dc.contributor.author
Kuhrs, Annette
dc.date.accessioned
2018-06-08T00:43:30Z
dc.date.available
2006-02-27T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/12369
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-16567
dc.description
0 Titelblatt und Inhaltsverzeichnis
1 Einleitung 1
1.1
1.2
1.3
1.4 Das Adeno-assoziierte Virus Typ 2
Ein Helfervirus für AAV: das Herpes-Simplex-Virus Typ 1
Rekombinantes AAV als Vektor für die Gentherapie
Aufgabenstellung. 1
8
11
14
2 Material und Methoden 15
2.1
2.2
2.3
2.4
2.5
2.6
2.7
2.8
2.9
2.10
2.11
2.12
2.13
2.14
2.15
2.16
2.17
2.18
2.19
2.20
2.21
2.22
2.23
2.24
2.25
2.26
2.27
2.28 Geräte
Chemikalien und Reagenzien
Zellkulturtechnik
Transiente Transfektion mit Calciumphosphat
Transiente Transfektion mit Lipofectamine
Virusinfektion von Zellen
Westernblot Analyse
Extraktion niedermolekularer DNA nach der Methode von Hirt (Hirt, 1967)
Extraktion hochmolekularer DNA
DpnI-Assay
Southernblot Analyse
Produktion und Titration von rekombinanten AAV-Vektoren
Herstellung eines Herpesvirusstocks (nach Rixon and McLauchlan, 1993)
Plaqueassay
Isolierung von HSV-DNA (nach Rixon und McLauchlan, 1993)
Herstellung rekombinanter Herpesviren durch direkte Ligation
Herstellung rekombinanter Herpesviren durch homologe Rekombination
Herstellung rekombinanter Herpesviren durch Red/ET-Rekombination
Einfügen von Mutationen in Plasmid-DNA durch site-directed mutagenesis
Amplifikation von DNA durch PCR
Ligation von DNA
TOPO TA-Klonierung
Transformation chemisch kompetenter Bakterienzellen
Präparation von Plasmid-DNA
Präparation von Bacterial Artificial Chromosome (BAC)-DNA
Plasmide und Oligonukleotide
DNA-Fragmente für Red/ET-Rekombination
Bacterial Artificial Chromosomes (BACs) 15
15
15
17
17
18
18
20
20
21
21
23
24
24
25
25
26
27
29
30
30
31
31
32
32
33
39
40
3 Ergebnisse 43
3.1
3.2
3.3
3.4
3.5
3.6
3.7
3.8
3.9
3.10 Überprüfung von rHSVrep/cap
Vergleich zweier Systeme zur Produktion von rekombinantem AAV
Herstellung eines rekombinanten Herpesvirus mit zwei Kopien des AAV-Genoms
Untersuchung des Einflusses von Rep78/68 auf die HSV-DNA-Replikation
Untersuchung des Einflusses der HSV-DNA-Replikation auf die Ausbeute an
rekombinantem AAV
Herstellung eines rekombinanten Herpesvirus mit reduzierter Rep78/68-
Expression durch Einführung eines alternativen Startcodons
Reduzierung der Rep78/68-Expression durch Austausch des p5-Promotors
gegen einen MMTV-Promotor
Herstellung eines rekombinanten Herpesvirus mit reduzierter Rep78/68-
Expression durch Mutation der Kozak-Sequenz
Herstellung eines verpackungsdefizienten rekombinanten Herpesvirus
Herstellung rekombinanter Herpesviren durch Red/ET-Rekombination 43
46
54
58
60
62
71
73
85
90
4 Diskussion 91
4.1
4.2
4.3
4.4 Untersuchung von rHSVrep/cap
Herstellung eines rekombinanten Herpesvirus mit reduzierter
Rep78/68-Expression
Herstellung eines rekombinanten Herpesvirus mit mittlerer Rep78/68-Expression
Herstellung eines verpackungsdefizienten rekombinanten Herpesvirus 93
95
99
102
5 Literaturverzeichnis 106
6 Anhang 117
6.1
6.2 Zusammenfassung
Summary 117
118
dc.description.abstract
Gegenstand dieser Arbeit war die Konstruktion und Untersuchung rekombinanter
Herpes-Simplex-Viren (HSV), welche die Gene rep und cap des Adeno-assoziierten
Virus Typ 2 (AAV-2) tragen. Mit Hilfe dieser Viren können rekombinante
AAV-2-Vektoren für die Gentherapie durch Infektion hergestellt werden ein
Verfahren, das sich im Gegensatz zu herkömmlichen Produktionsmethoden gut auf
den Großmaßstab übertragen lässt. Als problematisch erwies sich in diesem
Zusammenhang die hemmende Wirkung der AAV-Proteine Rep78/68 auf die HSV-DNA-
