dc.contributor.author
Perera-Bobusch, Chrischani
dc.date.accessioned
2018-06-07T19:00:30Z
dc.date.available
2016-03-24T10:33:10.866Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/5642
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-9841
dc.description.abstract
Numerous diseases are caused by the misfolding of specific proteins and the
subsequent formation of aggregates, for example Parkinson's disease, type II
diabetes and Alzheimer's disease (AD). In the last years the scientific
interest in AD has grown remarkably due to new insights into the development
of this complex disorder. Numerous therapeutic strategies have been developed
for the treatment of AD. Cleavage of pathogenic misfolded proteins and their
aggregates with small metal complexes acting as artificial proteases is one of
them. Cu(II) and Co(III) complexes of the macrocycle cyclen were shown to
cleave proteins and numerous derivatives have already been synthesized to
improve the proteolytic activity. In the scope of the present thesis
monoalkylated derivatives of cyclen and its oxa and dioxa analoga were
synthesized. Amphiphilic metal complexes of these ligands were generated to
investigate the influence of micelle formation on the proteolytic activity of
cyclen. Five ligands and their Cu(II) complexes as well as two Co(III)
complexes were synthesized. The protein cleavage ability was investigated via
SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis) with
various model proteins. An increase of at least two orders of magnitude was
observed with all seven complexes compared to the corresponding cyclen
compounds. A comparison of the cyclen complexes of varying alkyl chain length
could show that the proteolytic activity depends on the number of CH2 groups
in the chain with the longest alkyl moiety being the most effective cleavage
agent. The highest activity of all complexes could be detected with the
Co(III) complex of 1-hexadecylcyclen, even though an improvement of the
activity was expected for the oxa analoga of the same chain length.
Remarkably, the ligands alone exhibited a comparable proteolytic activity to
the complexes. Further investigations are necessary to exclude traces of metal
as origin for this activity. An interesting finding was the decrease of the
proteolytic activity above a certain complex concentration towards heme
proteins, whereas non-heme protein cleavage increases consistently with the
complex concentration. Molecular modeling studies are underway to further
investigate these results. Fragments of the cleavage process were detected by
MALDI-TOF (Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight) mass
spectrometry. One of the fragments found in these studies reflects a specific
cleavage site in proximity to the heme group of myoglobin already established
in the literature as initial cleavage site of another cyclen derivative. These
findings suggest a key role for the heme group in the cleavage process of heme
proteins. Cytotoxicity studies via MTT
(3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide) assay showed a
drastic increase of the cytotoxicity for the complexes of 1-dodecylcyclen
compared to cyclen. However, in comparison with other compounds currently
under investigation for the treatment of AD the cytotoxicity is moderate. The
critical micellar concentration of the complexes was observed with the "pyrene
1:3 ratio" method, a technique based on fluorescence, and the values range
from 0.04 - 0.47 mM. No distinct relation could be found for the formation of
micelles and the cleavage activity. The results presented in this work, in
particular the outstanding proteolytic activity of the complexes, suggest
further studies with amphiphilic cyclen derivatives. The alkylated complexes
have a rather simple structure compared to other artificial proteases but
exhibit a comparable cleavage activity towards all model proteins. Targeted
cleavage of pathogenic proteins might be achieved by introduction of
recognition sites to the amphiphile.
de
dc.description.abstract
Zahlreiche Krankheiten, wie z.B die Parkinson-Krankheit, die Alzheimer-
Krankheit und Diabetes mellitus Typ II, werden durch die Fehlfaltung
spezifischer Proteine und der daraus resultierenden Bildung von Aggregaten
ausgelöst. Besonders die Alzheimer-Krankheit hat in den letzten Jahren ein
ansteigendes wissenschaftliches Interesse erfahren, ausgelöst durch neue
Einblicke in die Entstehung dieser komplexen Erkrankung. Für die Behandlung
der Alzheimer-Krankheit wurden verschiedene Strategien entwickelt. Die
Spaltung der pathogenen, fehlgefalteten Proteine und ihrer Aggregate mit
Metallkomplexen als künstliche Proteasen ist eine dieser Strategien. Für die
Cu(II)- und Co(III)-Komplexe des Cyclens konnte proteolytische Aktivität
nachgewiesen werden. Zahlreiche Derivate wurden seitdem basierend auf dem
Cyclen-Grundgerüst untersucht, um diese Aktivität zu steigern. Im Rahmen der
vorliegenden Arbeit wurden monoalkylierte Derivate des Cyclens und
entsprechende Oxa- und Dioxa-Analoga dargestellt. Mit Komplexen dieser
amphiphilen Verbindungen wurde der Einfluss von Mizellenbildung auf die
Spaltaktivität gegenüber verschiedenen Modell-Proteinen untersucht. Fünf
amphiphile Liganden und deren Cu(II) Komplexe konnten synthetisiert werden.
