dc.contributor.author
Sticha, Kerstin
dc.date.accessioned
2018-06-08T00:57:02Z
dc.date.available
2009-07-03T11:51:11.889Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/12714
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-16912
dc.description.abstract
Die Blut-Hirn-Schranke (BHS) stellt eine funktionelle Einheit dar, die zum
einen die optimale Versorgung des Gehirns mit Nährstoffen sicherstellt,
andererseits das Gehirn u.a. durch dichte interzelluläre Verbindungen (z.B.
tight junction) vor potentiell schädlichen Inhaltsstoffen des Blutes schützt.
Pathologische Prozesse, wie z.B. Ischämie (Hypoxie), können die
Funktionstüchtigkeit der BHS beeinträchtigen und somit eine Schädigung des
Hirngewebes begünstigen. Im Rahmen dieser Arbeit wurden Ansätze aus der
Proteomforschung verfolgt. Ein Schwerpunkt war die Untersuchung der
differentiellen Proteinexpression in Gehirnkapil-larendothelzellen nach 24
Stunden Hypoxie. Die im Rahmen dieser Fragestellung entwickelte Kombination
von trägerfreier isoelektrischer Fokussierung (Rotofor / SDS-PAGE) mit stable
isotopic labeling with amino acids in cell culture (SILAC) ermöglichte die
Identifizierung und Quantifizierung der relativen Konzentration von sowohl
niedrig exprimierten als auch lipophilen Proteinen. Unter den nach 24 Stunden
Hypoxie erhöht exprimiert identifizierten Proteinen sind solche, die in die
anaerobe Glycolyse, Redoxprozesse, sowie Proteinbiosynthese und –faltung
involviert sind, aber auch Struktur- und Hitzeschockproteine. Einige Proteine
(Farnesylpyrophosphatsynthetase, Ribosomenbindendes Protein 1, EMILIN 1,
Oligosaccharyltransferase) sind in der Literatur noch nicht im Zusammenhang
mit Hypoxie beschrieben. Zur Untersuchung der molekularen Umgebung von tight
junction wurde die Cholesterolabhängigkeit von tight junction Proteinen
mithilfe von Cholesterolentzug durch Methyl-beta-Cyclodextrin (MbCD) in
normalen Rattencholangiocyten analysiert. Mit Immunfluoreszenz wurde eindeutig
eine Cholesterolabhängigkeit der Lokalisation für Occludin, Claudin-1, -3, -4
und -7 in NRC nachgewiesen. Nach Cholesterolentzug mit MbCD wurden an einer
Präparation von membrane rafts mittels SILAC quantitative Daten für Claudin-4
und -7 erhoben und so ein weiterer Hinweis für eine cholesterolabhängige
Lokalisation von tight junction Proteinen erhalten. Zur funktionellen
Proteomanalyse der am tight junction-Komplex beteiligten Proteine wurden drei
Präparationen zur Anreicherung von tight junction durchgeführt, die im
Wesentlichen die Extraktion detergens-unlöslicher Fraktionen aus Rattenleber
darstellen. Die Extrakte wurden elektrophoretisch aufgetrennt (SDS-PAGE) und
vollständig massenspektrometrisch analysiert. Neben bekannten tight junction
Proteinen wurden auch solche identifiziert, die bisher in der Literatur nicht
in Verbindung mit tight junction erwähnt wurden, für die aber nach Datenlage
eine Beteiligung an diesem Komplex als möglich erscheint.
de
dc.description.abstract
The blood brain barrier (bbb) ensures the optimal maintenance of nutrients in
brain and protects it against potentially toxic substances in blood by tight
intercellular junctions (e.g., tight junctions). Pathological processes, such
as ischemia (hypoxia) can lead to disturbances in the integrity of bbb and
promote further impairment of brain. In this work proteomic methods were used.
The first part is aimed at analysing alterations in the protein expression of
rat brain capillary endothelial cells cultured under hypoxic conditions for 24
hours. For this purpose, a modified two-dimensional electrophoresis technique
was established which combines isoelectric focusing in the liquid phase
(Rotofor) and SDS-PAGE with stable isotopic labeling by amino acids in cell
culture (SILAC). This procedure enabled identification and quantification of
low abundant and lipophilic proteins. In addition to general stress response,
functions of proteins found up-regulated after 24 h hypoxia are related to
glycolysis, redox activities, protein biosyntheses and –folding or cell
structure. Some of the proteins (e.g., farnesyl pyrophosphate synthetase,
ribosome binding protein 1, EMILIN 1, oligosaccharyl transferase) were not
described in the context of hypoxia in literature so far. Two approaches were
applied for studies concerning the molecular environment of tight junction.
The determination of cholesterol dependence on localisation of tight junction
proteins was accomplished by cholesterol depletion using methyl beta
cyclodextrin (MbCD) in normal rat cholangiocytes (NRC). The localisation of
occludin, claudin-1, -3, -4, and -7 in NRC was found to depend on the presence
of cholesterol. Cholesterol depletion by MbCD also enabled SILAC-based mass
spectrometric quantification of claudin-4 and -7 in a membrane raft
preparation obtained from NRC. Special emphasis was put on the proteomic
analysis of tight junctions and proteins associated to the junctional complex.
Three tight junction enriching preparations were analysed, basically
consisting of detergent resistant membrane fractions from rat liver. The
extracts were separated by gel electrophoresis (SDS-PAGE) and the entity of
proteins was identified by mass spectrometry.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Proteomanalyse, Proteomik, proteomics, Massenspektrometrie, mass spectrometry, SILAC, detergenz-unlösliche Membranfraktion, detergent resistant membrane fraction, DRM, differentielle Proteinexpression, Cholesterol, Methyl-beta-cyclodextrin, Cholesterolentzug, junction, tight junction, Zell-Zell-Kontakt
dc.subject
Zell-Kontakt-Protein
dc.subject
Mikrodomäne, membrane raft, raft, Blut-Hirn-Schranke, BHS, blood brain barrier, bbb, Hypoxie, Gehirnendothelzellen
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::572 Biochemie
dc.title
Untersuchungen zum molekularen Aufbau von Zell-Zell-Kontakten und zur
differentiellen Expression von Endothelzellproteinen nach Hypoxie zur
Aufklärung von Pathomechanismen an der Blut-Hirn-Schranke
dc.contributor.contact
kmikoteit@gmx.de
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Matthias F. Melzig
dc.contributor.furtherReferee
PD Dr. Ingolf E. Blasig
dc.date.accepted
2009-06-15
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000010927-2
dc.title.translated
Investigations of molecular composition of cell cell contacts and differential
protein expression in endothelial cells after hypoxia for studies of
pathological mechanisms of blood brain barrier
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000010927
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000005852
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access