dc.contributor.author
Kaempf, Natalie
dc.date.accessioned
2018-06-13T12:22:26Z
dc.date.available
2018-06-13T12:22:26Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/22191
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-30
dc.description
I Table of Content I II Summary V III Zusammenfassung VII 1\. Introduction 9
1.1. Neurotransmission at chemical synapses 9 1.2. SV recycling 9 1.3. The
synaptic vesicle (SV) 12 1.4. The SV protein synaptotagmin 1 13 1.5. Sorting
of SV proteins 15 1.5.1. SV protein sorting by AP-2 17 1.5.2. Stonin2 – a
specific sorting adaptor for Syt1 18 1.5.3. Synaptic vesicle protein 2 (SV2)
in SV protein complex formation 20 1.6. Coupling of exocytosis and endocytosis
22 1.7. PI(4,5)P2 at the presynapse 24 1.7.1. PI(4,5)P2 during SV exocytosis
26 1.7.2. The role of PI(4,5)P2 during SV endocytosis 28 1.7.3. PIPK1γ as the
major PI(4,5)P2 synthesizing kinase in the brain 29 2\. Aims of this study 32
3\. Material and Methods 33 3.1. Materials 33 3.1.1. Chemicals 33 3.1.2.
Buffers, Media and Solutions 33 3.1.3. Enzymes and kits 40 3.1.4. Molecular
weight standards 41 3.1.5. Small interfering RNA and synthetic DNA
oligonucleotides 41 3.1.6. Plasmid vectors 43 3.1.7. Antibodies 44 3.1.8.
Bacterial strains 46 3.1.9. Eukaryotic cell lines 46 3.1.10. Mouse strains 47
3.1.11. Software and internet resources 48 3.2. Molecular biology methods 49
3.2.1. Cloning strategies 49 3.2.2. Polymerase chain reaction and site
directed mutagenesis 49 3.2.3. Analytical agarose gel electrophoresis and DNA
purification 51 3.2.4. DNA restriction digests 51 3.2.5. Ligation of DNA
fragments into linearized vectors 52 3.2.6. Transformation of chemically
competent E. coli 52 3.2.7. Purification of plasmid DNA from E. coli cultures
52 3.2.8. Measurement of DNA concentrations 53 3.2.9. Sequencing of DNA 53
3.2.10. Cryostocks of bacterial clones 53 3.2.11. Isolation of genomic DNA
from mouse tissue 54 3.2.12. Genotyping of mouse strains 54 3.3. Cell
biological methods 56 3.3.1. Cell culture of HEK 293T cells 56 3.3.2.
Transfection of HEK 293T cells with jetPRIME 57 3.3.3. Transfection of HEK
293T cells with Lipofectamin 2000 57 3.3.4. Preparation of primary hippocampal
neurons 58 3.3.5. Calcium phosphate transfection of primary hippocampal
neurons 59 3.3.6. Silencing of primary hippocampal neuron cultures 59 3.3.7.
Stimulation of primary hippocampal neuron cultures 60 3.3.8.
Immunocytochemistry 60 3.4. Fluorescent microscopy and quantitative image
analysis 62 3.4.1. Epifluorescent microscopy 62 3.4.2. Confocal microscopy 63
3.4.3. Stimulated emission depletion (STED) microscopy and analysis 63 3.4.4.
pHluorin live-cell imaging 65 3.4.5. Calcium live-cell imaging 69 3.5.
Biochemical methods 70 3.5.1. Preparation of HEK 293T cell lysates 70 3.5.2.
Preparation of mouse brain extracts 70 3.5.3. Protein quantification using
Bradford assay 70 3.5.4. Expression of recombinant proteins in E.coli 71
3.5.5. Affinity-purification of GST- and His6-fusion proteins 71 3.5.6. GST-
pulldown from rat brain extract 72 3.5.7. Co-Immunoprecipitation of
synaptosomal extracts 72 3.5.8. SDS polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-
PAGE) 73 3.5.9. Immunoblotting 74 3.5.10. Coomassie staining of SDS-
polyacrylamide gels 75 3.6. Histological Methods 75 3.6.1. Perfusion of mice
75 3.6.2. Cryosectioning of mouse brains 76 3.6.3. Nissl staining 76 3.6.4.
