dc.contributor.author
Hano, Perdita Eugenie Helene
dc.date.accessioned
2018-06-07T23:32:46Z
dc.date.available
2007-08-07T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/10613
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-14811
dc.description
Titelblatt, Danksagung, Inhalt, Abbildungsverzeichnis, Abkürzungsverzeichnis
1 Einleitung 1
1.1 Der Ubiquitin-Proteasom-Weg 1
1.1.1 Culline als zentrale Untereinheiten komplexer E3-Ligasen 3
1.1.2 Der RUB-Modifikations-Weg, CSN und das CAND1 Protein 5
1.1.3 Phytohormon- und Stresssignaltransduktion und die Rolle von Cullin-
abhängigen E3-Ligasen 7
1.2 AtCUL3-abhängige E3-Ligasen 11
1.3 BTB/POZ-Proteine als Substratadaptoren in BRC-Komplexen 13
1.4 NPR1: Ein BTB-Protein als potentieller Substratadaptor 15
1.5 Ziel der Arbeit 17
2 Material und Methoden 18
2.1 Materialien 18
2.1.1 Chemikalien 18
2.1.2 Geräte 20
2.1.3 Arabidopsis thaliana, Bakterien und Vektoren 21
2.1.4 Enzyme, Reaktions- und Präparations-Kits 22
2.1.5 Medien und Lösungen 24
2.2 Methoden 30
2.2.1 Anzuchtbedingungen und Aufbewahrung von Escherichia coli 30
2.2.2 Anzuchtbedingungen für Arabidopsis thaliana 30
2.2.3 Kreuzung von Arabidopsis thaliana 31
2.2.4 DNA-Präparationen 31
2.2.5 Präparation von kompetenten Zellen aus E. coli 32
2.2.6 Transformation von E. coli Zellen 32
2.2.7 Isolierung von RNA aus Arabidopsis thaliana 33
2.2.8 Denaturierende Agarosegelelektrophorese zur Trennung von RNA und
Northern-Blotting 33
2.2.9 Radioaktive Markierung von DNA-Fragmenten und Hybridisierung 34
2.2.10 Präparation des Gesamtproteins aus Arabidopsis thaliana 34
2.2.11 Bestimmung der Proteinkonzentration 34
2.2.12 Polyacrylamid-Gelelektrophorese 34
2.2.13 Immobilisierung von Proteinen auf PVDF-Membran 35
2.2.14 Immunodetektion immobilisierter Proteine 35
2.2.15 Heterologe Genexpression in E. coli 36
2.2.16 Aufreinigung von GST-getagtem Protein aus E. coli 36
2.2.17 Pulldown 36
3 Ergebnisse 38
3.1 Charakterisierung der cul3ako- und cul3bko-Nullmutanten 39
3.1.1 Einfluss von Osmotica, Zuckern und Salzen auf die Keimung 39
3.1.2 Untersuchung der Expression von Genen der Sulfatassimilation 41
3.1.3 Einfluss von erhöhten Temperaturen auf Keimung und Entwicklung 42
3.1.4 Untersuchung der Expression von Hitzeschockgenen 44
3.1.5 Untersuchung der Expression von Hitzeschockfaktoren 46
3.1.5 Spezifität der beobachteten Toleranz bzw. Sensibilität bei den cul3ako
und cul3bko Mutanten 47
3.2 Erzeugung einer Doppelmutante mit cul3bko und axr1-12 und deren
Charakterisierung 49
3.2.1 Phänotypische Charakterisierung von cul3bko/axr1-12 Doppelmutanten 50
3.2.2 Analyse der HSP-Gene in cul3bko/axr1-12 51
3.2.3 Einfluss von Phytohormonen auf cul3bko/axr1-12 52
3.2.4 Molekulare Analyse der Salicylsäureantwort 54
3.3 NPR1 als Substratadaptor 56
4 Diskussion 58
4.1 Die Rolle von AtCUL3 bei der Stressantwort 58
4.1.1 cul3ko ist bei der Keimung toleranter gegenüber hohen
Sulfatkonzentrationen und Temperaturen 59
4.1.2 Das HSP-Schutzsystem ist in cul3ko Pflanzen gestört 61
4.2 Die Rolle von AtCUL3 bei der Phytohormonsignaltransduktion 64
4.2.1 cul3bko und cul3bko/axr1-12 sind sensitiv gegenüber epi-Brassinolid 64
4.2.2 cul3bko ist hypersensitiv gegenüber Salicylsäure 65
4.2.3 NPR1 interagiert mit cul3bko in vitro 66
