dc.contributor.author
Illanes-Céspedes, Dino
dc.date.accessioned
2018-06-07T22:52:35Z
dc.date.available
2010-11-26T09:22:35.920Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/9761
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-13959
dc.description
1
Einleitung...................................................................................................
1 1.1. Die Sekretoglobulin-
Superfamilie...........................................................................
1 1.1.1 Allgemeine
Einführung.......................................................................................................
1 1.1.2 Die Sekretoglobulin-
Gene..................................................................................................
1 1.1.3 Expression und evolutionäre Verwandtschaft der SCGB-
Superfamilie............................. 2 1.1.4 Struktur und physiologische
Funktionen der SCGBs ........................................................
4 1.1.5 Implikation von Mammaglobin 1 und Lipophilin B in der
Kanzerogenese......................... 8 1.1.5.1 Strukturelle Charakteristika
des MGB1/LipB-Komplexes ......................................... 9 1.1.5.2
Forschungsstand zur Regulation der Mammaglobin 1-Expression
........................ 10 1.2 Epidemiologie, Ätiologie und Therapie des
Mammakarzinoms ..........................12 1.3 Epigenetische Ereignisse in
der Genregulation...................................................14 1.3.1
CpG-Methylierungen und Regulation der
Genexpression............................................... 14 1.3.1.1
Molekularer Mechanismus der DNA-Methylierung
................................................. 16 1.3.2 Nukleosomale
Organisation und
Genregulation.............................................................. 18
1.4 Pharmakologische Eingriffe in die epigenetische
Genregulation.......................20 1.4.1 DNA-Methyltransferase-Inhibitoren
(DNMTI) .................................................................. 20
1.4.2 Der DNA-Methyltransferase-Inhibitor 5-Aza-2’-desoxycytidin
......................................... 21 1.4.3 Histonacetylasen (HATs) und
Histondeacetylasen (HDACs) .......................................... 23
1.4.3.1 HDAC-Inhibitoren: Mechanismus und Wirkstoffklassen
......................................... 23 1.4.3.2 Antitumoraktivitäten von
HDAC-Inhibitoren ............................................................
25 1.4.3.3 Der HDAC-Inhibitor (R)-Trichostatin
A.................................................................... 26
1.4.3.4 Der HDAC-Inhibitor
Butyrat.....................................................................................
27 1.5 Die biologische Bedeutung der Glutathion-Peroxidase GPx4 in
Mammalia.......28 1.5.1 mGPx4-Funktionen im Zusammenhang mit oxidativen
Streß......................................... 30 1.5.2 mGPx4 als anti-
apoptotisches Protein
............................................................................
31 2 Zielsetzung und methodisches
Vorgehen............................................ 32 3 Material und
Methoden...........................................................................
34 3.1
Materialien...............................................................................................................34
3.1.1 Chemikalien und Gebrauchswaren
.................................................................................
34 3.1.2 Puffer, Lösungen und
Nährmedien..................................................................................
34 3.1.3 Chemikalien
.....................................................................................................................
35 3.1.4 Enzyme und
Kits..............................................................................................................
35 3.1.5 Geräte und Gebrauchswaren
..........................................................................................
36 3.1.6 DNA-Banken und
Plasmide.............................................................................................
37 3.1.7 Bakterienstämme und
Zellen...........................................................................................
37 3.1.8
Antikörper........................................................................................................................
37 3.2 Allgemeine Labortechniken
...................................................................................37
3.2.1 Rechnergestützte
Sequenzanalyse.................................................................................
38 3.2.2 Statistische Berechnungen
..............................................................................................
38 3.2.3 RNA-Extraktion und reverse Transkription
(RT).............................................................. 38 3.2.3.1
Real time-PCR
........................................................................................................
39 3.2.4 Funktioneller Promotor
Assay..........................................................................................
41 3.2.4.1 Konstruktion der
Reportergene...............................................................................
41 3.2.4.2 Polymerase Kettenreaktion
(PCR)..........................................................................
42 3.2.4.3 Transiente Transfektion
..........................................................................................
