dc.contributor.author
Kammer, Bettina
dc.date.accessioned
2018-06-07T19:17:50Z
dc.date.available
2003-02-06T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/5933
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-10132
dc.description
Titelblatt, Inhaltsverzeichnis, Abkürzungsverzeichnis
1 Einleitung 9
1.1 Der SNARE-Komplex 11
1.2 SNAP-25 17
1.3 Hydrophobe Proteinmodifikationen 19
1.4 Palmitoylierung von SNAP-25 26
2 Problemstellung 30
3 Material und Methoden 31
3.1 Material 31
3.2 Methoden 36
4 Ergebnisse 55
4.1 Mutanten 55
4.2 SNAP-25 in Insektenzellen 56
4.3 Proteolytische Spaltung 57
4.4 SNAP-25 aus Insektenzellen ist palmitoyliert 59
4.5 Hydrophobizität der Proteine 61
4.6 Quartäre Proteinstruktur 62
4.7 Charakterisierung der Oligomergemische 64
4.8 Charakterisierung der Struktur 68
4.9 SNAP-25 im SNARE-Komplex 72
4.10 Quantifizierung der Bindung von SNAP-25 zu Syntaxin 74
4.11 Eigenschaften des SNARE-Komplexes 75
4.12. SNAP-25 bindet an Membranen 78
5 Diskussion 80
5.1 Palmitoylierung 80
5.2 Auswirkung der Palmitoylierung auf die Proteinstruktur 82
5.3 Keine Auswirkung auf Interaktionen mit anderen SNAREs 87
5.4 Palmitoylierung korreliert mit Membranbindung 89
6 Zusammenfassung 92
7 Summary 94
4 Literaturverzeichnis 96
dc.description.abstract
Die synaptosomalen SNARE-Proteine VAMP2, Syntaxin1 und SNAP-25 bilden einen
SNARE-Komplex, der die Fusion synaptischer Vesikel mit der präsynaptischen
Plasmamembran auslöst. Die Bildung und die enzymatische Spaltung des SNARE-
Komplexes wurden weitestgehend mit rekombinanten, aus E.coli gereinigten
Proteinen untersucht. Jedoch fehlen diesen Proteinen die
Proteinmodifikationen, die für eukaryotische Zellen beschrieben sind. Eine
wichtige Modifikation der SNARE-Proteine ist die kovalente Bindung von
Fettsäuren an SNAP-25. Palmitoylierung findet in einem Kluster von vier
Cysteinen statt und ist vermutlich der Anker des intrinsisch hydrophilen
Proteins mit der präsynaptischen Plasmamembran. In der vorliegenden Arbeit
sind SNAP-25 Wildtyp und Mutanten mit sowohl Substitutionen gegen Serin oder
Alanin als auch einer Deletion über einen Bereich von 13 Aminosäuren in der
Palmitoylierungsregion als rekombinante Proteine mit Hexahistidinresten in
Insektenzellen mit dem Baculovirus-System exprimiert worden. Die SNAP-25
Proteine konnten bis zur offensichtlichen Homogenität in einem einzigen
Reinigungsschritt über Nickelaffinitätschromatographie aufgereinigt werden. Es
wurde mittels metabolischen Einbaus von 3H-Palmitinsäure dargestellt, dass
SNAP-25 in Insektenzellen tatsächlich palmitoyliert wird und auch die Mutanten
mit Doppelsubstitutionen der Cysteine noch 20-30% palmitoyliert vorliegen. Das
beweist, dass beide Cysteinpaare direkt oder indirekt an der Palmitoylierung
beteiligt und für eine vollständige Palmitoylierung notwendig sind. Durch
Phasentrennung mit Triton X-114 konnte ein Anstieg des Hydrophobizitätsanteils
von SNAP-25 durch Palmitoylierung auf 30% beobachtet werden. Im Gegensatz dazu
befindet sich nicht acyliertes SNAP-25 ausschließlich in der wässrigen Phase.
