dc.contributor.author
Christensen, Peter Astrup
dc.date.accessioned
2018-06-07T18:50:37Z
dc.date.available
2005-03-15T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/5490
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-9689
dc.description
Title 1
Summary 3
Content 4
Abbreviations 6
1 Introduction 7
1.1 Preface 7
1.2 Lewis Y 9
1.2.1 Structure and pathway of the Lewis carbohydrates 9
1.2.2 Expression of Lewis Y on normal cells 11
1.2.3 Function of Lewis Y 12
1.2.4 Lewis Y changes in cancer 12
1.2.5 Lewis Y expression and prognosis 13
1.2.6 Anti-Lewis Y therapy 14
1.2.7 Crystal structures of antibodies with Lewis Y 15
1.3 Technologies 16
1.3.1 Antibodies and antibody fragments 16
1.3.2 Phage display 18
1.3.3 Anti-idiotypic antibodies and molecular mimicry 20
1.3.4 Saturation transfer difference nuclear magnetic resonance 22
2 Results 24
2.1 Specificity ELISA 24
2.2 Cloning and sequences of the antibodies 27
2.3 Expression of antibodies and antibody fragments 29
2.4 Chain shuffling �looking for new specificities 31
2.5 Antibody purification 34
2.6 Epitope mapping of the H type 2 carbohydrate 37
2.6.1 STD-NMR on H disaccharide 38
2.6.2 STD-NMR on H type 2 39
2.7 Flow cytometry 41
2.8 Immunocytochemistry 44
2.9 Affinity measurements 46
2.10 Mimicry between histone H1 and a mixed carbohydrate epitope 48
2.11 Anti-idiotypic antibodies 50
2.11.1 Selection method for mimicry antibodies 51
2.11.2 Anti-idiotypic antibodies mimicking Lewis Y or H type 2 55
2.11.3 Generation of Ab3 58
2.12 Adjuvant effect of domain I of phage protein 3 60
3 Discussion 63
3.1 Lewis Y binding antibodies and specificity 63
3.2 Expression and purification of the antibodies 67
3.3 H type 2 epitope 69
3.4 Detection of Lewis Y on cancer cells 71
3.5 Affinities of the antibodies 73
3.6 Mimicry between histone H1 and a mixed carbohydrate epitope 75
3.7 Selection method of anti-idiotypic antibodies 77
3.8 Anti-idiotypic mimicry 79
3.9 Adjuvant effect of DI of phage p3 81
3.10 Achievements and outlook 83
4 Materials and Methods 85
4.1 General materials 85
4.1.1 Nemod Hybridoma clones 85
4.1.2 Antigens 85
4.1.3 Phage 85
4.1.4 Bacteria 86
4.1.5 Cell lines 86
4.1.6 Vectors 86
4.1.7 Primers 86
4.1.8 Antibodies and lectin 87
4.2 Phage display protocols 87
4.2.1 Phage amplification and precipitation 88
4.2.2 Selections 88
4.2.3 Phage screening 89
4.3 Cloning 89
4.3.1 Sequencing 89
4.3.2 Cloning of DNA from hybridoma cells 89
4.3.3 Construction of DI fusions 90
4.4 Expression of scFvs and antibody purification 90
4.4.1 Production of antibodies 90
4.4.2 Purification of antibodies 91
4.4.3 Production and isolation of antibodies from Prolifix supplemented media
91
4.4.4 Expression and harvesting of scFv and scFv-DI 92
4.4.5 Purification of scFv and scFv-DI 92
4.5 Antibody characterisation assays 92
4.5.1 ELISA 92
4.5.2 Periodate oxidation 93
4.5.3 Western blots 93
4.5.4 Surface plasmon resonance 93
4.5.5 Cell staining 94
4.5.6 Flow cytometry 94
4.5.7 Inhibition analysis 94
4.5.8 Saturation transfer difference nuclear magnetic resonance 95
4.6 Immunology assay 96
4.6.1 Mouse immunisation 96
4.6.2 IgG1 and IgG2a antibody immune responses and sera specificity 96
Acknowledgement 97
Curriculum Vitae 98
References 101
Summary in German 112
dc.description.abstract
The goal of my work was to enhance the knowledge on Lewis Y binding antibodies
and their interaction with the antigen for the development of Lewis Y-specific
therapeutics using advanced antibody technologies including anti-idiotypic
antibodies. The Lewis Y carbohydrate antigen is overexpressed in 60-90% of
cancers of epithelial origin, which makes it a target of interest for therapy.