42 3.2.5 Kontroll-Restriktionsspaltung von Plasmid
DNA.............................................................. 43 3.2.6
Zelllyse und Immunodetektion nukleärer Proteine
.......................................................... 44 3.2.6.1
Aufschluß eukaryotischer Zellen zur Analyse von
Histonproteinen........................ 44 3.2.6.2 SDS-Polyacrylamid
Gelelektrophorese (SDS-PAGE) ............................................ 44
3.2.6.3 „Semi-dry“-Western Proteintransfer und ECL-
Analyse........................................... 45 3.2.6.4 Blotmembran
Stripping............................................................................................
46 3.2.7 DNA-Gelshift Assay
.........................................................................................................
47 3.2.8 Analyse der Transkriptelongation und mRNA-
Reifung.................................................... 49 3.2.9
Zellkultur der Mammakarzinom-Zellen COH-BR1 (WT, VC, 7G4)
.................................. 50 3.2.10 Zellzahlbestimmung mittels
Hämozytometer (Neubauer-Zählkammer)...................... 51 3.2.11 Inhibition
der Histonacetylierung bzw. DNA-Methylierung
.......................................... 52 4
Ergebnisse...............................................................................................
54 4.1 In silico-Analysen des LipB-Promotors
................................................................54 4.1.1
Identifizierung cis-regulatorischer
Elemente....................................................................
54 4.1.2 Vergleichendes Alignment der Promotoren von MGB1, MGB2 und LipB
....................... 56 4.1.3 Multiples Alignment der distalen 8 kbp
Upstream-Sequenz............................................ 58 4.1.4
Phylogenetische Aspekte und Konservierung in Mammalia
........................................... 59 4.2 Funktionelle
Promotorstudien am Lipophilin
B-Gen............................................62 4.2.1 In vitro
Aktivitätsassays des LipB-Promotors in HEK-und COH-BR1-Zellen
.................. 62 4.2.2 LipB-Promotoraktivität in modifizierten
Mammakarzinom-Zellen .................................... 63 4.2.2.1
Charakteristika der mGPx4-Überexpression in Mammakarzinom-
Zellen............... 64 4.2.2.2 MGB1/LipB-Expression in modifizierten COH-
BR1-Zellen ..................................... 65 4.2.2.3 Vergleichende
Aktivitätsstudien von LipB-Promotorkonstrukten ............................ 66
4.3 DNA-Protein-Interaktionen am Promotor des LipB-Gens
....................................67 4.3.1 Detektion von spezifischen DNA-
Protein-Interaktionen (EMSA)..................................... 67 4.3.1.1
Kompetitionsexperimente mit unmarkierten LipB-DNA-
Sonden............................. 68 4.3.1.2 EMSA-Gelshift-Experimente mit
faktorspezifischer Kompetitor-DNA..................... 69 4.3.1.3
Differentielle DNA-Protein-Interaktion im vergleichenden Gelshift Assay
.............. 73 4.4 Experimentelle Analysen des mRNA-Transkriptes
..............................................74 4.4.1 Einfluß der mGPx4 auf
die Transkriptstabilität
................................................................ 74 4.4.2
Einfluß der mGPx4 auf die Transkriptelongation und mRNA-Reifung
............................ 75 4.5 Modifizierungen der genomischen DNA als
Regulator der Genexpression .......76 4.5.1 Verifizierung der CpG-
Hypomethylierung........................................................................