Replikation. Direkt gekoppelt an die DNA-Replikation der rekombinanten Herpes-
Simplex-Viren ist die Anzahl der entstehenden AAV-Genkopien und damit die
Menge an zur Verfügung stehenden AAV-Proteinen. Bei nicht reduzierter
Rep78/68-Expression werden aus diesem Grund die für die Verpackung der
rekombinanten AAV-DNA erforderlichen Proteine Rep52/40 und Cap nicht in
ausreichender Menge gebildet. Eine zu schwache Rep78/68-Expression hat
andererseits eine ineffiziente Replikation der rekombinanten AAV-DNA zur
Folge. Durch Mutation der Sequenzumgebung des Rep78/68-Startcodons konnte eine
mittlere Rep78/68-Expressionsmenge gefunden werden, die sowohl die Replikation
der rekombinanten AAV-DNA als auch der rekombinanten HSV-DNA in ausreichendem
Maße ermöglicht. Zusätzlich wurde die Ausbeute an rekombinanten AAV-Vektoren
durch Verwendung eines ICP27-negativen rekombinanten Herpesvirus gesteigert.
In der vorliegenden Arbeit konnte somit ein rep und cap tragendes Herpes-
Simplex-Virus konstruiert werden, mit dessen Hilfe rekombinante AAV-Vektoren
effizient produziert werden können. Eine Methode zur Herstellung rekombinanter
Herpes-Simplex-Viren mit verbesserter Stabilität wurde ebenfalls im Rahmen
dieser Arbeit etabliert.
de
dc.description.abstract
The topic of this work was the construction and investigation of recombinant
Herpes simplex viruses (HSV) encoding the rep and cap genes of Adeno-
associated virus type 2 (AAV-2). With the help of these viruses recombinant
AAV-2 vectors for gene therapy can be produced by infection a procedure
which in contrast to conventional methods can be easily scaled up. In this
context the inhibiting effect of the AAV proteins Rep78/68 on HSV DNA
replication turned out to be a problem. The DNA replication of the recombinant
Herpes simplex viruses is directly coupled to the amount of generated AAV gene
copies and thus to the amount of AAV proteins available. For this reason the
Rep52/40 and Cap proteins necessary for packaging the recombinant AAV DNA are
not produced in sufficient quantities when expression of Rep78/68 is not
reduced. On the other hand an efficient replication of rAAV DNA is not
possible when Rep78/68 protein levels are too low. By mutating the sequence
around the Rep78/68 startcodon a medium expression of Rep78/68 could be
achieved, which allows the replication of the recombinant HSV DNA as well as
the recombinant AAV DNA to sufficient quantities. In addition the yield of
rAAV vectors could be further improved by using an ICP27 negative recombinant
HSV strain. The result of this work is a rep and cap containing Herpes simplex
virus which allows an efficient production of recombinant AAV vectors. A
method for generating recombinant Herpes simplex viruses with improved
stability was established, too.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
vector production
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
Alternative Produktion rekombinanter Adeno-assoziierter Viren für die
Gentherapie
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Regine Heilbronn
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Gerd Multhaup
dc.date.accepted
2006-02-17
dc.date.embargoEnd
2006-03-10
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000002062-7
dc.title.translated
Alternative production of recombinant adeno-associated viruses for gene
therapy
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000002062
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2006/118/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000002062
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access