dc.contributor.author
Sperling, Lisa
dc.date.accessioned
2018-06-07T16:26:46Z
dc.date.available
2018-03-21T09:30:28.834Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/2546
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-6747
dc.description.abstract
Bakterien der Familie Vibrionaceae sind in aquatischen Habitaten ubiquitär
verbreitet. Das Genus Vibrio beinhaltet Spezies mit humanpathogenem oder
fischpathogenem Potential. Eine Zunahme von Infektionen, die zum Teil mit dem
Auftreten neuer pandemischer Stämme assoziiert ist, kann bei humanpathogenen
und fischpathogenen Erregern beobachtet werden. Infektionen durch
humanpathogene Erreger stehen häufig mit dem Konsum von Meeresfrüchten in
Zusammenhang. Aktuelle Untersuchungen zum Vorkommen verschiedener
humanpathogener Vibrio spp. in Meeresfrüchten sowie zu Antibiotikaresistenzen
von Vibrio spp. aus Ecuador fehlen. Ziel dieser Arbeit war es, über
Probennahmen aus Aquakulturen und dem Einzelhandel in Ecuador die Verbreitung
von fünf humanpathogenen Vibrio spp. (V. alginolyticus, V. cholerae, V.
mimicus, V. parahaemolyticus, V. vulnificus) in Shrimps (Litopenaeus vannamei)
zu untersuchen. In 95,6 % der Proben konnte das Vorkommen mindestens einer
Vibrio sp. nachgewiesen werden. Die am häufigsten nachgewiesene Spezies war V.
parahaemolyticus mit einem Anteil von 80,8 %. V. alginolyticus (50,2 %) wurde
ebenfalls in einem großen Teil der Proben detektiert. V. cholerae (11,4 %) und
V. vulnificus (3,5 %) zeigten hingegen ein geringeres Vorkommen. Multiple
Vibrio spp. fanden sich in 45,9 % der Proben. Für V. cholerae und V.
parahaemolyticus, die beiden Spezies, für die pandemische Ausbrüche
beschrieben wurden, konnten keine Serogruppen oder Virulenzfaktoren
nachgewiesen werden, die mit pathogenen Stämmen assoziiert sind. Alle V.
cholerae-Isolate wurden den Serogruppen non-O1/non-O139 zugeordnet. Wie für
Umwelt-Isolate der Serogruppen non-O1/non-O139 typisch war keines der Isolate
Träger von Choleratoxin-codierenden Genen. Die untersuchten V.
parahaemolyticus-Isolate wurden zu 39,9 % der Serogruppe O11 zugeordnet. Die
übrigen Isolate gehörten den Serogruppen O1 bis O10 an. Die Hämolysin-Gene tdh
und trh wurden in keinem der V. parahaemolyticus-Stämme detektiert. Des
Weiteren wurden ausgewählte V. parahaemolyticus-Isolate auf das Vorkommen von
Toxin-codierenden Genen hin untersucht, die für das Auslösen einer neuartigen
Erkrankung von Shrimps verantwortlich gemacht werden. Diese als Akutes
Hepatopankreatisches Nekrose-Syndrom (AHPNS) oder auch Early Mortality
Syndrome (EMS) bekannte Erkrankung von Litopenaeus vannamei und Penaeus
monodon hat zu massiven Verlusten in Shrimps-Aquakulturen in Mexiko und
verschiedenen südostasiatischen Ländern geführt. Die Analyse der erhaltenen
Isolate zeigte eine Abwesenheit des mit AHPNS assoziierten Plasmids. Die
Untersuchungen zur Sensibilität gegenüber 22 Antibiotika aus sechs
Stoffgruppen zeigten ein hohes Maß an resistenten Isolaten (95,9 %).
Resistenzen gegenüber zwei oder mehr der untersuchten Antibiotika wurden bei
75,9 % der untersuchten Isolate detektiert, darunter fand sich ein Isolat, das
Resistenzen gegenüber 18 der 22 getesteten Antibiotika aufwies. Für alle
getesteten Substanzen wurde mindestens ein resistentes Isolat detektiert.
Gegenüber Ampicillin (87,3 %) wurden die meisten Resistenzen detektiert,
gefolgt von Tetracyclin (42,4 %), Piperacillin (33,1 %) und Amikacin (22,9 %).
