structures of N- and O-glycans were analysed. The MALDI-TOF-MS analysis of
N-glycans provided a high structural diversity in high fucosylated and/or
sialylated di-, tri- and tetra-antennary complex-typ N-glycans, high-mannose
and hybrid-typ N-glycans. O-glycans could be detected from m/z 500 to m/z
4000. Saliva samples with secretor-status were found to be dominated by
fucosylated O-glycans whereas in samples with non-secretor-status, sialylated
O-glycans were found to be most abundant. Furthermore, depending on the blood
group it was possible to identify core-1, core-2, core-3 and core-4
structures, lewis-epitopes: Lea/x-, Leb/y- and sLea/x-epitope and ABH-
epitopes.
en
dc.format.extent
VIII, 166 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
capillary electrophoresis
dc.subject
mass spectrometry
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::572 Biochemie
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie
dc.title
Untersuchung Endo H- und PNGase F-abgespaltener N-Glykane in humanem Blutserum
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Christian Hackenberger
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Rudolf Tauber
dc.date.accepted
2013-08-29
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000095071-4
dc.title.subtitle
Analyse des N- und O-Glykoms des humanen Speichels
dc.title.translated
Analysis of Endo H- and PNGase F-released N-glycans from human serum
en
dc.title.translatedsubtitle
Analysis of N- and O-glycans of human saliva
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000095071
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000014007
dcterms.accessRights.dnb
free
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open access