dc.contributor.author
Welte, Yvonne
dc.date.accessioned
2018-06-07T21:26:36Z
dc.date.available
2013-08-28T12:16:02.230Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/7901
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-12100
dc.description
Abbreviations viii List of figures x List of tables xii Abstract in English
xiii Abstract in German xiv 1 Introduction 1 1.1 Human skin 1 1.1.1
Melanogenesis 2 1.2 Malignant melanoma 3 1.2.1 Epidemiology and etiology 3
1.2.2 Pathophysiology 5 1.2.3 Diagnosis, classification and staging of
melanoma 6 1.2.4 Therapy of malignant melanoma 9 1.3 Cancer stem cells 10
1.3.1 History of the CSC theory 10 1.3.2 CSCs and the failure of conventional
cancer therapies 11 1.3.3 Current standards of identification 13 1.4 Human
embryonic and tissue stem cells 18 1.4.1 Characteristics 18 1.4.2 Importance
of TGF-β signaling for hESC self-renewal 19 1.4.3 Pluripotency factor OCT4 20
1.5 Aims of this work 23 2 Materials and Methods 24 2.1 Materials 24 2.2 Cell
culture 32 2.2.1 Establishment of primary cell cultures 32 2.2.2 Maintenance
of primary cell cultures 33 2.2.3 Melanocyte culture 33 2.2.4 Cell culture
with hESC medium 33 2.3 Cell sorting 34 2.3.1 MACS 34 2.3.2 FACS 34 2.4 RNA
and DNA analyses 34 2.4.1 Isolation and quantification of genomic DNA 34 2.4.2
RNA isolation and quantification 35 2.4.3 Reverse transcription 35 2.4.4
Primer design 35 2.4.5 Standard polymerase chain reaction (PCR) 35 2.4.6 Real-
time polymerase chain reaction (real-time PCR) 36 2.4.7 Gel electrophoresis 37
2.4.8 Restriction digest 37 2.4.9 Synthesis of biotin-labelled cRNA and
Illumina Bead Chip hybridization 37 2.4.10 Gene expression and cluster
analyses 38 2.4.11 Cell cycle analysis 38 2.5 Cycle Sequencing 39 2.6 Whole
transcriptome mRNA sequencing 40 2.6.1 rRNA removal 40 2.6.2 Ethanol
precipitation 40 2.6.3 Double-stranded cDNA synthesis 40 2.6.4 Sequencing data
analysis 40 2.7 Plasmid works 41 2.7.1 phOCT4-EGFP-1 construct 41 2.7.2
Transformation and E. coli culture 42 2.7.3 Isolation of plasmid DNA 42 2.7.4
Plasmid transfection 43 2.7.5 Cultivation of stable clones 43 2.8 Protein
analyses 43 2.8.1 Protein isolation and quantification 43 2.8.2 Fractionation
of total protein lysates 43 2.8.3 SDS-PAGE gel electrophoresis 44 2.8.4
Western blotting 44 2.8.5 Immunocytochemistry 45 2.9 Functional assays 45
2.9.1 Dye exclusion assay 45 2.9.2 Drug resistance analyses 46 2.9.3
Anchorage-independent growth assay 46 2.9.4 Invasion and mobility assays 47
2.10 Xenotransplantation 48 3 Results 50 3.1 Identification of CSCs in
malignant melanoma by established methods 50 3.1.1 Spheroid formation under ES
cell culture conditions 50 3.1.2 Identification of a Hoechst SP in most
melanoma cell lines 51 3.1.3 Expression of putative CSC markers in melanoma
cell lines 52 3.2 Comparison of CD133+ and CD133- melanoma cells 57 3.2.1
CD133 related gene expression profiling 58 3.2.2 Activated FGF pathway in
CD133+ melanoma cells 60 3.2.3 Whole transcriptome mRNA sequencing of CD133+
and CD133- melanoma cells 60 3.2.4 Is the CD133 expression epigenetically
regulated? 61 3.2.5 Functional comparison of CD133+ and CD133- cells 63 3.3
Dynamic of CD133 expression 68 3.4 Analysis of OCT4A expression in melanoma
cells 72 3.4.1 OCT4A is expressed in melanoma cells 72 3.4.2 Differential
expression of OCT4A between CD133+ and CD133- melanoma cells 73 3.4.3 Sorting
of OCT4-EGFP+ and OCT4-EGFP- melanoma cells 74 3.4.4 Comparison of OCT4-EGFP+
and OCT4-EGFP- melanoma cells 77 4 Discussion 81 4.1.1 Sphere formation assays
81 4.1.2 Dye exclusion assay 82 4.1.3 Expression of CSC markers 84 4.2 CD133+
melanoma cells comprise stem cell characteristics 88 4.2.1 Rare differential
