dc.contributor.author
Grishkovskaya, Irina
dc.date.accessioned
2018-06-08T00:04:18Z
dc.date.available
2002-05-06T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/11406
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-15604
dc.description
Table of contents
Titelblatt
List of abbreviations 2
Table of contents 4
1. Scientific background 6
1.1. Introduction 6
1.2. Sex hormone-binding globulin 7
1.3. The aim of my thesis 13
1.4. Short theory of the isomorphous replacement and molecular replacement
methods 14
2. Materials and methods 20
2.1. Preparation of competent E.coli cells 20
2.2. Transformation 20
2.3. Protein production 21
2.4. Protein purification 21
2.5. Polyacrylamide gel electrophoresis 23
2.6. Crystallization 23
2.7. Ultracentrifugation experiments 25
2.8. X-ray diffraction experiments 25
2.9. Structure determination 30
3. Results 33
3.1. Crystal structure of the N-terminal domain of human SHBG in complex with
DHT 33
3.2. The crystal structure of SHBG including the disordered loop region 46
3.3. Structural determinants of the steroid-binding specificity of SHBG 52
4. Discussion 65
4.1. LG domain fold 65
4.2. Dimerization and steroid binding 67
4.3. Zinc effect 69
5. Summary 72
6. Zusammenfassung 74
7. References 76
Acknowledgements 86
Lebenslauf 87
List of Publications 88
dc.description.abstract
Abstract:
The crystal structure of the amino-terminal LG domain of SHBG in complex with
5a-dihydrotestosterone at 1.55 Å resolution reveals the structure of the LG
domain as such as well as the architecture of the steroid-binding site and the
quaternary structure of the dimer. The steroid and a 20 Å distant calcium ion
are not located at the dimer interface. Instead, two separate steroid binding
pockets and calcium binding sites exist per dimer. The crystal structures of
the tetragonal crystal form and the EDTA-soaked trigonal crystals of SHBG
completed the original structure and reveal the loop segment that covers the
steroid-binding pocket. Thus, a more detailed description of the steroid-
binding site topography is obtained. The binding of zinc reorients the side-
chain of His136 as observed in the original crystal structure of SHBG and in
the zinc- complexed crystal structure. Apparently, this residue causes
disorder within the loop structure between Pro130 and Arg135.
The crystal structures of SHBG in complex with different ligands, which are
estradiol, 5a-androstane, 3b,17b-diol (17b-DHA), 5a-androstane, 3b,17a-diol
(17a-DHA), 2-methoxyestradiol (methoxyestradiol), norgestrel, have also been
solved. Different SHBG-steroid complexes revealed that the steroid-binding
pocket of SHBG is very adaptable and displays different possibilities to
accommodate the ligands. The binding may occur in two ways, in a "forward"
mode like DHT and other chemically related androgens or in the "reverse" mode
like in estradiol and it metabolite methoxyestradiol. Depending on which
ligand is bound, conformational rearrangements of the residues lining the
pocket occur. The X-ray structures of SHBG-steroid complexes presented here
provide a three-dimensional composite of key molecular features for the
binding of androgens and estrogens.
de
dc.description.abstract
Zusammenfassung:
Humanes Sexualhormon-bindendes Globulin (SHBG) transportiert Steroide im Blut
und reguliert deren Abgabe an das Gewebe (mit Ausnahme von Progesterone). In
biologischen Flüssigkeiten liegt SHBG als Homodimer vor, dessen Monomere sich
aus zwei Laminin-G-ähnlichen Domänen (LG-Domänen) zusammensetzten. Die
Kristallstruktur der N-terminalen LG-Domäne von SHBG im Komplex mit 5a-
Dihydrotestosteron wurde mit einer Auflösung von 1.55 Å gelöst. Die Analyse
zeigt die Struktur einer LG-Domäne, die Architektur der Steroid-
Bindungsstasche sowie die Struktur der Dimere. Weder das Steroid noch ein
Calcium-Ion, das 20 Å entfernt von der Steroid-Bindungsstelle ist, sind in der
Dimerisierungskontaktstelle lokalisiert. Stattdessen weist jedes Dimer zwei
von einander getrennte Steroid-Bindungstaschen und zwei Calciumbindungsstellen
auf. Die Strukturen der tetragonalen Kristalle und der EDTA-getränkten
trigonalen Kristalle von SHBG ergänzen die Originalstruktur und zeigen
zusätzlich die Schleife, die über der Steroid-Bindungsstelle liegt. Somit ist
eine detaillierte Beschreibung der Steroid-Bindungsstelle möglich.Die Bindung
von Zink-Ionen führt zu einer Umorientierung der Seitenkette His136, wie sie
auch in der Originalstruktur zu sehen ist. Wahrscheinlich gibt es einen
Zusammenhang zwischen der Orientierung dieses Restes und der ungeordneten
Struktur der Schleife Pro130 bis Arg135.
Die Kristallstrukturen von SHBG im Komplex mit Östradiol, 5a-Androstan, 3b
,17b-diol (17b-DHA), 5a-Androstan, 3b,17a-diol (17a-DHA), 2-Methoxyestradiol
(Methoxyöstradiol) und Norgestrel konnten ebenfalls bestimmt werden. In den
unterschiedlichen SHBG-Komplexstrukturen, dass die Steroid-Bindungstasche sehr
flexibel ist und mehrere Möglichkeiten besitzt Liganden zu binden. Nach den
hier untersuchten Strukturen zu urteilen, werden die Steroide entweder im
"Vorwärts"- Modus wie das DHT und andere chemisch verwandte Androgene oder im
"Umkehr"- Modus wie Östradiol und dessen Metabolit Methoxyöstradiol eingebaut.
Abhängig von den Liganden kommt es zur Konformationsänderung der Reste, die in
der Bindungstasche lokalisiert sind. Die Kristallstrukturen der hier
untersuchten SHBG-Komplexe bieten einen strukturellen Überblick über die
molekularen Eigenschaften der Androgen- und Östrogenbindung.
de
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
The Crystal Structure of Sex Hormone-Binding Globulin (SHBG)
dc.contributor.firstReferee
Dr. habil. Yves Muller
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Ralf Erdmann
dc.date.accepted
2002-05-03
dc.date.embargoEnd
2002-05-13
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2002000662
dc.title.translated
Kristallographische Studie zum Sexualhormon-bindenden Globulin (SHBG)
de
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000000643
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2002/66/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000000643
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access