dc.contributor.author
Mittmann, Franz
dc.date.accessioned
2018-06-07T18:19:45Z
dc.date.available
2003-04-14T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/4912
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-9111
dc.description
Titelblatt und Inhalt
1. Einleitung 1
1.1. Phytochrome 1
1.2. Moose als genetische Modellsysteme 3
1.3. Homologe Rekombination / gene targeting 6
1.4. Gene targeting in Physcomitrella patens 10
1.5. Gene substitution 14
1.6. Ziele der Arbeit 15
2. Abkürzungen 16
3. Material und Methoden 18
3.1. Organismen 18
3.2. Feinchemikalien & Materialien 18
3.3. Lösungen & Puffer 19
3.4. DNA-Isolierung 24
3.5. DNA-Analyse 25
3.6. Transformation von Physcomitrella patens 31
3.7. Physiologische Untersuchungen 36
3.8. Polyacrylamidgelelektrophorese und Western blotting 37
3.9. Sondenvorstufen für Northern blotting 38
3.10. Herstellung degenerierter Primer für die Suche nach NPH1-/Superchrome-
Sequenzen 38
4. Ergebnisse 39
4.1. Die Phytochromgene in den Ceratodon und Physcomitrella Wildtypen 39
4.2. Sequenzanalyse der Moos-Phytochrome 43
4.3. Phylogenetische Analyse ausgewählter Phytochrome 48
4.4. Southern blotting Ergebnisse von CP1-3 und PP1-4 48
4.5. gene targeting: knockout von PP1-4 aus Physcomitrella 50
4.6. knockout von PpPLC1 aus Physcomitrella 60
4.7. gene substitution 62
4.8. Effizienzen der verschiedenen knockout-Konstrukte 63
4.9. Klonierung von NPH1\- / Superchrome-Sequenzen 64
4.10. Klonierung der Ceratodon- und Physcomitrella-Häm-Oxygenase-Sequenzen 65
4.11. Sequenzanalyse der Moos-Phytochrome 71
5. Diskussion 73
5.1. DNA-Extraktion für Southern blots 73
5.2. Phytochrome in Ceratodon und Physcomitrella 73
5.3. Physiologische Analyse von WT und Phytochrom-knockout-Linien aus
Physcomitrella 76
5.4. Gene Targeting in Physcomitrella 79
5.5. Gene Targeting in Ceratodon 82
6. Zusammenfassung und Ausblick 83
7. Literatur 85
8. Anhang 93
9. Danksagung 94
dc.description.abstract
In Physcomitrella konnten erfolgreich vier Phytochromgene kloniert,
sequenziert und diese, sowie ein Phospholipase C Gen durch gene targeting
zerstört werden. Hierbei konnte die Effizienz des gene targeting mit
replacement knockout-Konstruken sowie Insertions-knockout-Konstrukten
anschaulich verglichen und die Überlegenheit der replacement knockout-
Konstrukte belegt werden. Bei diesen zeigte sich, dass einseitige terminale
Reste des Vektorrückgrats keinen störenden Einflüsse auf die Effizienz des
gene targeting haben, so dass sich die Herstellung der Transformations-DNA
erleichtern lässt. Ausgiebige Untersuchungen der phototropen Reaktion
dunkeladaptierter caulonematischer Protonemata zeigten eindeutige Ergebnisse,
besonders im Falle des PP4-knockouts, der keinen positiven Phototropismus mehr
zeigt. Ein homologes Gen für PP4 konnte auch aus Ceratodon erstmals kloniert
werden und bietet hervorragende Möglichkeiten zur Untersuchung der
Phytochromwirkung in diesem zweiten Moos-Modellsystem. Hier konnte von Gerhard
Brücker (2003) gezeigt werden, dass ebenfalls mit hoher Effizienz gene
targeting möglich ist. Hierzu wurde aus Ceratodon ein Gen für die Hämoxygenase
kloniert und sequenziert. In zwei aphototropen class I Mutanten aus Ceratodon
konnte belegt werden, dass genau dieses Gen durch eine Deletion bzw. durch
eine Punktmutation geschädigt ist. Die Punktmutation ließ sich effizient durch
gene targeting reparieren. Bislang wurde nur ein einziger der bekannten
Phytochromeffekte und ausschließlich in Einzel-knockout-Linien untersucht.
Diese Arbeit hat gezeigt, dass Mehrfach-knockouts durch Re-Transformation von
knockout-Linien mit knockout-Konstrukten für unterschiedliche Gene erzeugt
werden können. Zukünftig sollte die Herstellung von Mehrfach-Phytochrom-
knockout-Linien von Physcomitrella und Ceratodon den Weg zur Zuordnung
individueller Phytochrome zu spezifischen Phytochromeffekten ebnen.
de
dc.description.abstract
Four phytochrome genes from Physcomitrella had been cloned and sequenced.
These phytochrome genes and an additional phospholipase C gene were disrupted
via targeted gene knockout. Insertional and replacement constructs were
compared and the superiority of the latter could be shown. In case of
replacement constructs it was found that remaining terminal parts of the
vector at one side of the construct do not reduce the gene targeting
efficiency. This allows more simple production of transformation DNA. In
extensive phototropism studies of dark adapted caulonematic protonemata clear
phenotypes were found. The most distinct phenotype could be seen in the PP4
knockout missing any positive phototropic response. In Ceratodon a homolog of
PP4 could be cloned. This will allow the study of phytochrome action in this
different model system. In cooperation with Gerhard Brücker efficient gene
targeting was demonstrated in Ceratodon. For this approach a heme oxygenase
gene from Ceratodon was cloned and sequenced. In two aphototropic class I
lines of Ceratodon a mutation of this gene was found a deletion in ptrP14 and
a point mutation in ptr116. This point mutation could be efficiently repaired
by gene targeting. Up to now only one single phytochrome effect has been
analysed and this was done only in single knockout lines. However, it could be
demonstrated that double knockouts can be produced. This was done by re-
transformation of knockout lines with knockout constructs for different genes.
In future, the production of multiple phytochrome knockout lines by re-
transformation and crossing in Physcomitrella and Ceratodon may allow to
identify the phytochromes responsible for specific phytochrome effects.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
gene targeting
dc.subject
homologous recombination
dc.subject
Physcomitrella patens
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
Molekularbiologische Untersuchungen zum Phytochromsystem der Moose
Physcomitrella patens und Ceratodon purpureus
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Elmar Hartmann
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Jon Hughes
dc.date.accepted
2003-02-07
dc.date.embargoEnd
2003-04-22
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2003000945
dc.title.translated
Molecular-biological research into the phytochrome system of Physcomitrella
patens and Ceratodon purpureus
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000000948
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2003/94/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000000948
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free
dcterms.accessRights.openaire
open access