SNPs between CD133+ and CD133- cells on transcript level 90 4.2.2 Epigenetic
regulation of CD133 90 4.3 Functional comparison of CD133+ and CD133- cells 92
4.3.1 BRAF mutations and targeted therapy for malignant melanoma 93 4.3.2 Drug
resistance 95 4.4 Dynamic cell state transitions in tumors challenge cancer
therapy concepts 95 4.5 Expression of the pluripotency factor OCT4A in rare
melanoma cells 99 4.5.1 Data misconception 99 4.5.2 OCT4-EGFP+ melanoma cells
overrepresent stem cell related pathways 100 4.6 Tumorigenic abilities of CSCs
in in vivo experiments 103 4.7 Categorization of CSCs 106 5 Conclusion and
perspectives 108 References 110 Appendix 125 Publications 125 Curriculum vitae
126 Supplementary tables 128
dc.description.abstract
Cutaneous malignant melanomas result from neoplastic growth of melanocytes and
are the most severe type of skin cancer. To improve overall survival, a better
understanding of melanoma tumorigenesis is needed. Recent findings suggest
that within almost all solid tumors in anology to hematopoetic tumors a small
subpopulation of tumor cells exculsively have tumor initiating and propagating
capacity. These so called cancer stem cells (CSCs) might also be the reason
for the high rate of therapy failure, tumor relapse and metastasis. This study
was aimed at establishing useful methods and identifying markers or
combinations of markers to characterize CSCs in low-passage melanoma cells.
After establishing primary melanoma cell cultures I identified subpopulations
of melanoma cells that express CD133, which is correlated with asymmetric cell
division and downregulated upon cell differentiation and OCT4A the master
regulator of pluripotency. I enriched CD133+ as well as OCT4A+ cells from the
bulk and found that crucial regulatory pathways related to oncogenesis and
stemness such as Wnt, Hedgehog and Notch signaling are significantly
overexpressed in the respective positive populations. I validated these
results for the TGF-β signaling pathway, which is crucial to maintain the
undifferentiated state in human embryonic stem cells (hESCs) on the protein
level. I found this cascade exclusively activated in CD133+ melanoma cells. In
addition, an overlap of both putative CSC populations was indicated by the
overexpression of OCT4A in the CD133+ subpopulation compared to CD133-
melanoma cells and vice versa. In vivo experiments showed enhanced tumor
growth capabilities of CD133+ and OCT4A+ melanoma cells compared to their
negative counterparts. Thus, CD133+ and particularly OCT4A+ melanoma cells
comprise both the characteristics of stem-like cells and malignant tumors and
provide strict criteria for self-renewal and asymmetric cell division to hold
up the term of CSCs in solid tumors. Targeting these cells may lead to a more
successful tumor intervention in the future. The dynamic conversion of tumor
cell phenotypes that I have observed in my work could substantially hamper a
successful therapeutic intervention. Until recently it was believed that tumor
heterogeneity was due to a strict hierarchical order where only dedicated CSCs
could fuel tumor-development and -fate in an unidirectional manner. My results
indicate that a dynamic plasticity between both CSC and bulk tumor populations
exists, which would explain tumor survival and rapid adaptation to unfavorable
microenvironments like chemo- and radiotherapy. Further characterization of
melanoma cancer stem cells and elucidation of the interconversion between
tumor cell populations will be an important prerequisite for a lasting
prevention of tumor recurrence and metastasis and may pave the way for better
understanding tumor biology.