4.2.4 Entwicklung eines Modells zur Rolle von AtCUL3b bei der
Salicylsäuresignaltransduktion 67
5.1 Zusammenfassung und Summary 70
6 Literatur 73
7 Anhang 91
7.1 Verwendete Oligonukleotide 71
7.2 Eidesstattliche Erklärung 95
dc.description.abstract
Cullin-abhängige E3-Ligasen bilden eine Klasse von Enzymkomplexen, die viele
regulatorische Prozesse in der eukaryotischen Zelle kontrollieren. Sie
markieren Zielproteine für einen ubiquitinabhängigen Abbau durch das 26S
Proteasom. CUL3-BTB-Ligasen gehören zu dieser Klasse von Enzymen. In
Arabidopsis thaliana gibt es mit AtCUL3a und AtCUL3b zwei Gene die für CUL3
codieren und mindestens 80 BTB-Proteine, die als Substratadaptoren in Frage
kommen. Eine der bekanntesten Funktionen von Cullin-abhängigen E3-Ligasen ist
ihre Rolle bei der Phytohormonsignaltransduktion. Sowohl für Auxin
(SCFTIR1-Komplex) als auch für Ethylen (BRCETO1\- und SCFEBF1/2-Komplex),
Gibberelline (SCFSLY1/SNE-Komplex) und Jasmonsäure (SCFCOI1-Komplex) wurde
ihre Bedeutung bereits dokumentiert. In dieser Arbeit konnte gezeigt werden,
dass AtCUL3a und AtCUL3b die Keimung beeinflussen. Unter Stressbedingungen,
wie erhöhten Sulfatkonzentrationen, war die Keimung der Nullmutanten cul3ako
und cul3bko weniger stark beeinträchtigt, als die der Wildty-pen. Die
Sulfatassimilation ist bis zur Synthese von Cystein nicht verändert. Die
Toleranz der Nullmutanten gegenüber hohen Temperaturen und der Vergleich mit
ebenfalls hitzetoleranten Abscisinsäure-insensitiven Mutanten aus dem ABA-
Signaltransduktionsweg liefern wichtige Hinweise auf eine Funktion von AtCUL3
in diesem Mechanismus. Als weiteres Ergebnis konnte festgestellt werden, dass
die Stressantwort in älteren cul3ako\- und cul3bko-Pflanzen generell
geschwächt ist, was sich durch eine Sensitivität gegen Hitzeschock bei einem
gleichzeitig beeinträchtigten Hitzeschockprotein-Schutzsystem bemerkbar
machte. Die HS-Antwort wird nicht über den Abbau von Hitzeschockfaktoren durch
einen BRC-Komplex reguliert. Aus der Literatur sind jedoch mehrere Hinweise
für die Modifikation von Proteinen durch den UBQ-Weg bekannt. Eine Steuerung
über diesen Weg ist somit möglich. Entscheidend für die HS-Antwort ist die
Modifikation mit RUB, da die axr1-12 Mutante eine geringere Expression von
HSP-Genen aufwies. Der zusätzliche Verlust von AtCUL3b konnte diesen Effekt
nicht verstärken. Bei der Untersuchung der Wirkung von Phytohormonen wurde
eine erhöhte Sensitivität der Null- und Doppelmutanten unter dem Einfluss des
Brassinosteroids epi-Brassinolid beobachtet. Eine Funktion von AtCUL3b liegt
nahe, da aktuelle Forschungsberichte eine Rolle des UBQ-Proteasom-Wegs bei der
Regulierung der BR-Biosynthese beschreiben. Weiterhin ist es gelungen, eine
Interaktion von AtCUL3b mit NPR1 in vitro nachzuweisen. Bei einer
gleichzeitigen Hypersensitivität gegenüber Salicylsäure und einer veränderten
PR1-Expression in cul3bko kann AtCUL3b eine Funktion im SA-
Signaltransduktionsweg zugeordnet werden. cul3ako reagierte weder
hypersensitiv auf Salicylsäure, noch war die PR1-Expression verändert. Obwohl
eine Interaktion von NPR1 mit AtCUL3a nicht ausgeschlossen werden kann, liegt
die Vermutung nahe, dass die Redundanz zwischen AtCUL3b und AtCUL3a im SA-Weg
nicht zum Tragen kommt.
