dc.contributor.author
Akimkin, Valerij
dc.date.accessioned
2018-06-08T00:40:33Z
dc.date.available
2013-08-23T08:38:31.667Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/12290
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-16488
dc.description.abstract
Durchfallerkrankungen gehören zu den bedeutsamsten Erkrankungen bei Puten und
verursachen weltweit hohe wirtschaftlichen Verluste. Als Krankheitsauslöser
werden verschiedene Infektionserreger wie Viren, Bakterien und Parasiten
vermutet, welche entweder allein oder in Mischinfektionen vorkommen. Oftmals
wird der Krankheitsverlauf auch durch nicht infektiöse Ursachen wie
Fütterungs- und Haltungsfehler negativ beeinflüsst. Aufgrund des multikausalen
Charakters von Darmerkrankungen sind die primären Durchfallursachen häufig nur
schwer zu ermitteln. Unter den viralen Erregern gelten Astro-, Rota- und
Coronaviren als darmpathogen. In Deutschland gab es bislang keine Daten zum
Vorkommen dieser Viren in Putenbeständen. Ziel dieses Projektes war es, die
Prävalenz dieser Erreger in ausgewählten Putenbeständen zu ermitteln und eine
verlässliche Diagnostik für Astro-, Rota- und Coronaviren zu etablieren. Der
Virusnachweis bzw. der Nachweis von viraler RNA erfolgte mittels
konventioneller RT-PCR und Elektronenmikroskopie. Die Primer für die RT-PCRs
zum Nachweis der viralen RNA von Astro- und Rotaviren wurden im Rahmen der
vorliegenden Arbeit etabliert. Der Coronavirusnachweis erfolgte mittels einer
PCR nach Cavanagh et al. (2001). Im Rahmen der differenzialdiagnostischen
Untersuchungen wurde auch auf Salmonellen und parasitäre Durchfallerreger
untersucht. Für die Untersuchung wurden acht Betriebe aus dem süddeutschen
Raum ausgewählt. Weibliche und männliche Tiere wurden getrennt beprobt. In
einem Betrieb wurden nur Hennen gehalten. Die Sammelkotproben wurden von der
2. Woche an über die gesamte Mastzeit (Hähne 20 Wochen, Hennen 16 Wochen) im
Abstand von zwei Wochen entnommen und am CVUA Stuttgart untersucht. Mit Hilfe
der Elektronenmikroskopie wurden Mischinfektionen mit Astro- und Rotaviren in
18% der 107 untersuchten Kotproben nachgewiesen. Die Nachweisrate von
Astroviren lag hier zwischen 28% bei männlichen und 36% bei weiblichen Tieren.
35% der Proben von Hähnen und 49% der Proben von Hennen waren Rotavirus-
positiv. Mittels RT-PCR konnte in allen Beständen Astro- und Rotavirus-RNA
detektiert werden. Doppelinfektionen wurden in 84% (90/107) der untersuchten
Proben mittels RT-PCR nachgewiesen. Die Prävalenz der Astrovirusinfektionen
lag zwischen 98% und 100% bei Hähnen und Hennen. Rotavirus-RNA wurde in 83%
der Proben von männlichen Tieren und in 87% der Proben von weiblichen Tieren
festgestellt. Coronaviren konnten weder mit dem Elektronenmikroskop noch
mittels RT-PCR nachgewiesen werden. Ein Vergleich der Ergebnisse beider
virologischer Methoden zeigt eine deutlich höhere Sensitivität des viralen
Genomnachweises mittels PCR gegenüber der Elektronenmikroskopie. Die
Untersuchungsergebnisse machen deutlich, dass man mit einer hohen Prävalenz
von Astro- und Rotaviren in deutschen Putenbeständen rechnen muss. Im
Gegensatz dazu konnten Coronaviren weder mittels Elektronenmikroskopie noch
mittels RT-PCR nachgewiesen werden.
de
dc.description.abstract
Enteric disorders are one of the most important groups of diseases affecting
turkeys and continue to cause high economic losses in many areas world-wide.
Several pathogens (viruses, bacteria and parasites) have ben incriminated as
possible causes of enteric disorders either alone, in synergy with other
microorganisms or with noninfectious causes such as feed or/and management
related factors. Under field conditions, however, it is difficult to determine
the true cause of enteric disorders. Viruses from several virus families have
been implicated as causative agents in enteric diseases in turkey such as
turkey coronavirus, avian rota- and astroviruses. Currently there are no data
available on the prevalence of these viruses in German meat turkey flocks. The
aim of the present investigation was therefore to establish reliable
diagnostic tools and to monitor turkey flocks. All samples were tested using
transmission electron microscopy (TEM) as well as RTPCR. For RT-PCRs, we
designed specific primers for astro- and rotaviruses. The coronavirus
identification was performed by a PCR which was developed by Cavanagh et al.
(2001). For differential diagnosis of causes of enteric diseases we tested for
Salmonella spp. and parasites. Eight different commercial turkey farms located
in Southern Germany were monitored. Faecal samples from hens and toms were
collected separately at 2 week intervals from the 2nd to the 16th and 20th
week of age (age of slaughter of females and males respectively) and screened
for virus infections. One farm reared only hens. Using TEM dual infections
with rota- and astroviruses were detected in 18% of 107 samples tested. The
incidence of astrovirus detection ranged between 28 and 36% in males and
females respectively. For rotaviruses, the detection rate was 35% in males and
49% in females. Using RT-PCR, infection with rota- and astroviruses was
detected in all flocks. 84% (90/107) of the faecal samples tested were
positive for both viruses at the same time. The incidence of astrovirus
infection ranged between 98-100% in toms and hens respectively. For
rotaviruses the detection rate in males and females ranged between 83 and 87%.
No coronaviruses were detected in any of the flocks or samples using both TEM
and RT-PCR. A comparison of the results of both detection methods used
exhibited higher sensitivity of the PCR assays compare electron microscopy.
The results of this study revealed a high prevalence of astro and rotavirus in
turkey flocks in Germany. In contrast, no coronaviruses were detected by
either RT-PCR or TEM.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Turkey astrovirus
dc.subject
Turkey coronavirus
dc.subject
turkey diseases
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::630 Landwirtschaft::630 Landwirtschaft und verwandte Bereiche
dc.title
Untersuchungen zum Nachweis enteraler Viren in Putenbeständen mittels
Transmissionselektronenmikroskopie und Polymerase-Kettenreaktion
dc.contributor.firstReferee
Univ.-Prof. Dr. Hafez Mohamed Hafez
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Nikolaus Osterrieder
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Reinhard Fries
dc.date.accepted
2013-06-21
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000094888-6
dc.title.translated
Detection of enteric viruses in turkey flocks using Transmission Electron
Microscopy and RT-PCR
en
refubium.affiliation
Veterinärmedizin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000094888
refubium.note.author
Mensch und Buch Berlin
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000013865
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access