dc.contributor.author
Liebisch, Peter
dc.date.accessioned
2018-06-08T00:41:16Z
dc.date.available
2005-03-03T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/12303
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-16501
dc.description
Titel, Inhalt
i
1\. Einleitung
1
2\. Die Struktur des Mangankomplexes im S1-Zustand
17
3\. Röntgenabsorptionskanten: Oxidationszustand und Ligandengeometrie
35
4\. Strukturänderungen im Kok-Zyklus: Vergleichende XAS-Messungen bei
Raumtemperatur
46
5\. Modellierung der S-Zustandsübergänge durch oxidationsinduzierte
Brückenänderungen in binuklearen Mangankomplexen
65
6\. XANES-Simulationen für verschiedene Testsysteme
78
7\. Änderungen von Struktur und Oxidationszuständen im Kok-Zyklus: XANES-
Simulationen an Modellen des Mangankomplexes
98
8\. XANES-Linear-Dichroismus für partiell orientierte Proben
119
9\. Zusammenfassung
146
Publikationen
149
Anhang
153
Literatur
165
Danksagung, Lebenslauf
183
dc.description.abstract
Die Bestimmung der atomaren Struktur des Mn4Ca-Komplexes des Photosystems II
(PSII) und die Analyse von strukturellen und elektronischen Änderungen im
katalytischen Zyklus sind Voraussetzungen für eine detaillierte Diskussion des
Mechanismus der photosynthetischen Wasserspaltung. In der hier vorliegenden
Arbeit wurden röntgenspektroskopische Untersuchungen zur Beantwortung dieser
Fragen durchgeführt und folgende Ergebnisse wurden erzielt : (1) Ein
vollständiger XAS-Datensatz wurde bei Raumtemperatur in allen semi-stabilen
S-Zuständen des katalytischen Zyklus des PSII-Mangankomplexes aufgenommen. Die
Daten wurden im Hinblick auf den EXAFS- und den XANES-Bereich analysiert und
die Ergebnisse mit denen aus Messungen bei 20 K verglichen. Die zentralen
Aussagen sind: (a) Es bestehen keine signifikanten strukturellen Unterschiede
zwischen 20 K und Raumtemperatur. (b) Die neuen Daten bestätigen, dass im
S2->S3-Übergang eine dritte di-µ-oxo-Brücke gebildet wird. (2) In einer
vergleichenden Studie an bi-nuklearen Mangankomplexen in verschiedenen
Oxidationszuständen ließ sich ein Zusammenhang zwischen
Oxidationszustandsänderungen und Änderungen der Brückenstruktur feststellen.
(3) Ab-initio XANES-Simulationen wurden als neue Methode zur Analyse der
elektronischen und strukturellen Änderungen im S-Zyklus eingesetzt. An
strukturellen Modellen wurde das Potential der XANES-Simulationen für die
Anwendungen auf Metalloproteine demonstriert und durch komplementäre MO-
Simulationen eine qualitative Interpretation spektraler Merkmale gegeben. An
Spektren strukturell charakterisierter Modellsysteme wurde die quantitative
Beschreibung von Änderungen der XANES-Struktur aufgrund struktureller und
elektronischer Änderungen untersucht. Eine Methode zur Extraktion
geometrischer Informationen aus XANES-Spektren durch Kurvenanpassung wurde
implementiert und validiert. (4) Die Methode der XANES-Simulation wurde zur
Interpretation der Differenzspektren der S-Zustände angewendet, sowohl durch
systematische Parameterstudien als auch durch Geometrie-Anpassungen an
hypothetische Modelle des PSII-Mangankomplexes. (5) Es wurde eine Theorie zur
Berücksichtigung partieller Orientierung in der Simulation der
Polarisationsabhängigkeit der XANES-Spektren durch Vielfach-Streutheorie
entwickelt und implementiert. Durch die Anwendung dieser Theorie auf
vereinfachte Modelle des PSII-Mangankomplexes war es möglich, die Orientierung
der µ-oxo-Brücken relativ zur Membrannormalen zu bestimmen.
de
dc.description.abstract
Determination of the nuclear geometry together with structural rearrangements
and electronic changes of the Mn4Ca complex of photosystem II (PSII) may
facilitate an in depth discussion of the mechanism of photosynthetic water
oxidation. In the work presented here X-ray absorption spectroscopy is applied
to approach these questions with the following results: (1) A complete data
set of EXAFS-spectra was collected at room temperature in all semi-stable
S-states of the catalytic cycle. The data was analysed with respect to the
XANES and the EXAFS part and compared with equivalent data from measurements
at 20 K. The central findings are: (a) There are no significant structural
differences between the 20 K and the RT data. (b) The finding, that a third
di-µ-oxo-bridge is formed in the S2->S3-transition is supported by the new
data. (2) A comparative model study with bi-nuclear Mn-complexes in different
oxidation states reveals a likely connection between oxidation state
transitions and bridging mode changes which may be modelling the native
complex. (3) As a new approach XANES ab-initio simulations are used to analyse
electronic and structural changes during the S-state transitions. Structural
models are used to evaluate the potential of XANES-simulations and an
interpretation of spectral features by complementary MO calculations is given.
Spectra from structurally known models are then used to demonstrate the
possibility of a quantitative description of XANES-structure and differences
due to structural rearrangements and oxidation state changes. Furthermore
geometrical fitting of XANES data to model structures is implemented and
validated. (4) The method of XANES-simulation employed for interpretation of
the S-state difference spectra by systematic parameter studies and geometrical
fitting with hypothetic models of the Mn4 complex of PSII. (5) To evaluate the
potential of XANES-simulation with respect to the XANES polarization
dependence a theory is developed to treat Linear Dichroism XAS from partially
ordered samples with high-order or full-multiple scattering simulations. This
theory is applied to hypothetical models of the manganese complex to estimate
the orientation of the µ-oxo-bridges with respect to the membrane normal.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
manganese complex
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::530 Physik::530 Physik
dc.title
Der Mangankomplex der Photosynthese im katalytischen Zyklus
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Holger Dau
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Robert Bittl
dc.date.accepted
2005-02-15
dc.date.embargoEnd
2005-03-04
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2005000638
dc.title.subtitle
Neue röntgenspektroskopische Ansätze zur Untersuchung von Struktur und
Mechanismus
dc.title.translated
The Manganese Complex of Photosynthesis in its Catalytic Cycle
en
dc.title.translatedsubtitle
New approaches in x-ray absorption spectroscopy to analyse structure and
mechanism
en
refubium.affiliation
Physik
de
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FUDISS_thesis_000000001599
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open access