Unter den untersuchten Vibrio spp. zeigte V. parahaemolyticus (98,7 %) den
größten Anteil resistenter Isolate. V. alginolyticus (83,6 %) wies einen hohen
Anteil multiresistenter Isolate auf. V. cholerae (75 %) und V. vulnificus
(87,5 %) zeigten ebenfalls zu einem großen Anteil Resistenzen, jedoch wies
kein Isolat Resistenzen gegenüber mehr als drei der untersuchten Antibiotika
auf.
de
dc.description.abstract
Bacteria of the family Vibrionaceae are ubiquitous in aquatic habitats. The
genus Vibrio includes species that are pathogenic for humans or fish. The
incidence of human infections and in aquaculture has been increased and is, to
some extent, associated with the emergence of new pandemic strains. Human
infections are often associated with the consumption of seafood. Recent
studies on the occurrence of human pathogenic Vibrio spp. in seafood from
Ecuador and their antibiotic resistance patterns are missing The primary
objective of this study was to investigate the occurrence of five human
pathogenic Vibrio spp. (V. alginolyticus, V. cholerae, V. mimicus, V.
parahaemolyticus, V. vulnificus) in shrimp (Litopenaeus vannamei) from
Ecuadorian aquaculture and from retail. The presence of at least one Vibrio
sp. was found in 95,6 % of the samples. V. parahaemolyticus (80,8 %) was the
most frequently detected species, followed by V. alginolyticus (50,2 %), V.
cholerae (11,4 %) and V. vulnificus (3,5 %). Of the samples investigated 45,9
% contained multiple Vibrio spp. Further analyses of V. cholerae and V.
parahaemolyticus isolates, which both have been involved in pandemic
outbreaks, did not detect pandemic serogroups or virulence factors. All
isolates of V. cholerae belonged to non-O1/non-O139 serogroups and like most
non-O1/non-O139 environmental strains, the isolates analyzed were negative for
the cholera toxin gene. Approximately 40 % of the V. parahaemolyticus isolates
analyzed belonged to serogroup O11. The remaining isolates belonged to the
serogroups O1 to O10. None of the V. parahaemolyticus strains examined
possessed the hemolysin genes tdh or trh. For selected V. parahaemolyticus
isolates, further analysis were conducted to detect toxin-encoding genes,
which seem to be responsible to cause a newly emergent penaeid shrimp disease,
called acute hepatopancreatic necrosis syndrome (AHPNS) or early mortality
syndrome (EMS). AHPNS has caused serious economic losses in shrimp farms in
Mexico and several Southeast Asian countries. In the investigated strains, the
absence of the plasmid associated with AHPNS was confirmed. Antimicrobial
susceptibility testing to twenty-two antibiotics of six different classes
showed a high level of resistance (95,9 %). Multi-drug resistance was found in
75,9 % of the isolates tested, including one strain with resistances to 18 of
the 22 antimicrobial agents tested. For all substances at least one resistant
isolate was detected. Most isolates were resistant to Ampicillin (87,3 %),
followed by Tetracycline (42,4 %), Piperacillin (33,1 %) and Amikacin (22,9
%). Of the Vibrio spp. studied, V. parahaemolyticus isolates showed the
highest level of resistance (98,7 %). V. alginolyticus accounted for the
highest number of multi-drug resistant isolates (83,6 %). For V. cholerae (75
%) and V. vulnificus (87,5 %) a significant fraction of isolates showed
resistance but with a lower number of multi-drug resistances.
en
dc.format.extent
IX, 151 Seiten
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
drug resistance
dc.subject
polymerase chain reaction
dc.subject
aminoglycosides (MeSH)
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::630 Landwirtschaft::630 Landwirtschaft und verwandte Bereiche
dc.title
Prävalenz und Charakterisierung der Antibiotikaresistenz von Vibrio spp. in
Shrimps aus dem Einzelhandel und Aquakulturen Ecuadors
dc.contributor.firstReferee
Univ.‐Prof. Dr. Thomas Alter
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Stephan Hühn‐Lindenbein
dc.contributor.furtherReferee
PD Dr. Bernd‐Alois Tenhagen
dc.date.accepted
2017-12-19
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000106581-3
dc.title.translated
Prevalence and characterization of antibiotic resistance of Vibrio spp. in
retail and aquaculture Shrimps in Ecuador
en
refubium.affiliation
Veterinärmedizin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000106581
refubium.note.author
Mensch und Buch Verlag
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000023363
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access