76 4.5.1.1 Einfluß der CpG-Methylierung auf die Expression von MGB1 und LipB
................ 78 4.5.2 Einfluß der Histonacetylierung auf die Expression
von MGB1 und LipB......................... 79 4.5.2.1 Analyse der Histon
H3-Acetylierung nach HDACI-Inkubation (I)............................ 79 4.5.3
Expressionsanalyse von MGB1 und LipB nach HDACI-Inkubation (I)
............................ 81 4.5.3.1 Real time-PCR zur Quantifizierung der
MGB1-Transkripte.................................... 81 4.5.3.2 Effekte von
(R)-Trichostatin A auf die LipB-
Expression.......................................... 82 4.5.4 Einfluß der
Histonacetylierung auf die Expression von MGB1 und
LipB......................... 83 4.5.4.1 Analyse der Histon H3-Acetylierung
nach HDACI-Inkubation (II)........................... 83 4.5.5
Expressionsanalyse von MGB1 und LipB nach HDACI-Inkubation (II)
........................... 84 4.5.5.1 Real time-PCR zur Quantifizierung der
MGB1-Transkripte.................................... 84 4.5.5.2 Effekte von
Natriumbutyrat auf die LipB-Expression
.............................................. 85 4.6 Einfluß von
Zellproliferation und Apoptose auf die MGB1/LipB-Expression .....87 4.6.1
Zellproliferation in HDACI-behandeltem Medium
(I)........................................................ 87 4.6.2 Die
p21WAF1/CIP1-Expression nach HDACI-Inkubation
(I).................................................. 89 4.6.3
Zellproliferation in HDACI-behandeltem Medium
(II)....................................................... 90 4.6.4 Die
p21WAF1/CIP1-Expression nach HDACI-Inkubation
(II)................................................. 91 5
Diskussion...............................................................................................
93 5.1 Expressionsregulation von Lipophilin
B...............................................................93 5.1.1
Identifizierung cis-regulatorischer
Elemente....................................................................
93 5.1.2 Vergleichendes Alignment der Promotoren von MGB1, MGB2 und LipB
....................... 96 5.1.3 Multiples Alignment der distalen 8000 bp
Upstream-Sequenz........................................ 97 5.1.4
Phylogenetische Aspekte und Konservierung in Mammalia
........................................... 98 5.2 In vitro Aktivitätsassays
des LipB-Promotors in HEK und COH-BR1-Zellen......99 5.2.1 Vergleichende
Aktivitätsstudien von Promotorkonstrukten in VC/7G4..........................
102 5.3 DNA-Protein-Interaktionen am Promotor des LipB-Gens
(EMSA).....................103 5.4 Experimentelle Analysen des mRNA-
Transkriptes: Stabilität und Elongation.104 5.5 Einfluß der CpG-Methylierung
auf die Expression von MGB1 und LipB ..........105 5.6 Einfluß der
Histonacetylierung auf die Expression von MGB1 und LipB.........106 5.6.1
(R)-Trichostatin A und Natriumbutyrat
...........................................................................
106 5.7 Einfluß von Zellproliferation und Apoptose auf die MGB1/LipB-
Expression ...108 5.7.1 (R)-Trichostatin A und Natriumbutyrat
...........................................................................
108 5.8 Abschließende Betrachtung und Ausblick
.........................................................111
dc.description.abstract
Sekretoglobuline wie Mammaglobin 1 (MGB1) und Lipophilin B (LipB) sind kleine,
selten glykosylierte Proteine, deren Expressionsmuster vorwiegend im
sekretorischen Epithel von Säugetieren nachweisbar sind. Diese liegen als
Homo- bzw. Heterodimere vor, deren genaue physiologische Bedeutung bis dato
unbekannt ist. Allerdings scheinen einigen Vertretern der SCGBs eine
funktionelle Bedeutung in der Genese diverser Tumore zuzukommen. Die
Expression von LipB sowie MGB1 ist im humanen Mammakarzinom hochreguliert.