de
dc.description.abstract
Cullin dependent E3 ligases form a class of enzyme complexes, which control
many regulatory processes in the eukaryotic cell. They target proteins for
ubiquitindependent degradation by the 26S proteasome. The CUL3-BTB ligases
belong to this class of enzymes. Arabidopsis thaliana encodes two related CUL3
genes, called AtCUL3a and AtCUL3b. There are at least 80 BTB proteins, which
are applicable as substrate adaptors. One of the most well-known functions of
Cullin dependent E3 ligases is their role in the phytohormone signal
transduction. Both for auxin (SCFTIR1-complex), ethylene (BRCETO1\- and
SCFEBF1/2-complex), gibberellin (SCFSLY1/SNE-complex) and jasmonic acid
(SCFCOI1-complex) their relevance was already documented. In this work it
could be shown that AtCUL3a and AtCUL3b play a role with germinating under
stress conditions. Increased sulfate concentrations impair germinating of the
null mutants cul3ako and cul3bko less strong than the wildtype, while the
sulfate assimilation is not defective up to the synthesis of cysteine. The
tolerance of the null mutants to high temperatures during germination and the
comparison with heat-resistent abscisic acid insensitive mutants provides
important notes for a function of AtCUL3 in the ABA signal transduction
pathway. It could be demonstrated that the stress response in cul3ako and
cul3bko is generally weakened, which became apparent with older plants in
sensitivity against heat shock. The heat shock protein protection system is
impaired at the same time. A direct regulation of the HS response by the
degradation of heat shock factors through a BRC complex can be excluded.
However, from the literature several references are well-known for the
modification of proteins by the UBQ pathway. A control in this way is thus
possible. The modification with RUB is crucial for the HS response. It could
be shown that already the axr1-12 mutant exhibited a lower expression of HSP
genes. The additional loss of AtCUL3b could not strengthen this effect. During
the investigation of the phytohormones, null and double mutant showed an
increased sensitivity under the influence of the brassinosteroid epi-
brassinolide. Current research reports demonstrate the role of the UBQ
proteasome way with the regulation of the BR biosynthesis. An interaction of
AtCUL3b with NPR1 is shown in vitro. With a simultaneous hypersensitivity to
salicylic acid and a changed PR1 expression in cul3bko, AtCUL3b can be
assigned to a function in the SA signal transduction way. cul3ako reacted
neither hypersensitiv to salicylic acid nor was the PR1 expression changed.
Although an interaction of NPR1 with AtCUL3a cannot be excluded, it is likely
that there is no redundancy between AtCUL3b and AtCUL3a in the SA way.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Arabidopsis Thaliana
dc.subject
Ubiquitin-Proteasome-Pathway
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
Charakterisierung der Culline AtCUL3a und AtCUL3b aus Arabidopsis thaliana als
Vermittler von Stressantworten und deren Einfluss auf Entwicklungsprozesse
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Hanjo Hellmann
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Wolfgang Schuster
dc.date.accepted
2007-06-19
dc.date.embargoEnd
2007-09-05
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000003151-6
dc.title.translated
Characterisation of the cullins AtCUL3a and AtCUL3b from Arabidopsis thaliana
as mediators of stress answers and their influence on developmental processes
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000003151
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2007/551/
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FUDISS_derivate_000000003151
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open access