Immunohistochemistry 76 3.7. Electron microscopy 77 3.8. Electrophysiology 78
3.8.1. Input-output recordings, short term plasticity and high frequency
stimulation train recordings 78 3.8.2. mEPSC recordings 79 3.8.3. Membrane
capacitance measurements at the calyx of Held 79 3.9. Statistical analysis 80
4\. Results 81 4.1. Sorting of synaptotagmin 1 during SV recycling 81 4.1.1.
Generation and characterisation of SV2A/B x Stn2 triple knockout mice 81
4.1.2. Combined deletion of SV2A/B and Stn2 aggravates Syt1 loss in vivo 85
4.1.3. Knockdown of SV2A in hippocampal neuron culture causes partial Syt1
loss 88 4.1.4. Impaired Syt1 sorting in the absence of Stn2 and SV2A show
additive defects 89 4.1.5. SV2A regulates Syt1 sorting to SVs during neuronal
activity 92 4.1.6. Combined deficiency of Stn2 and SV2A/B aggravates impaired
evoked release 95 4.1.7. Exacerbated reduction of release probability by
additional depletion of Stn2 in SV2A/B DKO 97 4.2. The molecular function of
Syt1 sorting at the synapse 100 4.2.1. Accelerated endocytic retrieval in the
absence of Syt1 sorting adaptors 100 4.2.2. Calcium influx during stimulation
is not affected in Stn2 depleted neurons 105 4.2.3. PI(4,5)P2 levels are
specifically increased in Stn2 deficient neurons 106 4.2.4. Syt1
redistribution correlates with elevated PI(4,5)P2 levels 108 4.2.5. Syt1
interacts with PIPK1γ 110 4.2.6. Overexpression of Syt1 and PIPK1γ in HEK
cells mimic elevated PI(4,5)P2 levels 112 4.2.7. Facilitated recruitment of
PIPK1γ to the plasma membrane in Stn2 deficient neurons 114 5\. Discussion 120
5.1. Integrating cargo specific SV protein sorting in SV reformation 120
5.1.1. Overlapping activities of SV2 and Stn2 in Syt1 sorting 121 5.1.2.
Spatio-temporal regulation of Syt1 sorting 123 5.2. Functional implications of
Syt1 sorting in central synapses 126 5.2.1. Regulation of Syt1 levels and
turnover by SV2/Stn2 126 5.2.2. Functional consequences of Syt1 redistribution
and loss for neurotransmission 127 5.2.3. Speed of SV retrieval independent of
Syt1 sorting 129 5.3. Coupling of SV exo- and endocytosis by SV proteins 130
5.3.1. Surface-localized Syt1 as an exo-endocytic coupling factor 131 5.3.2.
PI(4,5)P2 as an effector molecule of surface-stranded Syt1 132 5.3.3. Syt1
interacts and recruits PIPK1γ 136 5.3.4. Other potential effectors regulated
by PI(4,5)P2 in SV exo- and endocytosis 138 6\. Outlook 141 7\. Bibliography
143 8\. Appendix 165 8.1. Appendix A: Abbreviations 165 8.2. Appendix B:
Supplementary Figures 168 8.3. Appendix C: List of Tables and Figures 173
8.3.1. List of Tables 173 8.3.2. List of Figures 173 8.4. Appendix D:
Publications 176 8.5. Appendix E: Curriculum Vita 177
dc.description.abstract
Communication in the central nervous system relies on fast and precise
neurotransmission at synapses. The arrival of an action potential at the
presynapse triggers the calcium regulated exocytic fusion of synaptic vesicles
(SVs). Exocytosis and neurotransmitter release are followed by local SV
