dc.contributor.author
Dittrich, Nickel
dc.date.accessioned
2018-06-07T16:54:16Z
dc.date.available
2015-03-12T14:32:10.775Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/3122
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-7322
dc.description.abstract
Hintergrund: Die Tuberkulose, eine durch Mycobacterium tuberculosis
hervorgerufene Infektion, ist auch heute noch ein globales Gesundheitsproblem.
Die Tuberkulose Suszeptibilität variiert stark unter infizierten Individuen
und das Erkennen der Mykobakterien durch das angeborene Immunsystem
beeinflusst wahrscheinlich den Krankheitsverlauf und -ausgang. Diese Arbeit
beschreibt SNPs in den Toll-like Rezeptoren, welche die angeborene
Immunantwort auf Mycobacterium tuberculosis verändern und die mit Tuberkulose
in Südindien assoziiert sind. Methoden: Eine SNP Datenbank mit Informationen
zu den jeweiligen Toll-like Rezeptor Polymorphismen und deren potentiellem
Einfluss auf die Proteinstruktur wurde angelegt. In Hyderabad, Indien wurden
eine Kohorte mit Tuberkulosepatienten und eine mit gesunden Kontrollen
generiert. 206 Tuberkulose Patienten und 236 gesunde Kontrollen wurden auf
SNPs in den Toll-like Rezeptoren 1, 2, 4, 7 und 8 hin untersucht. Das
Vorhandensein dieser genetischen Variationen wurde anschließend mit
Tuberkulose Suszeptibilität korreliert. Um individuelle Reaktionen auf
Mycobacterium tuberculosis Lysate zu untersuchen wurden HEK293 Zellen mit
Varianten eines Toll-like Rezeptor 1 SNPs transfiziert und PBMCs von
genotypisierten, gesunden deutschen Individuen mit den entsprechenden Liganden
in vitro stimuliert. Nach Stimulation wurden die NF-κB-Aktivierung bzw. TNF -
Produktion gemessen. Zur statistischen Auswertung der Kohorten wurde ein
Computerprogramm entwickelt und potentielle Auswirkungen des Toll-like
Rezeptor 1 SNPs wurden in silico modelliert. Ergebnisse: Die Kohorten-Analyse
ergab die Assoziation eines Toll-like Rezeptor 1 SNPs (248N, rs4833095) und
eines Toll-like Rezeptor 8 SNPs (1M, rs3764880) mit Schutz vor TB und die
Assoziation eines TLR4 SNPs (299D, rs4986790) mit erhöhtem Tuberkulose-Risiko
bei Frauen. Funktionelle Untersuchungen an HEK Zellen, die mit Toll-like
Rezeptor 1-248N transfiziert und mit Mycobacterium tuberculosis stimuliert
wurden, zeigten eine erhöhte NF-κB Aktivierung bei dieser Toll-like Rezeptor 1
Genvariante. Zusätzlich wiesen Toll- like Rezeptor 1-248N exprimierende PBMCs
von gesunden Kontrollen eine erhöhte TNFs Antwort auf Mycobacterium
tuberculosis Lysate auf. Die in silico Modellierung zeigte eine deutliche
Veränderung der Proteinstruktur von Toll-like Rezeptor1 durch die Mutation der
Aminosäure 248, die die funktionellen Veränderungen erklären könnte. Fazit:
Der SNP Toll-like Rezeptor 1-248N ist mit Schutz vor Tuberkulose in einer
indischen Bevölkerung assoziiert, führt zu einer erhöhten Immunantwort auf
Mycobacterium tuberculosis Lysate und vermutlich zu einer strukturellen
Veränderung dieses Rezeptors.
de
dc.description.abstract
Background: Tuberculosis, a disease caused by Mycobacterium Tuberculosis
infection, is still a global public health problem. TB susceptibility varies
substantially in infected individuals, and mycobacterial recognition by the
innate immune system may likely affect disease course and outcome. This
research describes SNPs in the TB genes that functionally alter the innate
immune response to MTB and are associated with TB susceptibility in India.
Methods: A SNP database with information regarding the polymorhpisms and their
potential influence on protein structure was created. In Hyderabad, India,
cohorts of TB patients and healthy controls were generated. 206 patients and
239 controls from Hyderabad, India were analyzed for SNPs in the TLRs 1, 2, 4,
7 and 8. The frequency of the genetic variations subsequently was correlated
with TB susceptibility. To test individual responses to MTB lysates, we
stimulated human embryonic kidney (HEK) cells transfected with TLR1 variants,
as well as PBMCs from genotyped, healthy German individu- als. NF-κB
activation and TNF production were assessed respectively after stimulation of
the cells. For statistical analysis of the cohorts, a computer software was
programmed and potential consequences of the TLR1 SNP on protein structure
were modeled in silico. Results: Cohort analysis revealed an association of a
TLR1 SNP (248N, rs4833095) and of a TLR8 SNP (1M, rs3764880) with TB
protection and an association of a TLR4 SNP (299D, rs4986790) with TB risk in
females. Functional studies using HEK cell lines transfected with TLR1-248N
and stimulated with MTB showed an increased NF-κB activation of this genetic
variant. In addition to this, TLR1-248N expressing PBMCs from healthy controls
exhibited an increased TNF response to MTB lysates. The in silico modeling
gave evidence of changes in protein structure of TLR1 when the mutation was
present potentially explaining the functional consequences. Conclusion: The
TLR1-248N SNP is associated with TB protection in an Indian population, leads
to an increased immune response to MTB lysate, and potentially to a structural
change of this receptor.
en
dc.format.extent
X, 135 S.
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Toll-Like Receptor
dc.subject
Single-nucleotide polymorphism
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit
dc.title
Variationen der Toll-like Rezeptoren beeinflussen die Suszeptibilität für
Tuberkulose in Hyderabad, Indien und die Immunantwort auf Mycobacterium
tuberculosis
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. med. Ralf R. Schumann
dc.contributor.furtherReferee
Prof. Dr. rer. nat. Thomas Blankenstein
dc.date.accepted
2015-03-06
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000098868-1
dc.title.translated
Variations of the Toll-Like Receptors influence susceptibility to tuberculosis
in Hyderabad, India and the immune response to Mycobacterium tuberculosis
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000098868
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000016688
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access