dc.contributor.author
Elges, Sandra
dc.date.accessioned
2018-06-07T19:01:38Z
dc.date.available
2017-12-07T10:44:49.845Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/5676
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-9875
dc.description.abstract
Die im Rahmen allogener Stammzelltransplantationen (allo-SZT) bei Patienten
mit hämatologisch-onkologischen Erkrankungen therapeutisch induzierte
Immunsuppression geht als Komplikation häufig mit Infektionen durch Bakterien
und Pilze einher. Als Goldstandard der Erregerdiagnostik gilt die Blutkultur
(BK), wobei hier nur in etwa einem Viertel der Blutproben von Patienten mit
Fieber in der Phase der Granulozytopenie Erreger nachweisbar sind. Ziel dieser
Studie war die prospektive Evaluation des LightCycler® SeptiFast Tests (SF-
Test), eines kommerziell erhältlichen Multiplex-PCR-Verfahrens zum Nachweis
der 25 häufigsten Sepsiserreger (Bakterien und Pilze) aus dem Vollblut, bei
hämatologisch-onkologischen Patienten nach allo-SZT im Vergleich zur BK und
einer pilzspezifischen Inhouse-PCR-Methode (IH-Methode). Von 104 Patienten
nach allo-SZT wurden insgesamt 847 Blutproben (225 Proben bei Fieber, 622
wöchentliche Routineproben) gewonnen und mittels SF-Test und IH-Methode
untersucht sowie 205 bei Fieber angelegte Blutkulturen analysiert. Bei Fieber
war der SF-Test in 26,2% (59/225), die BK in 19,2 % (38/198) der Fälle
positiv. Insgesamt waren 74 Erreger mittels SF-Test und/oder BK nachweisbar
(SF-Test + BK: n=24, nur SF-Test: n=34, nur BK: n=16). Beide Methoden
detektierten jeweils am häufigsten die bakteriellen Erreger CoNS und
Escherichia coli, polymikrobielle Infektionen waren mittels BK bei einem,
mittels SF-Test bei vier septischen Patienten nachweisbar. Bei kulturell
gesicherter bakterieller Sepsis war der SF-Test in fünf Fällen falsch negativ.
Die Übereinstimmungsrate von SF-Test und BK lag bei 86,6 %. Im Vergleich zur
BK als Goldstandard erreichte der SF-Test eine Sensitivität von 66 %, eine
Spezifität von 91 %, einen positiven Vorhersagewert (PPV) von 62 % und einen
negativen Vorhersagewert (NPV) von 92 %. Während die BK für Pilze negativ
ausfielen, waren mittels SF-Test und/oder IH-Methode bei Fieber 28 Pilze (SF-
Test + IH-Methode: n=2, nur SF-Test: n=20, nur IH-Methode: n=6) und im Rahmen
der Routineproben (kein Fieber) 60 Pilze (SF-Test + IH-Methode: n=0, nur SF-
Test: n=8, nur IH-Methode: n=52), vorwiegend Candida albicans, nachweisbar.
Nach EORTC-MSG-Diagnosekriterien wiesen 15/104 Patienten (6,9 %) eine
wahrscheinliche (n=2) oder mögliche (n=13) invasive Mykose (IFD) auf. SF-Test
(n=9) und IH-Methode (n=1) bestätigten eine der beiden wahrscheinlichen IFD
(invasive pulmonale Aspergillose). SF-Test und IH-Methode zeigten (gegenüber
den EORTC-MSG-Kriterien) mit 98,3% bzw. 97,2 % einen hohen NPV und mit 99,3 %
bzw. 93,4 % eine hohe Spezifität. PPV (60,0 %) und Sensitivität (39,1 %) des
SF-Tests waren mäßig, PPV und Sensitivität der IH-Methode gering (PPV=1,9 %,
Sensitivität=4,3 %). Zusammenfassend bietet der SF-Test eine schnelle
Möglichkeit der Erregerdetektion aus dem Vollblut und stellt damit eine
sinnvolle ergänzende Methode, insbesondere zur Identifikation polymikrobieller
und fungaler Infektionen, bei hämatologisch-onkologischen Patienten nach allo-
SZT dar.
