dc.contributor.author
Ahmed Abdel-Rady, Mahmoud Mohamed
dc.date.accessioned
2018-06-07T16:44:47Z
dc.date.available
2004-07-12T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/2979
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-7179
dc.description
Deckblatt - Impressum
for my parents, wife and children
Contents
Abbreviations
1 INTRODUCTION 1
2 LITERATURE REVIEW 3
3 MATERIALS AND METHODS 23
4 RESULTS 39
5 DISCUSSION 61
6 CONCLUSIONS 68
7 SUMMARY 69
8 ZUSAMMENFASSUNG 71
9 REFERENCES 73
10 ANNEXES 89
Acknowledgements
dc.description.abstract
Tsetsefliegen sind obligat blutsaugende Arthropoden, die ausschließlich an
Wirbeltieren Blut saugen. Sie sind für die Übertragung der Schlafkrankheit
beim Menschen und der afrikanischen Trypanosomosen bei Haustieren in weiten
Teilen Afrikas südlich der Sahara (Tsetsegürtel) verantwortlich. Kenntnisse
über das Verhalten von Tsetsefliegen bei der Nahrungsaufnahme sind
erforderlich, um die Beziehung zwischen Wirt und Vektor und ihre jeweilige
Rolle im Übertragungszyklus der Krankheit zu verstehen. Die Herkunft der
Blutmahlzeiten der Tsetsefliegen liefert dabei wichtige Informationen über die
natürlichen Ernährungsgewohnheiten der verschiedenen Fliegenarten aus der
Gattung Glossina. Ziel der Arbeit war es daher, ein DNA-analytisches
Untersuchungsverfahren zur Tierartidentifikation des von Tsetsefliegen
aufgenommenen Blutes zu entwickeln. Es wurde eine DNA-Bank von Haus- und
Wildtierarten eingerichtet, die 33 potenzielle Wirbeltierwirte von
Tsetsefliegen erfasst. Die DNA wurde aus natürlichen Proben, wie Blut, Haaren
und Haut extrahiert und mittels PCR unter Verwendung universeller Cytochrom
b-Primer (cytb 1 und cytb 2) amplifiziert. Die verwendeten Primer waren
komplementär zu konservierten Regionen des Cytochrom b - Gens der Wirbeltiere
und führten bei allen untersuchten Arten der Familie Bovidae zu
übereinstimmenden aber variablen 359 bp PCR-Produkten. Die Auswahl geeigneter
Schnittstellen für die Restriktionsendonukleasen basierte auf dem Vergleich
von mtDNA Sequenzdaten von Boviden, die vom "National Centre for Biotechnology
Information� (USA) bezogen wurden. Die potenziellen Schnittstellen innerhalb
der verschiedenen 359 bp Amplifikate, wurden mit dem von der �New England
Biolab Incorporation� entwickelten frei verfügbaren Programms �NEB cutter
V1.0� identifiziert. Für die Unterscheidung der verschiedenen Arten der
Familie Bovidae wurde unter Nutzung der unterschiedlichen Restriktionsenzyme
TaqI, AluI, HindII die PCR-RFLP Analyse verwendet. Die erhaltenen
artspezifischen Restriktionsprofile waren für die Identifikation von allen 10
untersuchten Bovidenarten geeignet. Die Interpretation der Restriktionsprofile
erfolgte visuell, durch Vergleich mit Referenzproben und unter Verwendung
eines 50 bp DNA-Markers. Eine Computeranalyse war nicht notwendig. Die
Ergebnisse zeigen, dass es unter Verwendung universeller cytb Primer möglich
ist, die in der Blutmahlzeit von Tsetsefliegen vorhandene Wirtstier-DNA zu
amplifizieren. Die Nachweisrate in Blutmahlzeiten von Tsetsefliegen mittels
PCR-RFLP betrug 24 h nach der Blutaufnahme 100%, nach 48 h 80%, nach 72 h 60%
und nach 96 h 40%. Außerdem war die Technik auch für die Amplifikation der DNA
von Blutausstrichen auf Filterpapier geeignet. Bei Verwendung antiseptischer
Lösungen wurde die Wirtstier- DNA nicht zerstört. Nach der Verdauung der PCR
Amplifikate mit Restriktionsendonukleasen entstanden durch co-Amplifikation
nukleärer cytb Pseudogene einige unspezifische DNA Fragmente. Außerdem wurde
bei einigen Tierarten eine unvollständige Restriktionsverdauung beobachtet.