Immunotherapeutics are promising candidates for future clinical applications.
Several antibodies have been developed against Lewis Y, but most of them
cross-react with related carbohydrate structures. The specificity
determination of the four Nemod Lewis Y binding antibodies showed that one
(A70-C/C8) bound exclusively to the Lewis Y antigen, whereas the three others
revealed cross-reactivities to related carbohydrate structures. A chimeric
mouse-human IgG was successfully generated from the IgM antibody A70-C/C8 and
this chimeric antibody (cIgG CC8) proved to be as specific towards Lewis Y, as
the parent antibody. Starting from two mouse monoclonal antibodies two new
chimeric antibodies were created by rearrangement of their chains. As a result
new chimeric antibodies (AA9/CC8) were generated as IgM as well as IgG. These
new antibodies were found to have two important features: (1) Exclusive
recognition of Lewis Y and (2) enhanced reactivity to Lewis Y. Approximately a
factor of 10 was estimated for the cIgG AA9/CC8 when compared to the cIgG CC8.
The antibodies were evaluated in ELISA, flow cytometry, immunocytology, and
surface plasmon resonance. The data generated show that the antibody cIgG
AA9/CC8 is the most promising candidate for further development and
optimising. A thorough investigation of the antigens recognised by the Nemod
antibody A70-A/A9 revealed two related carbohydrate structures, Lewis Y and
Lewis b, and surprisingly the histone H1. This is the first real hint to a
naturally occurring immunological mimicry between carbohydrate structures and
a naturally occurring protein. Anti-histone antibodies are often found in
patients suffering from the auto-immune disease systemic lupus erythematosus
(SLE). The mimicry identified here suggests a possible explanation for the
cross-reaction of some SLE auto-antibodies to the surface of cancer cells.
Generally carbohydrates are weak immunogens whereas it is possible to generate
a strong anti-carbohydrate response by vaccination with protein mimics, e.g.
anti-idiotypic antibodies. Anti-idiotypic antibodies have so far been
generated by a tedious process involving immunising mice and generation of
hybridomas. We developed an improved phage display selection strategy that
after only a few rounds of selection generated clones with the wanted
specificity from naïve scFv-phage libraries. Only two rounds of selection
using specific elution with the antigen and a protolytic helper phage ensured
that maximum diversity was retained in the selected clones. It could be also
shown that an anti-idiotypic scFv generated with this new technique was able
to induce an anti-carbohydrate response in mice. This technique is promising
as a new tool for the selection of anti-idiotypic antibodies and surrogate
molecules. Furthermore, it could be demonstrated that the fusion of DI of the
phage protein p3 to the scFvs, previously shown to be a mediator of activity,
also provides good adjuvant properties and is a new method for inducing
immunogenic responses. Results of basic research presented here enhance the
knowledge for the development of tailored immunotherapeutics.
