dc.contributor.author
Bechlars, Silke
dc.date.accessioned
2018-06-07T16:14:08Z
dc.date.available
2015-07-06T12:07:32.919Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/2225
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-6426
dc.description.abstract
Vibrio parahaemolyticus ist weltweit der bedeutendste Erreger von
Lebensmittelinfektionen durch Verzehr von rohen oder ungenügend erhitzten
Meeresfrüchten und Fisch. Dabei können Symptome einer akuten Gastroenteritis,
wie Erbrechen, Durchfall oder abdominale Krämpfe auftreten. Als wichtige
Pathogenitätsfaktoren gelten die Hämolysine TDH (thermostable direct
hemolysin) und TRH (TDH-related hemolysin) sowie das T3SS2 (Typ 3
Sekretionssystem 2). In deutschen Küstengewässern treten tdh positive Stämme
nur sehr selten auf, während trh positive Isolate regelmäßig detektiert
werden. In dieser Arbeit wurde eine Vielzahl an V. parahaemolyticus Stämmen
verschiedenen geographischen Ursprungs auf Virulenzgene mittels PCR untersucht
und über verschiedene phänotypische Tests, wie z.B. hämolytische Aktivität,
Sekretion extrazellulärer Enzyme, Resistenz gegenüber humanem Serum und
Biofilmbildung, welche als potentiell pathogene Eigenschaften gelten,
charakterisiert. Zur genaueren Untersuchung und Charakterisierung der
Hämolysine TDH und TRH wurde deren Synthese in einem zellfreien System
etabliert. Um den Einfluss des Signalpeptids und verschiedener Protein-Tags
auf die Funktionalität zu untersuchen, wurden acht TDH-Konstrukte mittels
zellfreier Proteinsynthese hergestellt und anschließend die hämolytische
Aktivität getestet. TDH-Konstrukte mit Signalpeptid, also Voräluferproteine,
wiesen fast keine Löslichkeit in wässriger Lösung auf und waren nicht
hämolytisch, während TDH-Konstrukte ohne Signalpeptid, also reife Proteine,
löslich waren und eine eindeutige hämolytische Aktivität zeigten. Die Protein-
Tag-Kombinationen zeigten eine geringe bis starke Hemmung der
Proteinfunktionalität. Als zentraler Aspekt dieser Arbeit wurde eine Auswahl
an einheimischen trh positiven V. parahaemolyticus Stämmen mit trh positiven
Stämmen aus anderen Regionen der Welt bezüglich ihres pathogenen Potentials
und des Verwandtschaftsgrads miteinander verglichen. Die kodierende Sequenz
der trh-Gene zeigte eine Clusterung in drei Varianten: trh1, trh2 und ψtrh.
Letzteres ist vermutlich ein Pseudogen. Alle deutschen Stämme, welche aus
Muscheln, Meerwasser und Patienten isoliert wurden, trugen die
trh2-Genvariante. Die Multilokus-Sequenz-Analyse zeigte eine nahe
Verwandtschaft zwischen deutschen und norwegischen Isolaten, welche somit
wahrscheinlich Teil der autochthonen marinen Mikroflora in Nordeuropa sind.
Bei Stämmen, welche das Pseudogen ψtrh im Genom trugen, konnte das vopC-Gen,
welches für einen Effektor des T3SS2 kodiert, nicht nachgewiesen werden. Alle
anderen trh positiven Stämme dagegen besaßen das vopC-Gen. Die Transkription
der trh-Varianten sowie des vopC-Gens wurde unter verschiedenen
Wachstumsbedingungen untersucht. Dabei wurde der Einfluss von Galle und
Harnstoff untersucht, welche u.a. in den menschlichen Gastrointestinaltrakt
ausgeschieden werden. Die trh1-Transkription konnte mithilfe von Gallenextrakt
induziert werden, während keine Induktion der trh2-Genexpression beobachtet
wurde. Die vopC-Transkription konnte in trh2 positiven Stämmen durch Harnstoff
induziert werden. Die meisten trh1-tragenden Stämme waren gegenüber
Schaferythrozyten hämolytisch, während alle trh2 positiven Stämme keine
hämolytische Aktivität zeigten. Auch das zellfrei hergestellte TRH1-Protein
war stark hämolytisch, während zellfrei synthetisierte TRH2-Proteine keine
Aktivität zeigten. Die Ergebnisse dieser Arbeit zeigen eine hohe Diversität
unter trh positiven V. parahaemolyticus Stämmen und stellen die Funktionalität
der TRH2-Proteine sowie die Rolle des ψtrh-Gens als Pathogenitätsfaktor in
Frage. Für eine Bewertung des pathogenen Potentials von V. parahaemolyticus
Stämmen wäre eine Differenzierung zwischen den trh-Varianten sowie die
Detektion von Komponenten des T3SS2 wie VopC eine sinnvolle Maßnahme in der
Diagnostik und könnte zu einer verbesserten Risikobewertung beitragen.