membrane retrieval and reformation of functional SVs with the correct size and
protein composition that can replenish the SV pool and thereby maintain
neurotransmission. In spite of decades of research many aspects of SV
recycling remain unclear. In particular, the precise sorting of surface-
stranded SV proteins during SV endocytosis as well as the coupling of SV exo-
and endocytosis are still unknown. To address these open questions, we
investigated whether the endocytic sorting of synaptotagmin 1 (Syt1), the
calcium sensor for SV exocytosis, is ensured by two mechanisms in mammals: by
a dedicated endocytic adaptor as well as by complex formation with another SV
protein. Further, we examined the functional consequences of Syt1 sorting in
mammalian synapses. I could show that endocytic sorting and maintenance of
Syt1 at mammalian synapses is mediated by overlapping activities of stonin 2
(Stn2) and the SV glycoprotein SV2A/B. Deletion or knockdown of either SV2A/B
or Stn2 resulted in partial Syt1 loss and missorting of Syt1 to the neuronal
surface in brain slices and hippocampal neurons in culture. Combined deletion
of both SV2A/B and Stn2 dramatically aggravated this phenotype. The
repartitioning of Syt1 to the neuronal plasma membrane is dependent on
neuronal activity and led to a partial loss of Syt1 from recycling SVs.
Consequently, the defective Syt1 sorting to SVs in the absence of SV2A/B and
Stn2 impaired basal neurotransmission. These results suggest that SV2A/B and
Stn2 share an overlapping function in mediating endocytic sorting of Syt1 to
SVs at mammalian synapses and favor a model according to which SV protein
sorting is guarded by both cargo-specific endocytic adaptors as well as
complex formation of SV proteins. Interestingly, we found that deletion of the
Syt1 sorting adaptors Stn2 and SV2A/B accelerated endocytic retrieval and
facilitated SV exocytosis in response to repetitive electrical stimulation in
hippocampal neurons. The surface-stranding of Syt1 in the absence of Stn2 and
the augmented SV exo- and endocytosis correlated with elevated presynaptic
levels of phosphatidylinositol-(4,5)-bisphosphate [PI(4,5)P2], a membrane
phospholipid essential for SV exocytic fusion and endocytic retrieval. In
contrast, the levels of another plasma membrane residing phosphoinositide,
PI(4)P, remained unchanged. Increased presynaptic PI(4,5)P2 levels likely are
caused by the direct association of Syt1 with phosphatidylinositol 4-phosphate
5-kinase type I (PIPK1γ), the major PI(4,5)P2-synthesizing enzyme at
synapses. Indeed, superresolution nanoscopy revealed a selective
relocalization of PIPK1γ towards the plasma membrane in Stn2 depleted and thus
Syt1 surface-enriched neurons. Taken together, my data suggest that Syt1 at
the axonal surface triggers the recruitment of PIPK1γ to facilitate local
PI(4,5)P2 synthesis at or near release sites and couples thereby
PI(4,5)P2-dependent SV exo- and endocytosis.
