dc.contributor.author
Borucki, Berthold
dc.date.accessioned
2018-06-07T22:44:26Z
dc.date.available
1998-12-16T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/9594
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-13792
dc.description
0\. Titelseite und Inhaltsverzeichnis
1\. Einführung in das biologische System Bacteriorhodopsi n und Zielsetzung
1. Vorkommen und physiologische Relevanz
2. Struktur
3. Spektroskopische Charakterisierung und Funktion
4. Transiente Chromophororientierungen - Zielsetzung der Arbeit
2\. Mathematische und physikalische Grundlagen
1. Mathematische Beschreibung der Kinetik
2. Physikalische Grundlagen
3. Die Orientierung von Membranfragmenten
3\. Experimentelle Durchführung
1. Probenherstellung
2. Gleichlichtmessungen
3. Zeitaufgelöste Messungen
4\. Formale mathematische Beschreibung des Meßsignals un d Auswertungsansätze
1. Die Polarisationsabhängigkeit des Meßsignals
2. Analyse von Absorptionsänderung und Lineardichroismus
5\. Stationäre Chromophorzustände
1. Der lichtadaptierte Zustand und chromophorfreie Membranen
2. Die Licht-Dunkel-Adaptation
3. Purpurmembranen in anisotrop gequollenen Gelen
4. Der blau-pink Übergang
5. Der photostationäre M-Zustand
6. Übersicht zur Chromophororientierung stationärer Zustände
6\. Zeitaufgelöste Kontrollexperimente
1. Kontrolle der isotropen Anregung
2. Korrektur bei nicht perfekter isotroper Anregung
3. Einfluß der koaxialen Anregungskomponente
4. Der grüne Helium-Neon-Laser als Meßlichtquelle
5. Diodenlaser als Meßlichtquelle
7\. Die frühen Photozyklusintermediate
1. Experimente am nativen System: Magnetisch orientierte PM
2. Experimente am nativen System: PM in anisotrop gequollenen Gelen
3. Experimente am modifizierten System: Die Mutante D96A
4. Ergebnisübersicht zu den frühen Intermediaten
5. Diskussion der Ergebnisse und des methodischen Ansatzes
8\. Die späten Photozyklusintermediate
1. Experimente unter alkalischen Bedingungen: Das N-Intermediat
2. Experimente im schwach sauren Milieu: Das O-Intermediat
3. Ergebnisübersicht zu den späten Intermediaten
9\. Zusammenfassung
Literaturverzeichnis
dc.description.abstract
Orientierungsanderungen des Retinalchromophors, insbesondere durch
Isomerisierung, spielen eine funktionell wichtige Rolle fur den
lichtinduzierten Protonentransport beim Membranprotein Bacteriorhodopsin (bR).
Als Indikator der Chromophororientierung dient die Orientierung des
elektronischen Übergangsdipolmoments, die experimentell durch
Absorptionsspektroskopie mit linear polarisiertem Licht zuganglich ist.
Stationare und transiente Chromophorzustande von Bacteriorhodopsin wurden in
orientierten Purpurmembransystemen untersucht.
Zur Orientierung der Purpurmembranen wurde, neben der etablierten Methode
Membranen in starken Magnetfeldern auszurichten, ein alternatives Verfahren
entwickelt, bei dem durch Trocknen und anisotropes Quellen von PAA-Gelen eine
Ausrichtung der darin eingebetteten Membranen erreicht wird. Fur Gleichlicht-
und zeitaufgeloste Absorptionsmessungen mit linear polarisiertem Licht wurde
ein Meßverfahren eingefuhrt, das den Lineardichroismus und die lineare
Doppelbrechung als unabhangige Meßgroßen liefert. Da die Chromophorbeitrage
dieser Großen aber uber die Kramers-Kronig-Relationen verknupft sind, ergibt
sich hieraus eine Kontrollmoglichkeit fur die Bestimmung der
Chromophoranisotropie. Fur die zeitaufgelosten Messungen mit isotroper
Anregung wurde ein modellunabhangiges Auswertungsverfahren entwickelt, das es
erlaubt, aus Absorptionsanderung und transientem Lineardichroismus, unter
Verwendung von geeigneten Nebenbedingungen, nicht nur die Orientierung des
Übergangsdipolmoments bezuglich der Membrannormalen in transienten
Intermediaten, sondern auch die Spektren und die zeitliche
Konzentrationsverlaufe der Intermediate zu bestimmen.