Dieser Hydrophobizitätsanstieg zeigt, dass ein signifikanter Anteil der
SNAP-25 Moleküle palmitoyliert sein muss. Überraschenderweise zeigten sich
große Oligomere von palmitoyliertem und nicht palmitoyliertem SNAP-25 im
Elektronenmikroskop. Oligomere des palmitoyliertem sind wesentlich stabiler
als die des nicht palmitoyliertem SNAP-25. Sie können außerdem unter nicht
reduzierenden Bedingungen durch SDS-PAGE und unter reduzierenden, aber nicht-
denaturierenden Bedingungen in Zweidimensionaler Gelelektrophorese detektiert
werden. Die Oligomere konnten nach einem weiteren Reinigungsschritt mit
Anionenaustauscher-chromatographie nicht mehr beobachtet werden. Es bleibt
also unklar, ob die SNAP-25-Oligomere eine Eigenschaft von palmitoyliertem
SNAP-25 sind oder durch eine im Coomassie-Gel nicht sichtbare Verunreinigung
ausgelöst werden können. Aus Insektenzellen gereinigtes SNAP-25 bindet an die
anderen neuronalen SNARE-Proteine Syntaxin1 und VAMP2. Der
Palmitoylierungsgrad hat keinen bedeutenden Einfluss auf die SNARE-Komplex-
Bildung. Der ternäre SNARE-Komplex mit palmitoyliertem SNAP-25 aus
Insektenzellen besitzt die gleichen Eigenschaften wie der Komplex mit nicht
palmitoyliertem SNAP-25. Er ist resistent gegen Behandlung mit SDS und lässt
sich durch NSF und alpha-SNAP in Gegenwart von Adenosintriphosphat enzymatisch
dissoziieren. Die Palmitoylierung von SNAP-25 hat eine Auswirkung auf die
Bindung an künstliche Membranen. Während palmitoyliertes SNAP-25 zu 75% in
Liposomen eingebaut werden kann, ist dies mit nicht palmitoyliertem nur zu
einem geringen Prozentsatz (11%) möglich. Dieses Ergebnis unterstützt die
postulierte Membranankerfunktion der Fettsäuren.
de
dc.description.abstract
The synaptosomal SNARE-proteins VAMP2, Syntaxin1 and SNAP-25 form a SNARE-
complex which triggers fusion of synaptic vesicles with the presynaptic plasma
membrane. Assembly and disassembly of the SNARE-complex has been extensively
studied in vitro with recombinant proteins purified from E.coli. However,
those proteins lack the authentic protein modifications described for
eukaryotic cells. One important modification of SNARE-proteins is the covalent
attachment of fatty acids to SNAP-25. Palmitoylation occurs on a cluster of
four cysteines and is thought to anchor this intrinsically hydrophilic protein
to the presynaptic plasmam membrane. In this thesis SNAP-25, the wild-type
protein as well as mutants with substitutions and deletions in the
palmitolyation domain, were expressed as His-tagged constructs with the
baculovirus system in insect cells. SNAP-25 proteins could be purified to
apparent homogenity with a single Ni-affinity chromatography step. Metabolic
labeling with 3H-palmitic acid showed that SNAP-25 purified from insect cells
is indeed palmitoylated. SNAP-25 mutants with substitutions of two cysteines
are palmitoylated to 20-30% relative to the wild-type protein. This proved
that both cysteine pairs are directly or indirectly involved in
palmitoylation. In Triton X-114 phase separation experiments palmitoylated
SNAP-25 molecules were recovered to 30% from the hydrophobic detergent phase.
In contrast, non-acylated SNAP-25 is present exclusively in the hydrophilic
phase. This increase in the hydrophobicity suggests that a significant amount
of all SNAP-25 molecules are palmitoylated. Surprinsingly, large oligomers of
palmitoylated and non-acylated SNAP-25 are visible by electron microscopy.
Oligomers of palmitoylated SNAP-25 are more stable compared to non-acylated
SNAP-25. They were also detected by SDS-PAGE under non-reducing conditions and
by reducing, but non-denaturing 2D-gel-electropheris. They were not present
after a further purification step with anion exchange chromatography.
Therefore it remains unclear whether oligomer formation is an intrinsic
property of SNAP-25 or is induced by contaminating molecules undetectable in a
coomassie stained gel. SNAP-25 purified from insect cells binds to the other
neuronal SNARE-proteins Syntaxin1 and VAMP2. Palmitoylation of SNAP-25 has no
significant effect on SNARE-complex formation. The ternary SNARE-complex with
palmitoylated SNAP-25 from insect cells has the same properties as the complex
with non-acylated SNAP-25. It is resistant to SDS treatment and can be
disassembled by NSF and alpha-SNAP in the presence of ATP. Palmitoylation
influences binding of SNAP-25 to artificial membranes. Palmitoylated SNAP25
can be reconstituted to 75% in liposomes, whereas only a small percentage
(11%) of non-palmitoylated SNAP-25 molecules could be recovered from the
liposome fraction. This result supports the postulated membrane anchor
function of the fatty acids.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
palmitoylation
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie::540 Chemie und zugeordnete Wissenschaften
dc.title
Untersuchung der Funktion der Palmitoylierung von SNAP-25
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Ferdinand Hucho
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Michael F. G. Schmidt
dc.contributor.furtherReferee
-
dc.date.accepted
2003-02-03
dc.date.embargoEnd
2003-02-10
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2003000263
dc.title.subtitle
Eine biochemisch-molecularbiologische Charakterisierung und Aufklärung des
toxischen Prinzips
dc.title.translated
Examination of the function of the palmitoylation of SNAP-25
en
dc.title.translatedsubtitle
A biochemical and molecularbiological characterisation and clarification of
the toxic mechanism
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000003801
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2003/26/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000003801
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access