dc.contributor.author
Hoffmann, Peter
dc.date.accessioned
2018-06-07T15:20:45Z
dc.date.available
2017-05-29T09:26:19.009Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/929
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-5131
dc.description.abstract
Einleitung: Für eine zuverlässige, qualitätsgesicherte Diagnostik ist es sehr
wichtig, mögliche Einflussgrößen und Störfaktoren einer
laboratoriumsmedizinischen Untersuchung zu erkennen. Störfaktoren müssen
minimiert werden, Einflussgrößen sind bei der Beurteilung von Messergebnissen
zu berücksichtigen. In dieser Arbeit wurden sowohl manuelle, als auch eine
automatisierte routinediagnostische Methode auf das Vorhandensein von
Störfaktoren untersucht. Die Auswirkungen einer hochgradig entzündlichen
Erkrankung als Einflussgröße für etablierte und neue laboratoriumsmedizinische
Parameter wurden analysiert. Methodik: Die Richtigkeit der Messungen des
Urinchemie-Analysators iChem Velocity wurde getestet und mit den Ergebnissen
des Clinitek Atlas verglichen. Es wurde untersucht, ob RNAund
Proteinrückstände in DNA-Präparationen die Leseweite oder den Lesefehleranteil
bei DNASequenzierungen beeinflussen. Des Weiteren wurde analysiert, mit
welcher Methode kleinste Mengen an DNA optimal aufgereinigt werden können. Der
Anstieg und das Absinken der Parameter C-reaktives Protein, Procalcitonin,
Leukozyten- und Thrombozytenzahl, Granularitäts-Index und δ-Hämoglobin während
einer hochgradig entzündlichen Erkrankung wurden untersucht. Ergebnisse: Der
iChem Velocity detektierte Hämoglobin und Leukozyten mit einer AUC von 0,73
und 0,78. Bei der Analyse von 257 Urinproben traten 19 falsch-negative
Messungen von Erythrozyten und 32 falsch-negative Leukozytenbestimmungen auf.
Versuche zum Vergleich verschiedener DNA-Isolationsmethoden ergaben, dass in
den Präparationen verbliebene Proteinrückstände mit dem Auftreten von
Lesefehlern bei einer anschließenden DNA-Sequenzierung korrelierten (r =
0,63). Bei der Aufreinigung von Plasmid-DNA erzielte die Verwendung einer
Säule mit Silika-Membran die besten Resultate in DNA-Rückgewinnung und
Zeitaufwand. Es wurden Parameter-Verlaufskurven für Entstehung und Abklingen
einer Entzündung erstellt. Schlussfolgerungen: In der weiteren Entwicklung des
iChem Velocity sollte die Sensitivität erhöht werden. DNA-Präparationen für
Sequenzierungsreaktionen sollten frei von Proteinrückständen sein. Die
optimale Reinigungsmethode für Plasmid-DNA ist eine Säule mit Silika- Membran.
Die Parameterkurven geben Aufschluss über den am besten geeigneten Zeitrahmen
für die Entzündungsdiagnostik.
de
dc.description.abstract
Background: Reliable, quality assured diagnostics require the detection of
potential interferents and influencing variables. The presence of interferents
has to be minimized, and influencing variables have to be taken into account
when assessing measurement results. In this study, manual as well as automated
routine diagnostic methods were examined for the presence of interferents. The
effects of a high-grade inflammation as influencing variable for established
and novel laboratory medicine parameters were analyzed. Methods: The accuracy
of the urine chemistry analyzer iChem Velocity was tested and compared with
the results of a Clinitek Atlas. It was investigated if RNA and protein
remainders in DNA preparations affect the read length or the percentage of
reading errors made during DNA sequencing. In addition, it was analyzed which
method provides optimal results for the purification of small amounts of DNA.
The increase and decrease of the parameters C-reactive protein, procalcitonin,
leukocyte and thrombocyte count, granularity index, and δ-hemoglobin were
examined during a high-grade inflammation. Results: The iChem Velocity
detected hemoglobin and leukocytes with an AUC of 0.73 and 0.78. During the
analysis of 257 urine samples, 19 false negative measurements of erythrocytes
and 32 false negative results for leukocytes occurred. Experiments comparing
different DNA isolation methods showed, that protein remainders in the DNA
preparations correlated with the occurrence of reading errors during
subsequent DNA sequencing (r = 0.63). For the purification of plasmid DNA,
using a micro column with silica membrane achieved the best results in DNA
recovery and time requirement. Trajectories for the parameters' dynamics
during the onset and resolution of an inflammation were calculated.
Conclusions: The sensitivity of the iChem Velocity should be increased in the
ongoing development process. DNA preparations for sequencing reactions should
be free of protein contaminants. The ideal purification method for plasmid DNA
is a column with silica membrane. The parameter trajectories show the most
suitable time frame for inflammation diagnostics.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
influencing variables
dc.subject
DNA sequencing
dc.subject
inflammatory markers
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Auswirkungen von Störfaktoren und Einflussgrößen auf die Ergebnisse
laboratoriumsdiagnostischer Methoden
dc.contributor.firstReferee
N.N.
dc.contributor.furtherReferee
N.N.
dc.date.accepted
2017-06-25
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000104287-2
dc.title.translated
Effect of interferents and influencing variables on the results of laboratory
diagnostic methods
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000104287
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000021123
dcterms.accessRights.dnb
free
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open access