dc.contributor.author
Essigmann, Bernd
dc.date.accessioned
2018-06-07T23:52:48Z
dc.date.available
1999-08-18T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/11127
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-15325
dc.description
Inhaltsverzeichnis
Abkürzungen
1
Einleitung 1
1.1
Lipide in der photosynthetischen Membran 2
1.2
Das Sulfolipid6 4
1.3 Molekulargenetischer Ansatz mit Modellorganismen 11
1.4 Kristallstruktur und Homologie Modelling 13
1.5
Zielsetzung 15
2
Material 16
2.1
Chemikalien und Enzyme 16
2.2
Bakterienstämme und Vektoren 16
2.3
Pflanzen 17
2.4
Medien 17
3
Methoden 18
3.1
Kultivierung von Pflanzen und Bakterien 18
3.2 DNA/RNA-Techniken 19
3.3 Transformation 22
3.4 Lipidanalyse 23
3.5 Proteinanalyse 24
3.6 Kristallstruktur 28
3.7 Computergestützte Datenbankvergleiche 29
3.8 Molecular Modelling 29
3.9 Quantitative NAD+ Bestimmung 31
3.10 HPLC-Analyse 31
3.11 Massenspektrometrie von NAD+ 32
3.12 NMR-Spektroskopie 32
4 Ergebnisse 33
4.1 Das SQD1 Gen 33
4.2 Homologiemodell von SQD1 37
4.3 Biochemische Charakterisierung von SQD1 44
4.4 Kristallstruktur von SQD1 52
4.5 Untersuchungen zur spezifischen Funktion von Sulfolipid inhöheren Pflanzen
55
4.6 Untersuchungen zur Rolle von Lipiden in der Photosynthese anhand der pho1
Mutante von Arabidopsis 62
5 Diskussion 66
5.1 Das SQD1 Protein 67
5.2 Funktion und Regulation von Sulfolipid 73
6 Zusammenfassung 78
Summary 79
7 Literatur 80
8 Anhang 92
8.1 Konstruktion transgener Pflanzen 92
8.2 Überexpression in Arabidopsis 93
8.3 Gen Knock-out in Arabidopsis 94
dc.description.abstract
Das Sulfolipid Sulfoquinovosyldiacylglycerin wird in nahezu allen
photosynthetischen sowie in einigen wenigen nichtphotosynthetischen Organismen
gefunden. Bisher wurde die Biosynthese und Funktion dieses außergewöhnlichen
Lipids hauptsächlich in Bakterien studiert. Im Rahmen dieser Arbeit wird die
Modellpflanze Arabidopsis thaliana als Untersuchungsobjekt eingeführt. Ein
Teil der Arbeit befaßt sich mit der Biosynthese von Sulfolipid, wobei vor
allem die Reaktion, die zur Bildung der Sulfoquinovose-Kopfgruppe führt,
untersucht wird. In einem molekularbiologisch/genetischen Ansatz wird das
SQD1-Gen von Arabidopsis rekombinant exprimiert und aufgereinigt. Das Protein
konnte mit Hilfe eines Homologiemodells charakterisiert und biochemisch
untersucht werden. So wurde NAD+ als Cofaktor und UDP-Glucose als Substrat von
SQD1 identifiziert. Mit der Kristallisation des SQD1-Proteins und der sich
daraus ergebenden Kristallstruktur konnten die Ergebnisse des Homologiemodells
und der biochemischen Charakterisierung bestätigt werden. Die Resultate wurden
in einem Vorschlag für den SQD1-Reaktionsmechanismus zusammengefaßt.
In dem zweiten Teil der Arbeit konnte ein Beitrag zum Verständnis der
Regulation und der Funktion von Sulfolipid in Arabidopsis geleistet werden. Es
konnte eine drastische Änderung der Lipidkomposition unter Phosphatmangel
festgestellt werden, einhergehend mit einem deutlichen Anstieg auf SQD1 mRNA-
und SQD1-Protein. Zur weiteren Untersuchung der Funktion von Sulfolipid wurde
die pho1 Mutante herangezogen. Die physiologischen Untersuchungen dieser pho1
Mutante im Vergleich zum Wildtyp ergaben, daß sie trotz deutlich veränderter
Lipidzusammensetzung keine Unterschiede in der Lichtanpassung aufweist.
Diese Beobachtungen lassen einerseits darauf schließen, daß die Substitution
eines Thylakoidlipides durch ein anderes Lipid eine weitverbreitete Strategie
der Pflanze ist, um die Funktionsfähigkeit der photosynthetischen Membran zu
gewährleisten. Andererseits wird gezeigt, daß offensichtlich ein gewisser
Anteil anionischer Lipide für diese Funktionsfähigkeit nötig ist. Unter
Phosphatmangel ist Sulfolipid der geeignete Substituent für das anionische
Phospholipid Phosphatidylglycerin.
de
dc.description.abstract
The sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol is found in almost all
photosynthetic and few non-photosynthetic organisms. Studies on the
biosynthesis and function of this unusual lipid were performed mostly in
bacteria. In the present work the higher plant Arabidopsis thaliana was used
as model organism. One part of this study focused on the biosynthesis of
sulfolipid, in particular the formation of the sulfoquinovosyl-headgroup.
Therefor a genetic approach was chosen. The SQD1 gene of Arabidopsis was
expressed in E. coli and purified. The SQD1 protein was first characterized
using a structural model and the results were proven biochemical. It was
possible to identify NAD+ as cofactor and UDP-Glucose as substrate of SQD1.
Crystallization and the resulting structure of SQD1confirmed the structural
model and the biochemical characterization. Considering all these results a
reaction mechanism for the SQD1 protein was proposed.
In the second part of this work the regulation and functions of sulfolipid in
Arabidopsis were investigated. Under phosphate-limiting conditions drastic
changes in the lipid composition as well as strong induction of SQD1 mRNA and
SQD1 protein were observed. Furthermore the pho1 mutant of Arabidopsis was
used for physiological experiments. In spite of dramatic changes in the lipid
composition this mutant shows no changes in the light acclimation in
comparison to the wild type.
It is suggested that adjustments of lipid composition of thylakoid membranes
allow the cell to maintain the function of essential processes that are
restricted to these membranes, such as photosynthesis. In particular a certain
amount of anionic thylakoid lipid is maintained by substituting sulfolipid for
phosphatidylglycerol under reduced phosphate availability.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
membrane lipids
dc.subject
photosynthesis
dc.subject
UDP-sulfoquinovose
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
Sulfolipid in Arabidopsis thaliana
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Volker A. Erdmann
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Christoph Benning
dc.date.accepted
1999-06-10
dc.date.embargoEnd
2000-08-24
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-1999000419
dc.title.subtitle
Biosynthese, Regulation und Funktion
dc.title.translated
Sulfolipid in Arabidopsis thaliana
en
dc.title.translatedsubtitle
Biosynthesis, Regulation and Function
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000000207
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/1999/41/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000000207
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access