dc.contributor.author
Hostmann, Arwed
dc.date.accessioned
2018-06-07T18:01:10Z
dc.date.available
2008-05-08T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/4518
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-8718
dc.description
Gesamtdissertation
dc.description.abstract
Die komplexe Pathogenese allergischer Erkrankungen und des Asthma bronchiale
macht die Entwicklung neuer Therapieansätze notwendig. Von grundlegender
pathophysiologischer Bedeutung für die Entstehung allergischer Erkrankungen
sind die Zytokine IL-4 und IL-13. In der IL-4- und IL-13-vermittelten
Signaltransduktion nimmt der Transkriptionsfaktor STAT6 eine zentrale Stellung
ein. Untersuchungen an stat6-knockout-Mäusen zeigen, daß stat6 für die
Ausprägung des allergischen Phänotypes wesentlich ist. Mit der Anwendung von
Ribozymen und DNAzymen wird eine therapeutische Strategie auf Nukleinsäure-
Basis zur spezifischen Spaltung der mRNA des Transkriptionsfaktors stat6 der
Maus verfolgt. Die in der vorliegenden Arbeit verwendeten mstat6-spezifischen
Ribozyme besitzen eine GUC-Konsensussequenz und 6 nt lange Bindungsarme.
Potentielle Ribozym-Spaltstellen werden auf der Grundlage von
Sekundärstrukturberechnungen der mstat6-RNA identifiziert und liegen in
einzelsträngigen Loop-Strukturen. Für eine stabile Expression werden die für
die Ribozyme kodierenden Oligonuleotide in die Expressionskassette pGvaL
kloniert. Insgesamt finden drei mstat6-spezifische Ribozyme Verwendung, deren
Aktivität unter zellfreien Bedingungen getestet wird. Alle drei untersuchten
Ribozyme sind in-vitro nicht aktiv. Unter Verwendung eines Multiplex-
Aktivitäts-Assays wird auf der RNA des stat6 der Maus ein Screening nach
zugänglichen DNAzym-Spaltstellen vorgenommen. Die dafür eingesetzten DNAzyme
haben eine RU-Konsensussequenz (R = A, G) und besitzen Bindungsarme mit einer
Länge von jeweils 9 nt. Für die Lokalisation der Bindungsstellen ist die
thermodynamische Stabilität ∆G0 der DNAzym-Substrat-Heteroduplex entscheidend.
Die reziproke Korrelation von DNAzym-Aktivität und ∆G0 führt zur Auswahl von
41 DNAzym-Spaltstellen mit einem ∆G0 von jeweils ≤ \- 25 kcal/mol im
Sequenzbereich von 150 - 600 bp sowie von 1,7 - 2 kb. Für die Auswahl des
Sequenzbereiches 1,7 - 2 kb ist die Beschreibung von humanen
stat6-Spleißvarianten von Bedeutung, da diese auf einer Deletion im
Sequenzbereich von 1765 - 1863 bp beruhen. Von den 41 im Multiplex-Aktivitäts-
Assay getesteten DNAzymen weisen acht DNAzyme eine Spaltungsaktivität auf. Die
Testung aller acht DNAzyme in einem zellfreien System ergibt, daß sie über
einen Zeitraum von 60 min aktiv sind. In weiterführenden Experimenten wird zu
prüfen sein, ob die unter zellfreien Bedingungen aktiven DNAzyme auch in
Zellkulturen sowie allergischen Mausmodellen wirksam sind.
de
dc.description.abstract
The highly complex pathogenesis of allergic diseases such as asthma requires
the development of new and specific therapeutical approaches. Both
Interleukine-4 and Interleukine-13, respectively, are attributed to play an
essential role in the development of allergic asthma via activation of the
signal transducer and activator of transcription 6 (STAT6). Investigation of
stat6-deficient allergic mice demonstrated that stat6 is critical involved in
the allergic phenotype. By the application of ribozymes and DNAzymes a nucleic
acid based therapeutical strategy was choosen to investigate whether murine
stat6 mRNA could be specifically cleaved in-vitro. Murine stat6-specific
ribozymes adopted a GUC consensus sequence with binding arms of both 6 nt and
were developed on the basis of computational secondary structure calculation
of the murine stat6 transcript. For stable ribozyme expression a recently
described pGvaL expression cassette was used. However; all tested ribozymes
did not show any in-vitro activity. With the use of a multiplex activity assay
the murine stat6 transcript was screened for DNAzyme cleavage sites. The
converse correlation between the thermodynamic stability of the DNAzyme-
substrate heteroduplex and an improved DNAzyme activity revealed potential
cleavage sites on the murine stat6 transcript. Within 41 DNAzymes tested in
the multiplex assay eight DNAzymes showed distinct cleavage activities on the
transcript. Subsequently, the results were strongly confirmed in a cell-free
system. The used DNAzymes had RU consensus sequences with R = A, G and binding
arms of 9 nt. Additional in-vitro analyses provide evidence that these
stat6-specific DNAzymes were active over a time period of 60 minutes. Further
experiments have to test the murine stat6-specific DNAzymes in cell based
systems and appropriate allergic mice models.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Entwicklung einer therapeutischen Strategie bei Allergie und Asthma unter
Einsatz von Ribozymen und DNAzymen
dc.contributor.firstReferee
PD Dr. Wolfgang Henke
dc.contributor.furtherReferee
PD Dr. med. A. L. Oberholzer
dc.contributor.furtherReferee
PD Dr. med. Andreas Lun
dc.date.accepted
2008-06-01
dc.date.embargoEnd
2008-05-14
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000003680-2
dc.title.translated
Development of a Ribozyme an DNAzyme mediated therapeutical strategy against
allergy and asthma
en
refubium.affiliation
Charité - Universitätsmedizin Berlin
de
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http://www.diss.fu-berlin.de/2008/313/
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