dc.contributor.author
Kim, Tai-Yang
dc.date.accessioned
2018-06-07T14:45:20Z
dc.date.available
2013-05-29T11:24:07.711Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/372
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-4576
dc.description.abstract
In der vorliegenden Arbeit wurden Untersuchungen an der cytoplasmatischen
Oberfläche des lichtsensitiven Sehpigments Rhodopsin durchgeführt. Diese
Rezeptoroberfläche spielt eine entscheidende Rolle bei der Rezeptoraktivität,
da sich dort nach Aktivierung der Lichtantenne - dem Liganden Retinal - die
Rezeptorkonformationen manifestieren, die zur Bindung des G-Proteins
Transducin und des Inhibitorproteins Arrestin führen. Ziel der Arbeit war es,
die Dynamik und die Änderungen der Umgebungsparameter an der cytoplasmatischen
Oberfläche in Abhängigkeit von verschiedenen Parametern zu bestimmen. Dazu
wurden Fluoreszenzanisotropieexperimente mit einem an der amphiphatischen
Helix 8 an Position Cys316 gebundenen Fluorescein durchgeführt. Über eine
Analyse der Fluoreszenzanisotropiekurven mit Hilfe der Ordnungsparameter und
konnte ein direkter Zusammenhang zwischen dem Bewegungsmodell von Helix 8, dem
Rezeptorzustand, welcher unter anderem von pH und Temperatur abhängig ist, und
der Proteinumgebung ermittelt werden. Im Zuge der Arbeit wurde eine
zeitkorrelierte Einzelphotonenzählungs (TCSPC)-Apparatur zur Detektion
zeitaufgelöster Fluoreszenz- und Dynamikänderungen zu einer multidimensionalen
TCSPC-Apparatur für Fluoreszenz Pump-Probe Messungen ausgebaut. Damit können
nun zeitaufgelöste Fluoreszenz- und Dynamikänderungen in Abhängigkeit der
Proteinfunktion detektiert werden. Die Proteinreaktion wird durch einen
Farbstofflaser angeregt. Auf der Zeitachse der Proteinreaktion werden dann
sequenziell Pikosekunden-zeitaufgelöste Fluoreszenzzerfallskurven aufgenommen,
die es erlauben, die Veränderung der Nanosekunden-Oberflächendynamik zu
verfolgen. Zum automatisierten Austausch der Probe wurde eine Flußzelle in den
Aufbau integriert. Mit dieser Apparatur wurde die Kinetik der Bindung des
G-Proteins Transducin an den Sehrezeptor Rhodopsin mit Hilfe eines in der
Arbeitsgruppe neuentwickelten, fluoreszenzbasierten Helix-Faltungs-Sensors
untersucht, welches dem C-terminalen Ende der katalytischen Alpha-Untereinheit
des Transducins entspricht. Dieses C-terminale Ende der Alpha-Untereinheit
gehört zu den drei Bindungsankern des Transducins und bindet spezifisch an den
aktivierten Rezeptor. Es konnte damit gezeigt werden, daß die Kinetik der
Bindung des Peptides an das lichtaktivierte Rhodopsin zweistufig ist. Der
erste Schritt - die Vorbindung - findet in Membranumgebung vor der Ausbildung
des aktiven Meta-II Intermediats von Rhodopsin statt. Der zweite Schritt - die
Helixbildung des Sensors durch die Änderung der Konformation an der
cytoplasmatischen Oberfläche - findet nach der Ausbildung von Meta-II statt.
Ebenfalls wurde ein Mikroskopaufbau zur Messung der internen
Totalreflektionsfluoreszenz (TIRF) in der Arbeitsgruppe etabliert, mit dessen
Hilfe die Diffusion von einzelnen lichtaktivierten Rhodopsinmolekülen in
nativen Diskmembranfragmenten untersucht wurde. Es konnte damit ein
heterogenes Diffusionsverhalten der lichtaktivierten Rhodopsinmoleküle in
nativen Membranen nachgewiesen werden. Ein Teil der Moleküle ist
wahrscheinlich in Oligomeren organisiert und diffundiert langsam über die
Diskmembran. Der andere Teil der Moleküle bewegt sich in kleineren Einheiten
mit einer höheren Diffusionsrate über die Diskmembran. Zusätzlich ist eine
Einschränkung der Diffusion auf Bereiche zu erkennen, welche der Größe der
gemessenen Diskmembranfragmente entsprechen.
de
dc.description.abstract
The cytoplasmic surface of the G-Protein coupled receptor rhodopsin plays a
crucial role in the process of vision. The activation of rhodopsin is
triggered by a photon, which is absorbed by the ligand, the retinal. The
accompanying conformational changes of the protein are reflected on the
protein surface. They lead to binding of the G-Protein transducin - which
starts the visual cascade - and also of the protein arrestin - which
terminates the visual cascade. The aim of this work was to analyse the changes
of rhodopsins cytoplasmic surface in dependence of several parameters such as
pH, temperature and activation state. Therefore we performed fluorescence
anisotropy measurements on the fluorescent dye fluorescein covalently bound to
the amphiphatic helix 8 at position Cys316 of rhodopsin. The examination of
the time-resolved fluroescence decay curves via order parameters and showed
a direct correlation between the pH and temperature-dependent receptor state
and the distribution model of helix 8, which itself depends on the protein
environment. In this work, a time correlated single photon counting
(TCSPC)-apparatus was extended to a multi dimensional pump-probe setup to
measure time-resolved fluorescence and dynamic changes along the reaction
coordinate of protein function. A dye laser triggers the protein function
(pump) and a laser with picosecond pulses excites the fluorescent dye (probe).
The fluorescence decay curves are recorded sequencially along the reaction
coordinate of the protein. The decay curves allow the analysis of the protein
nanosecond surface dynamics. With this setup we measured the binding kinetics
of transducin to light activated rhodopsin with a newly developed,
fluorescence based helix folding sensor. This sensor has an amino acid
sequence similar to the native C-terminus of the transducin alpha-subunit,
which is one of the three transducin anchors, and can specifically bind to
light activated rhodopsin (metarhodopsin-II). We could show for the first
time, that binding occurs via a two-step mechanism in native membranes. The
prebinding is the first step. In comparison with time correlated absorption
measurements prebinding is faster than the formation of the active
metarhodopsin-II state. The second step is called final binding and is
characterized by formation of an alpha-helical structure. This structural
change is induced due to conformational changes at the cytoplasmic surface of
the light activated rhodopsin and is much slower than formation of
metarhodopsin-II. Measurements of the diffusion of individual light activated
rhodopsin molecules in native membrane fragments on a TIRF-microscope are also
presented in this work. We were able to identify a heterogeneous diffusion
behaviour of slow and fast diffusing rhodopsin molecules in the membrane. The
slowly diffusing fraction was assigned to oligomeres of rhodopsin organized in
patches and the fast diffusing molecules to smaller units (possibly mono- or
dimers) of rhodopsin. The diffusion is restricted to an area, which is
comparable to the size of the disk-membrane patches used in these experiments.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::530 Physik
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
Zeitaufgelöste fluoreszenzspektroskopische Untersuchungen an der
cytoplasmatischen Oberfläche von Rhodopsin
dc.contributor.contact
tyk@zedat.fu-berlin.de
dc.contributor.firstReferee
Alexiev, Ulrike
dc.contributor.furtherReferee
Dau, Holger
dc.date.accepted
2012-07-10
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000094383-5
dc.title.translated
Time-resolved fluorescence spectroscopic studies at the cytoplasmic surface of
rhodopsin
en
refubium.affiliation
Physik
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000094383
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000013497
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access