Zwei Co(III) Komplexe basierend auf den dargestellten Liganden konnten
ebenfalls synthetisiert werden. Die proteolytische Aktivität wurde mittels
SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis) mit
verschiedenen Proteinen untersucht. Ein Anstieg um mindestens zwei
Größenordnungen} konnte mit allen Komplexen im Vergleich zu Cu(II)-Cyclen
nachgewiesen werden. Ein Vergleich von Cyclen-Derivaten mit unterschiedlicher
Kettenlänge zeigte die Abhängigkeit der Aktivität von der Anzahl der
CH2-Gruppen in der Alkylkette, wobei das Derivat mit dem längsten Alkylrest
die höchste Aktivität zeigte. Obwohl ein Anstieg der Aktivität für die Oxa-
Spezies erwartet wurde, konnte die höchste Aktivität aller Komplexe für
Co(III)-Hexadecylcyclen nachgewiesen werden. Bemerkenswert war die
proteolytische Aktivität der Liganden, die vergleichbar war mit der Aktivität
der Komplexe. Weitere Nachforschungen sind notwendig, um Metallspuren als
Quelle dieser Aktivität auszuschließen. Für Hämproteine zeigte sich ein Abfall
der proteolytischen Aktivität ab einer bestimmten Komplexkonzentration,
wohingegen die Spaltaktivität gegenüber Proteinen ohne Hämgruppe mit der
Konzentration der spaltenden Spezies steigt. Um diesen Sachverhalt zu klären,
werden derzeit Molecular Modeling-Studien durchgeführt. Fragmente der Spaltung
von Myoglobin konnten mittels MALDI-TOF (Matrix-assisted laser
desorption/ionization time-of-flight) Massenspektrometrie nachgewiesen werden.
Eines dieser Fragmente kann einer Spaltung nahe der Hämgruppe zugeordnet
werden. Die entsprechende Spaltstelle wurde bereits in der Literatur mit einem
anderen Cyclen-Derivat als erste Schnittstelle im Spaltprozess zugeordnet. Die
Ergebnisse dieser Untersuchungen lassen eine Schlüsselrolle für die Hämgruppe
bei der Spaltung von Hämproteinen vermuten. Cytotoxizitätsstudien mittels MTT
(3-(4,5-Dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium-bromid)-Assay zeigten
einen deutlichen Anstieg der Toxizität der Komplexe von 1-Dodecylcyclen im
Vergleich mit den entsprechenden Cyclen-Komplexen. Jedoch ist die Toxizität
vergleichbar mit anderen Spezies, die derzeit als mögliche Alzheimer-
Therapeutika untersucht werden. Die kritische Mizellenkonzentration der
Komplexe wurde mit der Pyren 1:3-Methode untersucht, einer auf Fluoreszenz
basierenden Methode. Die ermittelten Werte liegen zwischen 0.04-0.47 mM} Die
hier dargestellten Ergebnisse, insbesondere die hervorragende Spaltaktivität
der untersuchten Komplexe, legen weitere Studien mit amphiphilen
Cyclenderivaten nahe. Die alkylierten Cyclenkomplexe weisen eine deutlich
weniger komplexe Struktur auf als die meisten anderen künstlichen Proteasen,
zeigen aber eine vergleichbare proteolytische Aktivität auf. Die gezielte
Spaltung pathogener Proteine könnte in Zukunft durch die Einführung selektiver
Gruppen ermöglicht werden.
de
dc.format.extent
x, 115 Seiten
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
künstliche Proteasen
dc.subject
Proteinspaltung
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie::546 Anorganische Chemie
dc.title
Synthesis and Biological Evaluation of Artificial Metalloproteases Based on
Amphiphilic Cyclen Derivatives
dc.contributor.contact
c.perera@fu-berlin.de
dc.contributor.inspector
Prof. Dr. Biprajit Sarkar
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Nora Kulak
dc.date.accepted
2016-02-24
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000101617-4
dc.title.translated
Synthese und biologische Evaluation künstlicher Metalloproteasen basierend auf
amphiphilen Cyclen-Derivaten
de
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000101617
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000018876
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access