dc.contributor.author
Kiecker, Felix
dc.date.accessioned
2018-06-08T01:11:51Z
dc.date.available
2008-07-23T08:15:53.322Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/13073
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-17271
dc.description.abstract
HINTERGRUND: Noch immer stellt die Primärinfektion bzw. die Reaktivierung des
humanen Cytomegalievirus (HCMV) bei Immunkompromitierten ein großes klinisches
Problem dar. Die T-Zell-vermittelte Immunität spielt eine zentrale Rolle bei
der Kontrolle der Infektion. Die Untersuchung der T-Zell-Antwort ist daher von
größter Wichtigkeit. Peptide zur Stimulation von T-Zellen können hierbei
hilfreich sein. Wie Peptide und Peptidpools in Abhängigkeit von ihrem
Einsatzziel optimal konfiguriert sein sollten, steht bisher nicht abschließend
fest. In dieser Arbeit sollte daher geklärt werden, wie die Peptide und
Peptidpools konfiguriert sein müssen, um möglichst optimal spezifische T-Zell-
Antworten zu erfassen. Stellvertretend wurden dazu Peptide der Proteine pp65
und IE1 aus HCMV gewählt. Es sollte geklärt werden, ob unterschiedliche
Anforderungen an die eingesetzten Peptide gestellt werde, wenn CD4 und CD8
T-Zellen simultan durchgeführt werden und welchen Einfluss das Epitop
flankierende Aminosäuren auf die Stimulationseffizienz des Peptides haben. Es
sollte zudem geklärt werden, ob eine pp65-Gesamtmischung aus mit dem Verfahren
der Spotsynthese hergestellten 9-AS-Peptiden realisierbar ist, die in ihrer
Fähigkeit CD8 T-Zellen zu stimulieren mit einer Mischung aus 15-AS-Peptiden
vergleichbar ist. METHODEN: Dazu wurden 15-AS-Peptide und 9- bzw. 10-AS-
Peptide eingesetzt zur Stimulation von PBMC von insgesamt 11 Spendern mit
bekannten Reaktivitäten gegenüber Epitopen aus den Virusproteinen pp65 und
IE1. Teilweise wurden die Peptide mittels Festphasen-Peptid-Synthese
eigenständig synthetisiert. Die resultierenden T-Zell-Reaktionen wurden durch
Färbung von intrazellulärem Interferon-gamma durchflusszytometrisch sichtbar
gemacht. ERGEBNISSE: Kurze Peptide stimulieren CD8 T-Zellen effektiver als
korrespondierende längere 15-AS-Peptide. Eine pp65-Gesamtmischung schien
sinnvoll, die aus kurzen überlappenden 9-AS-Peptiden bestand. Diese Mischung
erzielte vergleichbare Ergebnisse wie die konventionelle aus 15-AS-Peptiden
bestehende. Wir verlängerten definierte kurze Peptide um einzelne AS sowohl C-
als auch N-terminal. Die Addition von AS hatte sehr unterschiedliche
Auswirkungen auf die Stimulationseffektivität in Abhängigkeit von der
angehängten AS, ob diese C- oder N-terminal angehängt wurde und dem Individuum
mit seiner eigenen Ausstattung an HLA-Molekülen, Peptidasen sowie anderen noch
nicht bekannten Faktoren. Zum Screening von CD4 T-Zell-Antworten sind Pools
mit 15-AS-Peptide und 12 Überlappungen mindestens so effizient wie die
entsprechenden rekombinanten Proteine. Falls kürzere Peptide verwendet werden,
könnten einige CD4-Antworten verloren gehen. Es wurde gezeigt, dass auch 9-AS-
Peptide CD4 T-Zellen stimulieren können. Epitop-flankierende AS können aber
eine wichtige Rolle bei der CD4 T-Zell-Stimulation spielen, da der TCR auch AS
außerhalb der MHC-Bindungssequenz erkennen kann. SCHLUSSFOLGERUNGEN: Bei der
Untersuchung von CD8 T-Zell-Antworten empfehlen wir zum Screening oder als
Verlaufskontrolle 15-AS-Peptid-Pools. Zur Quantifizierung halten wir kurze
Peptide für überlegen. Sollen sowohl CD4 als auch CD8 T-Zell-Antworten
untersucht werden, können 15-AS-Peptid-Pools verwendet werden. Eine
interessante Alternative dazu stellt die Kombination aus kurzen und langen
Peptiden dar.
de
dc.description.abstract
BACKGROUND: Human Cytomegalovirus (HCMV) primary infection as well as
reactivation is still a severe clinical problem for immunodeficient patients.
T-cell mediated immunity plays an important role in controlling the disease.
Therefore the investigation of the cellular immunity is fundamental. While
peptides and peptide pools for stimulation of T-cells are a helpful tool, it
still is not known how they should be configured for best results. The aim of
this work is to define peptides and peptide pools to detect specific T-cell
answers. Therefore peptides out of the virus proteins pp65 and IE1 were
chosen. It is important to clarify whether the peptides should meet different
demands for simultaneous investigations of CD4 and CD8 T-cells and in which
way epitope flanking amino acids affect the efficiency of the peptides. In
addition we clarified whether a pp65 mixture composed of 9mers is feasible and
if its stimulative abilities are comparable to a mixture of 15mers. METHODS:
15mers and 9mers, or 10mers respectively, were used for the stimulation of
PBMC of 11 donors with a known reactivity towards epitopes out of the virus
proteins pp65 and IE1. In part, the peptides have been synthesized
independently with a Solid Phase Peptide Synthesis. The resulting T-cell
responses were identified by flow cytometric detection of intracellular
interferon gamma. RESULTS: Short peptides stimulate CD8 T-cells more
effeciently than corresponding longer ones. A pp65 peptide pool containing
overlapping 9mers was as effective as the established pp65 peptide pool made
of 15mers. We extended defined short peptides by adding single amino acids at
the C- as well as at the N-terminus. The addition of the amino acids had
disparate impact on the efficacy of T-cell stimulation depending on the added
amino acid, whether it was attached C- or N-terminal and on the individual
equipment of HLA molecules, peptidases and other not yet known factors. For
screening of CD4 T-cell responses pools with 15mers and 12 overlapping amino
acids are at least equally effective as recombinant proteins. If shorter
peptides are used, some CD4 T-cell responses may be lost. Epitope flanking
amino acids may play an important role in stimulating CD4 T-cells because the
TCR is able to identify amino acids beyond the MHC binding sequence.
Additionally 9mers showed that they are in principle able to stimulate CD4
T-cells. CONCLUSION: For investigating CD8 T-cell responses we recommend pools
with 15mers for screening or course observation. For quantification of the CD8
T-cell response short peptides are superior. For investigating CD4 and CD8
T-cell responses, pools with 15mers are a possible choice. An alternative
would be the combination of short and long peptides.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Optimierte Peptide und Peptidpools zur Stimulation antigenspezifischer
T-Zellen bei Zytomegalievirus
dc.contributor.contact
felix.kiecker@charite.de
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. med. F. Kern
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. med. H. W. Doerr
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. med. Th. Doerner
dc.date.accepted
2008-09-19
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000003989-3
dc.title.translated
Optimized Peptides and Peptide Pools for Stimulation of Antigen Specific
T-Cells in Cytomegalovirus
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000003989
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000003892
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access