de
dc.description.abstract
Das kutane maligne Melanom, eine bösartige Entartung der Melanozyten, stellt
die gefährlichste Form von Hautkrebs dar. Um die Gesamtüberlebenszeit der
Melanom¬patienten zu verlängern, ist ein besseres Verständnis der Mechanismen
der Melanom-Tumorigenese notwendig. Studien legen nahe, dass fast alle Tumore
eine kleine Subpopulation von Tumorzellen enthalten, die ausschließlich die
Fähigkeit zur Tumorinitiierung und Selbsterneuerung besitzen. Diese
sogenannten Krebsstammzellen stellen vermutlich auch die Ursache für das
häufige Therapieversagen, sowie das Auftreten von Tumorrezidiven und
Metastasen dar. Ziel dieser Arbeit war die Etablierung geeigneter Methoden und
Identifizierung eines geeigneten Markers oder einer Markerkombination für die
Charakterisierung von Krebsstammzellen in primären, niedrig-passagigen
Melanomzellen. Nach Etablierung primärer Melanom-Zellkulturen habe ich
Subpopulationen von Melanomzellen identifiziert, die CD133 exprimieren, einem
Marker, der mit asymmetrischer Zellteilung korreliert und während der
Zelldifferenzierung herunterreguliert wird, sowie OCT4A, den wichtigsten
Regulator der Pluripotenz. Ich habe CD133+ und OCT4A+ Zellen aus den
Melanomkulturen isoliert und herausgefunden, dass wichtige regulatorische
Entwicklungs- sowie krebsbezogene Signalwege signifikant in diesen Marker-
positiven Populationen hochreguliert sind. Für den TGF-β-Signalweg, der in
humanen embryonalen Stammzellen essenziell ist, um den undifferenzierten
Zustand zu erhalten, habe ich diese Ergebnisse auf Proteinebene validiert. Die
TGF-β-Kaskade war ausschließlich in CD133+ Melanomzellen aktiviert. Eine
Überschneidung von beiden putativen Krebsstammzell-Populationen wurde außerdem
durch Überexpression von OCT4A in der CD133+ Subpopulation im Vergleich zur
CD133- Fraktion und vice versa angezeigt. In vivo Experimente zeigten
schließlich, dass CD133+ und OCT4A+ Melanomzellen stärkere Tumor-initiierende
und -propagierende Eigenschaften besitzen als CD133- und OCT4A- Zellen. Somit
weisen CD133+ und OCT4A+ Melanomzellen sowohl die Eigenschaften von
Stammzellen als auch malignen Tumorzellen auf und bieten strenge Kriterien für
Selbsterneuerung und asymmetrische Zellteilung, um dem Begriff
Krebsstammzellen in soliden Tumoren gerecht zu werden. Auf diese Zellen
gerichtete Therapien könnten in der Zukunft effizientere Strategien zur
Heilung von Melanompatienten darstellen. Die dynamische Konversion zwischen
Krebsstammzell- und nicht-stammzellartigen Populationen, die ich während
meiner Doktorarbeit beobachtet habe, könnte eine erfolgreiche therapeutische
Intervention jedoch erschweren, weil sie das Tumorüberleben und eine rasche
Adaption an Veränderungen im Tumorumfeld wie bei Chemo- und Strahlentherapie
ermöglicht. Eine weitere Aufklärung der gegenseitigen Umwandlung von
Tumorzellpopulationen wird die Voraussetzung für eine langanhaltende
Verhinderung von Tumorrezidiven und Metastasen sein.
de
dc.format.extent
XV, 133 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
cancer stem cells
dc.subject
primary cell culture
dc.subject
dynamic Equilibrium
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
Identification and characterization of cancer stem cells in cutaneous
malignant melanoma
dc.contributor.firstReferee
Prof. Petra Knaus
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Hans Lehrach
dc.date.accepted
2013-04-23
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000094840-7
dc.title.translated
Identifizierung und Charakterisierung von Krebsstammzellen im kutanen malignen
Melanom
de
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000094840
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000013832
dcterms.accessRights.dnb
free
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open access