Eine deutliche Hochregulation konnte in einer transgenen Brustkrebszelle (7G4)
gezeigt werden, die die mGPx4, ein reduzierendes Enzym mit anti-apoptotischen
Eigenschaften, überexprimiert. MGB1 ist ein relativ gut erforschter
Tumormarker für Brustkrebs. Dagegen ist nur sehr wenig über die
Expressionsregulation seines Dimerpartners LipB bekannt. Zu klärende
Kernpunkte dieser Arbeit waren deshalb zum einen die Beleuchtung der
transkriptionellen Aktivierung der LipB-Expression. Zum anderen die Diskussion
der möglichen biologischen und mechanistischen Funktion der mGPx4, die mit
einem veränderten Expressionsmuster im Brustkrebs assoziiert ist. Zur Klärung
der erst genannten Problematik konnten initiale in silico-Analysen cis-
aktivierende Elemente im proximalen LipB-Promotor identifizieren. Funktionelle
Promotorstudien bestätigten innerhalb dieser Sequenz deutliche
transkriptionelle Aktivitäten. Daran anschließende EMSA-Versuche zeigten
spezifische DNA-Protein-Interaktion der Faktoren Sp1 sowie NF1. Jedoch konnten
darin keine differentiellen Gelshifts nachgewiesen werden. Die Untersuchungen
der potentiellen Beteiligung der mGPx4 in die Transkriptelongation und
–stabilität ergaben keine signifikanten Unterschiede zwischen 7G4 und VC. Die
Erforschung epigenetischer Mechanismen wie der CpGMethylierung und
Histonacetylierung waren in ihrer Aussage uneinheitlich. 5-Aza-2’-
desoxycytidin, ein Methyltransferase-Inhibitor, bewirkte eine generelle
transkriptionelle Aktivierung. TSA und Butyrat dagegen reprimierte die
MGB1/LipBExpression. Schließlich gaben real time-PCR-Analysen Hinweise auf den
Zusammenhang von Proliferationsarrest und HDACI-induzierte
p21WAF1/CIP1-Hochregulation.
de
dc.description.abstract
Mammaglobin A (MGB1) and lipophilin B are (LipB) members of the secretoglobin
superfamily, a group of small, secretory, rarely glycosylated, dimeric
proteins with unclear physiologic functions, mainly expressed in mammalian
secretory epithelia. It seems that the secretoglobin polypeptides could be of
functional importance in the development of various human cancers. Moreover,
the expression levels of mammaglobin A in breast tumors were up-regulated and
significantly correlated with those of lipophilin B. An explicit up-regulation
was shown in a gene-modified mamma carcinoma cell (7G4), which overexpressed
the mitochondrial GPx4, a reductive and anti-apoptotic protein. Since
Mammaglobin A is a well-known marker for breast tumor, there are some studies
about his regulation and expression, but on the other hand it is still little
known about the gene regulation of its dimeric partner Lipophilin B. The aims
of the present study are on the one hand to investigate the transcriptional
activation of the LipB gene expression in 7G4 and control cells (vector
control). On the other hand the discussion about the possible biological and
mechanistic relation of GPx4 associated with the changed expression pattern of
secretoglobins in breast cancer. Initial in silico-analysis of the proximal
LipB-up streamsequenz could identify cis-acting elements. Luciferase reporter
assays confirm transcriptional activities in this promoter region. Following
studies of end-labeled DIG probes in EMSAs demonstrated specific DNA-protein-
interactions with the maximum likelihood, indicating the binding of Sp1 and
NF1. However no differential shift binding was observed. The analysis of the
involvement of the mitochondrial GPx4 in transcript stability and elongation
revealed no significant differences. Elucidating epigenetic regulatory
mechanisms (e.g. DNA Methylation and Histone Acetylation) addicted
inconsistent conclusions. The use of 5-Aza-2’-desoxycytidine confirmed general
transcriptional activity, whereas Trichostatin A and Butyrat could
downregulate MGB1/LipB gene expression in mGPx4 transfectant and vector
control. In addition, real time PCR analysis revealed the relation of cell
growth arrest and the up regulation of p21WAF1/CIP1 due to TSA/Butyrat
application.
en
dc.format.extent
[8], 138 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Gene regulation
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::572 Biochemie
dc.title
Transkriptionsregulation der Sekretoglobuline Mammaglobin 1 und Lipophilin B
in mGPx4-überexprimierenden Mammakarzinom-Zellen
dc.contributor.contact
illanes.cespedes@email.de
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. H. Kühn
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. V. Haucke
dc.date.accepted
2010-11-05
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000019839-0
dc.title.translated
Regulation of transcription of Mammaglobin A and Lipophilin B in mGPx4
overexpressing breast cancer cells
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000019839
refubium.mycore.derivateId
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open access