dc.contributor.author
Römer, Antje
dc.date.accessioned
2018-06-07T15:24:30Z
dc.date.available
2010-03-17T13:47:55.282Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/1024
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-5226
dc.description.abstract
Ziel der vorliegenden Arbeit war es, erstmalig Daten über die coliforme
Mikroflora der Wildschweine sowie grundlegende Erkenntnisse über die
Diversität von E. coli-Populationen und über das natürliche Vorkommen von
Virulenz- und Kolonisationsgenen in nicht vom Menschen beeinflussten
Schweinepopulationen zu erhalten. Daher wurden kommensale E. coli aus dem Darm
von gesunden Wildschweinen geno- und phänotypisch untersucht. Die Ergebnisse
wurden mit bereits publizierten Daten kommensaler E. coli von Hausschweinen
verglichen. Im ersten Teil der Arbeit konnte gezeigt werden, dass die
Diversität der E. coli Stämme für jedes Wildschwein individuell und hoch
variabel, jedoch geringer als die Diversität von Hausschwein E. coli war. Über
die Hälfte der untersuchten Wildschwein E. coli wiesen zudem mindestens eines
der für schweinepathogene E. coli typischen Virulenzgene auf. Das Toxingen
astA war in fast der Hälfte aller Stämme nachweisbar. Alle vier ECoR Gruppen
waren in jedem der untersuchten Darmabschnitte vertreten. Die geno- und
phänotypische Charakterisierung der Wildschwein E. coli im zweiten Teil der
Arbeit belegte, dass für schweinepathogene E. coli typische Virulenzgene bei
Wildschwein E. coli nur sporadisch nachgewiesen werden konnten, wohingegen
einige für extraintestinal-pathogene E. coli (ExPEC) typische,
virulenzassoziierte Gene (mat, fyuA, sitD chr., astA, kpsMTII, ibeA, malX)
häufiger als bei kommensalen Hausschwein E. coli auftraten. Der Großteil der
untersuchten Isolate gehörte den ECoR Gruppen A und B1 an, wobei die ECoR
Gruppe B2, deren Vertreter deutlich mehr virulenzassoziierte Gene aufwiesen,
häufiger als bei kommensalen E. coli von Hausschweinen vorkam. Außerdem wiesen
E. coli von Wildschweinen gegenüber denen von Hausschweinen durchschnittlich
höhere Adhäsionsraten an IPEC J2 Zellen und eine effizientere Verwertung der
49 getesteten Kohlenhydrate auf. Diese Ergebnisse legen nahe, dass sich E.
coli von Wildschweinen in einigen Eigenschaften von Hausschwein E. coli
unterscheiden. Das bessere Adhäsionsvermögen, die effizientere
Kohlenhydratverwertung, die geringere Diversität sowie das häufigere Vorkommen
von Kolonisationsgenen und der ECoR Gruppe B2 könnten eine Folge des durch den
Menschen eingeleiteten Domestizierungsprozesses und der heutigen
konventionellen Schweinehaltung sein.
de
dc.description.abstract
The main objectives of the present study were to obtain preliminary
information about the E. coli microflora from wild boars, as well as to get
basic knowledge about the diversity and natural occurrence of selected
virulence and antimicrobial resistance genes of E. coli isolated from pig
populations, which are unaffected by humans as far as possible. For this
purpose, commensal intestinal E. coli from healthy wild boars were analyzed
geno- and phenotypically to compare the results with already published data
from commensal E. coli from domestic pigs. The first part of this study showed
that the diversity of the E. coli microflora from wild boars was unique and
highly variable but lower than the diversity of E. coli from domestic pigs. In
addition, more than half of the isolated E. coli strains exhibited at least
one of the virulence genes which are characteristic for porcine pathogenic E.
coli. Almost half of the isolated E. coli strains possessed the gene astA
coding for a heat stable cytotoxin. Members of each of the four ECoR groups
were found in all selected sections of the intestine. The geno- and
phenotypical characterization of E. coli from wild boars in the second part of
this study could prove that for porcine pathogenic intestinal E. coli typical
virulence genes are only sporadically distributed among E. coli from wild
boars, whereas some of the virulence associated genes, which are typical for
extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) (mat, fyuA, sitD chr., astA,
kpsMTII, ibeA, malX) occurred more frequently in E. coli from wild boars than
in those from domestic pigs. The majority of the isolated E. coli were members
of the ECoR-groups A and B1, whereas the ECoR group B2, whose members clearly
exhibited more virulence associated genes, was represented more frequently
than in commensal E. coli from domestic pigs. Furthermore, E. coli from wild
boars showed higher adhesion rates to IPEC-J2-cells on average and a more
efficient utilization of 49 tested carbohydrates than those from domestic
pigs. These results suggest that there exist differences between the E. coli
microflora from wild boars and those from domestic pigs. The enhanced adhesion
capacity, more efficient utilization of carbohydrates, lower diversity and
more frequent occurrence of colonization genes and of E. coli representing the
ECoR group B2 could be a consequence of the domestication process initiated by
humans and conventional pig husbandry.
en
dc.format.extent
XI, 108, X - XLII
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Escherichia coli
dc.subject
digestive tract
dc.subject
microbial flora
dc.subject
genetic diversity
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::630 Landwirtschaft::630 Landwirtschaft und verwandte Bereiche
dc.title
Vergleichende molekulare, epidemiologische und phylogenetische Untersuchungen
zur Anpassung von Escherichia coli bei Wild- und Hausschweinen
dc.contributor.firstReferee
Univ.-Prof. Dr. Lothar H. Wieler
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Jürgen Zentek
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Uwe Rösler
dc.date.accepted
2009-11-25
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000016101-7
dc.title.translated
Comparative molecular, epidemiologic and phylogenetic analyses concerning the
adaptation of Escherichia coli in wild boars and domestic pigs
en
refubium.affiliation
Veterinärmedizin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000016101
refubium.note.author
Mensch und Buch Verlag; ISBN: 978-3-86664-744-2
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000011562
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access