Die Ergebnisse dieser Studie zeigen, dass die cytb PCR-RFLPAnalyse eine
vielversprechende Methode für die Identifikation der Blutmahlzeiten von
Tsetsefliegen ist.
de
dc.description.abstract
Tsetse flies are obligatory haematophagous arthropods, feeding only on
vertebrate blood. They are responsible for the transmission of Human Sleeping
Sickness (HSS) and African Animal Trypanosomosis (AAT) in large areas of sub-
Saharan Africa. Information on the feeding behaviour of tsetse is essential in
understanding the relationship between hosts and vectors, and their respective
roles in a disease transmission cycle. The source of a tsetse bloodmeal might
provide important information relating to the epidemiology of trypanosomosis
and natural feeding habits of different species of Glossina. The aim of this
work was to develop a DNA based assay for the identification of bloodmeals
from tsetse flies. A DNA bank from potential vertebrate hosts of tsetse flies
was established comprising of 33 wild and domestic vertebrate species. DNA was
extracted from biological specimens, such as blood, hair and skin and
submitted to PCR using universal Cytochrome b primers (cytb 1 and cytb 2). The
primers were complementary to the conserved region of the cytochrome b gene of
vertebrates leading to a consistent but variable 359 bp-PCR products in all
bovid species tested. The selection of appropriate restriction endonucleases
sites was based on the comparison of mtDNA sequence data of bovids drawn from
the search tool of the National Centre for Biotechnology Information (USA).
Sites for all restriction enzymes that cut the amplified 359 bp sequence were
identified by means of the free available programme NEB cutter V1.0 designed
by New England Biolab Incorporation. PCR-RFLP analysis was used to
differentiate different species of the family Bovidae by using different
restriction endonucleases; TaqI, AluI and HindII. The obtained species-
specific restriction profiles were suitable for the identification of 10 bovid
species tested in this study. Interpretation of the restriction profiles was
performed visually by comparison with reference samples and help of 50 bp
molecular size marker, without the need for computer analysis. The results
also demonstrate that it is possible to use universal cytb primers to amplify
DNA present in bloodmeals from haematophagous tsetse (Diptera: Glossinidae).
The detection rate of host DNA in tsetse bloodmeals by PCR-RFLP was 100%, 80%,
60% and 40% at 24, 48, 72 and 96 h post-feeding, respectively. In addition,
the technique was successfully used to amplify DNA from blood smeared onto
filter paper and subjected to antiseptic solutions without deterioration in
the host DNA. After digestion of PCR amplicons with restriction endonucleases,
some non-specific DNA fragments were obtained in some species due to co-
amplification of nuclear cytb pseudogenes. In addition, incomplete digestion
was observed in some species. The results of this study reveal that the cytb
PCR-RFLP analysis is a promising tool for the identification of tsetse
bloodmeals.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Tsetse flies - Host preferences - Bloodmeal identification - PCR-RFLP - Restriction enzymes - Mitochondrial DNA - Cytochrome b gene
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::630 Landwirtschaft::630 Landwirtschaft und verwandte Bereiche
dc.title
Bestimmung der Wirtstierarten in Blutmahlzeiten von Tsetsefliegen (Diptera:
Glossinidae) mittels der Polymerasekettenreaktion und Restriktionsfragment-
Längenpolymorphismus- Analyse (PCR-RFLP)
dc.contributor.firstReferee
Univ.-Prof. Dr. Karl-Hans Zessin
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Michael F. G. Schmidt
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Eberhard Schein
dc.date.accepted
2004-06-25
dc.date.embargoEnd
2004-07-20
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2004001759
dc.title.translated
Host species identification of bloodmeals from tsetse (Diptera: Glossinidae)
by polymerase chain reaction and restriction fragment length polymorphism
analysis (PCR-RFLP)
en
refubium.affiliation
Veterinärmedizin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000001303
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2004/175/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000001303
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free
dcterms.accessRights.openaire
open access