Im Übergang von der all-trans Konformation zur 13-cis,15-syn Konformation, der
bei der Licht-Dunkel-Adaptation ablauft, andert sich die Orientierung des
elektronischen Übergangsdipolmoments im Rahmen der Meßgenauigkeit nicht. Die
9-cis Isomerisierung, die den photoinduzierten Übergang von der blauen Form in
den Pinkzustand begleitet, ist dagegen mit einer Zunahme des Winkels zwischen
dem Übergangsdipolmoment und der Membrannormalen um etwa 2.5° verbunden. In
den transienten Intermediaten K, L, M und N bzw. im photostationaren M-Zustand
liegt der Chromophor in einer 13-cis,15-anti Konformation vor, und der Winkel
zwischen dem Übergangsdipolmoment und der Membrannormalen ist um 1° \- 4°
kleiner als in der all-trans Konformation des bR-Grundzustands.
de
dc.description.abstract
Orientational changes of the retinal-chromophore especially via isomerization
pl ay an important role in the light-induced proton transport of the membrane
protein bacteriorhodopsin (bR). The orientation of the transition dipole
moment, which is experimentally accessi ble by absorption spectroscopy with
linearly polarized light serves as an indicator of the chromophore
orientation. Stationary and transient chromophore states of bacteriorhodopsin
were investigat ed in oriented purple membrane samples.
The orientation of the purple membranes was achieved in high magnetic fields
whi ch is a well-established method. An alternative method was developed in
which the membranes are first immobilized in PAA gels and are aligned by
drying and an isotropic swelling of the gels. In steady-state and time-
resolved absorption measurements a procedure was introd uced, which provides
linear dichroism and linear birefringence as independent paramete rs. Since
the chromophore contributions of these parameters are connected via the
Kramers-Kronig transform, this constitutes an additional control for the
determi nation of the chromophore anisotropy. For the time-resolved
measurements with isotropic excitation a novel model independent formalism was
developed, which allows the determination from absorption changes and
transient linear dichroism not only of the orientation of the transition
dipole moment with respect to the membrane normal in transient intermediates,
but also the intermediate spectra and time courses.
When the chromophore conformation changes from all-trans to 13-cis,15-syn
during light-dark adaptation, the orientation of the electronic transition
dipole moment is unchanged in the limit of experimental accuracy. The
photoinduced transition from the blue state to the pink state is accompanied
by 9-cis isomerization and an increase of the angle betwee n the transition
dipole moment and the membrane normal of about 2.5°. In the transient
intermediates K, L, M and N and in the photostationary M-state respectively
the chromophor is in 13-cis,15-anti conformation and the angle bet ween the
transition dipole moment and the membrane normal is 1° - 4° smaller than in
the all-trans conformation of the bR-groundstate.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
bacteriorhodopsin
dc.subject
purple membranes
dc.subject
chromophore reorientation
dc.subject
linear dichroism
dc.subject
linear birefringence
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::530 Physik::530 Physik
dc.title
Die Orientierung des elektronischen Übergangsdipolmoments in stationären und
transienten Chromophorzuständen der lichtgetriebenen Protonenpumpe
Bacteriorhodopsin
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Maarten P. Heyn
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. Klaus Möbius
dc.date.accepted
1998-11-11
dc.date.embargoEnd
1998-12-22
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-1998000256
dc.title.subtitle
Gleichlicht- und zeitaufgelöste Absorptionsspektroskopie mit linear
polarisiertem Licht an orientierten Purpurmembranen
dc.title.translated
The orientation of the electronic dipole moment in stationary and transient
chromophore states of the light-driven proton pump bacteriorhodopsin
en
dc.title.translatedsubtitle
Steady-state and time-resolved absorption spectroscopy with linearly polarized
light on oriented purple membranes
en
refubium.affiliation
Physik
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000000008
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/1998/25/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000000008
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