dc.contributor.author
Klose, Alexander
dc.date.accessioned
2018-06-07T22:29:09Z
dc.date.available
2002-07-29T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/9318
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-13517
dc.description
Title, Abstract, Contents
1\. Introduction and Motivation 1
I
Forward Model
2\. Photon Transport in Turbid Media 23
3\. Error Estimation 41
4\. Experimental Validation 49
II
Inverse Model
5\. Image Reconstruction as Nonlinear Optimization Problem 69
6\. Derivative Calculation 83
7\. Numerical Reconstruction Results 106
8\. Experimental Reconstruction Results 132
9\. Imaging of Rheumatoid Arthritis 141
III
Summary and Outlook
10\. Summary 163
11\. Outlook 170
Bibliography 183
Appendix 205
dc.description.abstract
Optical tomography is a non-invasive medical imaging modality that utilizes
measurements of transmitted near-infrared light to reconstruct the
distribution of optical properties inside the human body, such as for the
determination of blood oxygenation, functional imaging of brain activities,
and early diagnosis of rheumatoid arthritis in finger joints. The majority of
currently applied image reconstruction schemes rely on the validity of the
diffusion equation for the description of light propagation in tissue.
Unfortunately, the diffusion equation does not accurately describe light
propagation in media that contain low-scattering regions. This work addresses
these shortcomings by developing a novel model-based iterative image
reconstruction scheme for optical tomography. It consists of two major parts:
(1) a forward model for light propagation and (2) an inverse model. The
forward model predicts the detector readings on the tissue boundary given a
source and distribution of optical parameters inside the medium. The equation
of radiative transfer, unlike the diffusion equation, describes correctly as a
forward model the photon propagation in turbid media containing low-scattering
areas. The equation of radiative transfer is numerically solved by means of a
finite difference discrete ordinates method. In contrast, the inverse model
determines the optical parameters inside tissue, given a set of detector
readings on the boundary of tissue. The inverse model is viewed as a large-
scale nonlinear optimization problem. The measured fluence on the boundary is
compared to the predicted detector readings by defining an objective function.
The objective function is iteratively minimized by a nonlinear conjugate
gradient technique, or by quasi-Newton methods. These techniques use the first
derivative of the objective function with respect to the optical parameters
for calculating search directions towards the minimum. Forward and inverse
model are iteratively employed until self-consistency is reached. A major
obstacle is the computationally efficient calculation of the first derivative
of the objective function with respect to the optical parameters because the
objective function depends on approximately 10,000 unknown optical parameters.
We calculate the derivative by utilizing an adjoint differentiation technique
that is a particular numerical implementation of an adjoint model. We apply
the adjoint differentiation technique for the first time to the equation of
radiative transfer. We show reconstructed sagittal images of optical
parameters of a human finger joint. We emphasize the potential application for
the early diagnosis of rheumatoid arthritis in a numerical study.
de
dc.description.abstract
Die optische Tomographie mittels nah-infrarotem (NIR) Licht ist ein nicht-
invasives medizinisches Bildgebungsverfahren. Die Verteilung der optischen
Parameter (Streu- und Absorptionskoeffizient) im menschlichen Koerper wird
rekonstruiert und in Schnittbildern dargestellt. Diese Bilder liefern
medizinisch relevante Informationen, wie z.B. ueber den Zustand der
Blutoxygenierung, zur funktionellen Diagnostik von Gehirnaktivitaeten, oder
zur Fruehdiagnose der rheumatischen Arthritis in Fingergelenken. Die Mehrheit
der zur Zeit verwendeten Bildrekonstruktionsverfahren basiert auf der
Gueltigkeit der Diffusionstheorie zur Beschreibung der Lichtausbreitung in
menschlichem Gewebe. Die Diffusionstheorie beschreibt jedoch nicht korrekt die
Ausbreitung von NIR Licht in schwach streuendem Gewebe, wie z.B. bei der
cerebrospinalen Fluessigkeit im Gehirn oder bei der Synovialfluessigkeit in
Fingergelenken. Diese Arbeit behandelt erstmals die Rekonstruktion der
optischen Parameter mittels der Transporttheorie zur Lichtausbreitung in stark
und schwach streuendem Gewebe. Es wurde ein modellbasiertes iteratives
Bildrekonstruktionsverfahren entwickelt, das aus zwei Teilen besteht: (1) ein
Vorwaertsmodell zur Lichtausbreitung und (2) ein inverses Modell zur
Bestimmung der optischen Parameter im NIR. Das Vorwaertsmodell basiert auf der
Gleichung fuer Strahlunstransport, welche die Lichtausbreitung auch in schwach
streuendem Gewebe korrekt beschreibt. Das Vorwaertsmodell berechnet mittels
eine Finite-Differenzen Diskrete-Ordinaten Verfahrens die NIR-Detektorsignale
am Geweberand bei gegebener Position der NIR-Lichtquelle und einem sinnvoll
gewaehlten Startwert der Verteilung der optischen Parameter. Das inverse
Modell, andererseits, bestimmt die unbekannten optischen Parameter im Gewebe
bei gegebenen Detektorsignalen des Vorwaertsmodells und gemessenen
Detektorsignalen des Experiments. Die gemessenen Detektorsignale werden mit
den berechneten Detektorsignalen mittels einer definierten Zielfunktion
(Optimierungsfunktion) verglichen. Diese Zielfunktion wird mit Hilfe
nichtlinearer Optimierungsverfahren (konjugierte Gradientenverfahren, Quasi-
Newton-Verfahren) minimiert. Diese Verfahren benutzen die erste Ableitung der
Zielfunktion nach den optischen Parametern (Gradient), um eine Suchrichtung,
die in Richtung des Minimums zeigt, bestimmen zu koennen. Die optischen
Parameter am Punkt des Minimums werden in einem Schnittbild dargestellt. Ein
Hauptproblem der Optimierungsverfahren ist die zeiteffiziente numerische
Berechnung des Gradienten, da die Objektfunktion eine Funktion von ca. 10.000
unbekannten optischen Parametern ist. Deshalb wird die Methode der
Differenzierung von Algorithmen ("adjoint differentiation") verwendet, welche
eine numerische Umsetzung eines "adjoint models" darstellt. Dieses Verfahren
wurde erstmals auf die Strahlungstransportgleichung angewendet. Die verwendete
Zeit zur numerischen Berechnung des Gradienten entspricht ca. der Zeit, die
zum numerischen Loesen der Transportgleichung im Vorwaertsmodell benoetigt
wurde. Rekonstruierte Schnittbilder der optischen Parameter von menschlichen
Fingergelenken wurden erstmals in dieser Arbeit praesentiert, die zur
Fruehdiagnose der rheumatischen Arthritis verwendet werden koennen.
de
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
optical tomography
dc.subject
equation of radiative transfer
dc.subject
finite difference method
dc.subject
adjoint differentiation
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::530 Physik::530 Physik
dc.title
Optical Tomography Based on the Equation of Radiative Transfer
dc.contributor.firstReferee
Prof. Juergen Beuthan
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Klaus D. Kramer
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Andreas H. Hielscher
dc.date.accepted
2001-11-14
dc.date.embargoEnd
2002-08-15
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2002001355
dc.title.translated
Optische Tomographie basierend auf der Gleichung fuer Strahlungstransport
de
refubium.affiliation
Physik
de
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FUDISS_thesis_000000000695
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2002/135/
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FUDISS_derivate_000000000695
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free
dcterms.accessRights.openaire
open access