de
dc.description.abstract
Immuntherapeutika gewinnen in der Krebstherapie an Bedeutung. Das
Kohlenhydrat-Antigen Lewis Y (LeY) ist ein lohnendes Zielantigen, da es in
60-90 % der Tumoren epithelialer Herkunft überexprimiert ist. Eine Anzahl von
Antikörpern gegen dieses Antigen wurde bereits beschrieben, aber die meisten
von diesen zeigen Kreuzreaktionen mit verwandten Kohlenhydrat-Strukturen, die
auch auf gesunden Geweben vorkommen. Das Ziel meiner Arbeit waren die
detaillierte Spezifitätsanalyse von vier Lewis Y-bindenden Antikörpern (mAk)
der Firma Nemod (darunter drei noch nicht beschriebenen), die
Charakterisierung ihrer Interaktion mit dem Epitop sowie die Generierung von
rekombinanten Antikörpern und antiidiotypischen Antikörpern als potentiellen
Immuntherapeutika. Die Spezifitätsanalyse der vier mAk ergab, dass ein
Antikörper (A70-C/C8, IgM) absolut spezifisch für Lewis Y ist, während die
drei anderen unterschiedliche Kreuzreaktivitäten zu verwandten Kohlenhydrat-
Strukturen aufweisen. Aus A70-C/C8 wurde ein chimärer Human/Maus-Antikörper
als IgG mit gleicher Spezifität generiert (cIgG CC8). Weiterhin wurden chimäre
Human-Maus-Antikörper (IgM und IgG) mit unterschiedlichen leichten Ketten
(AA9/CC8) hergestellt und umfassend charakterisiert. Diese Antikörper haben
sehr interessante Eigenschaften: 1. Sie reagieren ausschließlich mit LeY (wie
CC8). 2. Sie zeigen eine etwa 10fach stärkere Bindung an das Antigen im
Vergleich zu cIgG CC8. Die IgG-Variante ist ein vielversprechender
Ausgangspunkt für die Entwicklung eines therapeutischen Antikörpers. Die
Spezifitätsanalyse des Antikörpers A70-A/A9 ergab Bindung an zwei verwandte
Kohlenhydrat-Strukturen, Le Y und Le b, sowie überraschend an ein Protein,
Histon H1. Die Daten werden interpretiert als Erstbefund einer immunologischen
Mimikry zwischen natürlich vorkommenden Oligosaccharid- und Peptid-Antigenen.
Anti-Histon-Antikörper werden häufig bei Patienten mit systemischer Lupus
erythematosus-Erkrankung (SLE) gefunden. Gleichzeitig reagieren SLE-
Autoantikörper häufig mit Tumorzellen. Da Kohlenhydrate oft schwache
Immunogene sind, eignen sie sich nicht immer für Vakzinen. Eine Möglichkeit,
bessere Immunogenität zu erreichen, sind anti-idiotypische Antikörper, die das
ursprüngliche Antigen immunologisch imitieren. Diese Strategie wurde mit der
Generierung anti-idiotypischer single-chain-Antikörper (scFv) im Fall des Le
Y-Tumorantigens angewendet. Zu diesem Zweck wurde eine verbesserte Methode zur
Phagen-Display-Selektion entwickelt, die es erlaubt, nach wenigen
Selektionsrunden eine hohe Ausbeute und große Vielfalt von Klonen der
gewünschten Spezifität zu erhalten. Die neue Methode kombiniert die Verwendung
eines Trypsin-empfindlichen Helferphagen mit antigen-spezifischer Selektion.
Mit ihr konnten scFvs selektiert werden, die das Lewis Y-Antigen immunologisch
imitieren und in vivo in Mäusen Antikörper gegen Le Y generieren. Weiterhin
wurde durch Fusion von DI des Phagen p3 an die scFv ein sehr guter Adjuvans-
Effekt erzeugt werden. Diese methodischen Neuerungen sind wichtige
Voraussetzungen für weitere Arbeiten zur Herstellung massgeschneiderter
Immuntherapeutika.
de
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
The Lewis Y antigen
dc.contributor.firstReferee
Professor Dr. Udo Heinemann
dc.contributor.furtherReferee
Dr. habil. Uwe Karsten
dc.date.accepted
2005-03-11
dc.date.embargoEnd
2005-03-21
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000001755-0
dc.title.subtitle
Recognition and Mimicry
dc.title.translated
Das Lewis Y Antigen
de
dc.title.translatedsubtitle
Erkennung und Mimikry
de
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000001755
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2005/72/
refubium.note.author
Aus rechtlichen Gründen kann die Arbeit nicht vor dem 1. Oktober 2005
eingesehen werden!
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FUDISS_derivate_000000001755
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open access