de
dc.description.abstract
Vibrio parahaemolyticus is the major pathogen associated with the consumption
of raw or undercooked seafood and causing acute gastroenteritis. The
hemolysins TDH (thermostable direct hemolysin) and TRH (TDH-related hemolysin)
as well as T3SS2 (type 3 secretion system 2) are considered to be major
pathogenicity factors. While tdh positive strains are rarely detected in
coastal waters of Germany, trh harbouring strains are found regularly. In this
work V. parahaemolyticus strains of different geographic origin were analyzed
for pathogenicity factors using PCR. Selected phenotypic traits which might
contribute to pathogenicity, like hemolytic activity, secretion of
extracellular enzymes, serum resistance and biofilm formation were tested in
various assays. The cell-free synthesis of hemolysins TDH and TRH was
established to analyze and compare the hemolysins. Eight TDH constructs were
synthesized in a cell-free system to investigate the influence of signal
peptide and protein tags on protein functionality. Precursor proteins with
signal peptide and mature proteins were tested by hemolysis assays showing
that precursor proteins were not soluble and therefore not active while mature
proteins were soluble and revealed hemolytic activity. Inhibition of protein
functionality by protein tags varied between tag types and tag combinations.
Major part of this work was the characterization of the pathogenic potential
of trh habouring V. parahaemolyticus strains from Germany which were compared
to trh positive strains from other geographical regions. The complete trh
sequences revealed a clustering into three different types: trh1 and trh2
genes and a pseudogene ψtrh. All German isolates possessed alleles of the trh2
gene. Multilocus sequence typing analysis indicated a close relationship of
German and Norwegian isolates suggesting that these strains belong to the
autochthonous microflora of Northern Europe seawaters. Strains carrying the
pseudogene ψtrh were negative for T3SS2 effector vopC while all other trh
positive strains exhibited vopC gene. Transcription of trh and vopC genes was
analyzed under different growth conditions to examine the influence of bile
and urea as both substances are present in the human intestinal tract. Trh2
gene expression was not altered by bile while trh1 genes were inducible. VopC
could be induced by urea in trh2 bearing strains. Most trh1 carrying strains
were hemolytic against sheep erythrocytes while all trh2 positive strains did
not show any hemolytic activity. TRH variants were synthesized in a cell-free
system and their hemolytic activity was analyzed. TRH1 was active against
sheep erythrocytes while TRH2 variants were not active at all. This work
reveals a high diversity among trh positive V. parahaemolyticus strains. The
function of TRH2 hemolysins and the role of the pseudogene ψtrh as a
pathogenicity factor are questionable. To assess the pathogenic potential of
V. parahaemolyticus strains a differentiation of trh variants and the
detection of T3SS2 components like vopC would improve V. parahaemolyticus
diagnostics and could lead to a refinement of the risk assessment in food
analyses and clinical diagnostics.
en
dc.format.extent
XIV, 160 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Thermostable direct hemolysin (TDH)
dc.subject
TDH-related hemolysin (TRH)
dc.subject
transcription analysis
dc.subject
cell-free protein synthesis
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::579 Mikroorganismen, Pilze, Algen
dc.title
Genotypische und phänotypische Charakterisierung von Hämolysin-bildenden
Vibrio parahaemolyticus Stämmen
dc.contributor.firstReferee
PD Dr. Lothar Beutin
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Rupert Mutzel
dc.date.accepted
2015-05-28
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000099507-2
dc.title.translated
Genotypic and phenotypic characterization of hemolysin-producing Vibrio
parahaemolyticus strains
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000099507
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000017318
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access