de
dc.description.abstract
The therapeutically induced immuosuppression within the context of allogeneic
stem cell transplantation (allo-SCT) in patients with
haematological/oncological diseases is frequently accompanied as a
complication by bacterial and fungal infections. Blood culture (BC) is
considered the gold standard in pathogen diagnostics, though pathogens are
detectable in this case in only approximately a quarter of blood samples from
patients with fever in the granulocytopenic phase. The aim of this study was
prospective evaluation of the LightCycler® SeptiFast Test (SF-Test), a
commercially available Multiplex PCR method for detecting the 25 most frequent
sepsis-causing pathogens (bacteria and fungi) from whole blood, in
oncohaematological patients undergoing allo-SCT compared to BC and a fungus-
specific in-house PCR method (IH-Method). A total of 847 blood samples were
obtained from 104 patients undergoing allo-SCT (225 samples during fever, 622
weekly surveillance samples) and were analyzed using the SF-Test and IH-
Method; in addition, 205 BC were taken and analyzed when fever occurred.
During fever, the SF-Test was positive in 26.2% (59/225) of cases and BC in
19.2 % (38/198) of cases. A total of 74 pathogens were detectable using the
SF-Test and/or BC (SF-Test + BC: n=24, only SF-Test: n=34, only BC: n=16).
Both methods respectively most frequently detected the bacterial pathogens
CoNS and Escherichia coli; polymicrobial infections were detectable in one
septic patient by BC and in four by SF-Test. In bacterial sepsis confirmed by
culture, the SF-Test was falsely negative in five cases. The concordance rate
of the SF-Test and BC was 86.6%. In comparison to BC as the gold standard, the
SF-Test achieved a sensitivity of 66%, a specificity of 91%, a positive
predictive value (PPV) of 62% and a negative predictive value (NPV) of 92%.
Whereas the BC were negative for fungi, 28 fungi were detectable during fever
using SF-Test and/or IH-Method (SF-Test + IH-Method: n=2, only SF-Test: n=20,
only IH-Method: n=6) and 60 fungi during surveillance (SF-Test + IH-Method:
n=0, only SF-Test: n=8, only IH-Method: n=52), predominately Candida albicans.
According to EORTC/MSG diagnostic criteria, 15/104 patients (6.9 %) presented
with a probable (n=2) or possible (n=13) invasive mycosis (IFD). SF-Test (n =
9) and IH-Method (n = 1) confirmed one of two probable IFDs (invasive
pulmonary aspergillosis). SF-Test and IH-Method showed (with regard to
EORTC/MSG criteria) with respectively 98.3% and 97.2% a high NPV and with
99.3% and 93.4% a high specificity. PPV (60.0 %) and sensitivity (39.1 %) of
the SF-Test were moderate; PPV and sensitivity of the IH-Method were low
(PPV=1.9 %, sensitivity =4.3 %). In summary, the SF-Test offers a rapid
possibility for pathogen detection based on whole blood and therefore
represents a useful supplementary method, particularly for identification of
polymicrobial and fungal infections in oncohaematological patients undergoing
allo-SCT.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
allogeneic stem cell transplantation
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Evaluierung des SeptiFast-Testsystems bei hämatologischen Patienten nach
Stammzelltransplantation/ Knochenmarktransplantation im Vergleich zur
Blutkultur und einem alternativen PCR-System
dc.contributor.firstReferee
N.N.
dc.contributor.furtherReferee
N.N.
dc.date.accepted
2017-12-08
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000105709-2
dc.title.translated
Evaluation of the SeptiFast test in haematological patients undergoing stem
cell transplantation/ bone marrow transplantation compared to blood culture
and an alternative PCR system
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000105709
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000022524
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access