de
dc.description.abstract
Die Kommunikation im zentralen Nervensystem basiert auf einer schnellen und
präzisen Erregungsübertragung an Synapsen. Sobald ein Aktionspotential die
Präsynapse erreicht, löst es die Kalzium-regulierte Verschmelzung synaptischer
Vesikel (SV) an der aktiven Zone aus. Die Exozytose und Freisetzung von
Neurotransmittern folgt die Rückgewinnung der fusionierten Membran und Bildung
neuer funktionaler SV, welche wieder die richtige Größe und vor allem die
korrekte Proteinzusammensetzung aufweisen müssen, um die fusionierten SV zu
ersetzen. Dies ist notwendig, um lang anhaltende Neurotransmission sicher zu
stellen. Trotz jahrelanger intensiver Forschung sind viele Aspekte dieses
Recyclings der SV nicht geklärt. Besonders, die präzise Sortierung während der
Endozytose von an der Oberfläche zurückgebliebenen SV Proteine sowie die
Kopplung von Exo- und Endozytose sind noch immer unbekannt. Um diese offenen
Fragen zu beantworten, haben wir untersucht, ob die Sortierung von
Synaptotagmin 1 (Syt1), dem Kalzium-Sensor für die SV Fusion, in Säugetieren
durch zwei Mechanismen sichergestellt wird: durch einen spezifischen,
endozytotischen Adaptor sowohl als auch durch Komplexbildung mit einem
weiteren SV Protein. Darüber hinaus haben wir die funktionalen Konsequenzen
von der Syt1-Sortierung in Säugetiersynapsen erforscht. In dieser Arbeit
konnte ich zeigen, dass die Sortierung während der Endozytose sowie die
Erhaltung von Syt1 durch überlappende Funktionen von dem spezifischen Adaptor
stonin 2 (Stn2) und dem SV Protein SV2A/B in der Säugetiersynapse
gewährleistet werden. Das Fehlen von SV2A/B oder Stn2 führte zu einem
partiellen Verlust von Syt1, einhergehend mit der Akkumulation von Syt1 an der
Zelloberfläche von Neuronen in Gehirnschnitten und in hippocampalen neuronalen
Kulturen. Die Abwesenheit beider Proteine, Stn2 und SV2A/B, verstärkte diesen
Phänotyp dramatisch. Zusätzlich konnte ich bestätigen, dass die Umverteilung
von Syt1 zur Zelloberfäche von neuronaler Aktivität abhängig und für den
Verlust von vesikulärem Syt1 verantwortlich ist. Die mangelnde Präzision der
Syt1-Sortierung führte folglich zu einer stark eingeschränkten
Neurotransmission. Diese Ergebnisse weisen daher auf überlappende Aktivitäten
von Stn2 und SV2A/B in der Säugetiersynapse hin, um Syt1 in SV zu sortieren.
Weiterhin lassen die Daten darauf schließen, dass die SV Protein Sortierung
mit Hilfe zweier Mechanismen sichergestellt wird: einerseits durch spezifische
Adaptoren, andererseits durch die Assoziation von SV Proteinen miteinander.
Überraschenderweise beschleunigt die Abwesenheit der Syt1-Sortierungsproteine
SV2A/B und Stn2 sogar die Aufnahme der SV Proteine und verstärkt zudem die SV
Exozytose, wenn hippocampale Neurone repetitiv elektrisch stimuliert werden.
Die Akkumulation von Syt1 an der neuronalen Zelloberfläche korreliert nicht
nur mit der gesteigerten SV Exo- und Endozytose, sondern auch mit erhöhten
präsynaptischen Konzentrationen von Phosphatidylinositol-(4,5)-bisphosphat
[PI(4,5)P2]. PI(4,5)P2 gehört zu den Phospholipiden und ist essentiell für die
Fusion von SV und deren Rückgewinnung. Im Gegensatz dazu sind die Level von
PI(4)P, einem weiteren Phosphoinositid, das auf der Plasmamembran lokalisiert
ist, unverändert. Die erhöhten Level von PI(4,5)P2 lassen sich vermutlich
durch eine direkte Assoziation von Syt1 mit der Phosphatidylinositol
4-phosphat 5-kinase Typ I (PIPK1γ) erklären, die hauptsächlich für die
Synthese von PI(4,5)P2 verantwortlich ist. Zudem bestätigt hoch-auflösende
Mikroskopie eine veränderte Lokalisierung von PIPK1γ an die Plasmamembran von
Neuronen, welche Stn2 defizient sind und somit an der Oberfläche
angereichertes Syt1 aufweisen. Zusammenfassend zeigen meine Daten, dass die
Akkumulation von Syt1 an der Plasmamembran die Rekrutierung von PIPK1γ fördert
und damit die lokale Synthese von PI(4,5)P2 an oder nahe der aktiven Zone
ermöglicht. Somit koppelt Syt1 die PI(4,5)P2 abhängige SV Exo- und Endozytose.
de
dc.format.extent
178 Seiten
de
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
de
dc.subject
Neurotransmission
dc.subject
Synaptotagmin1
dc.subject
synaptic vesicle protein sorting
dc.subject
coupling of exocytosis and endocytosis
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie::572 Biochemie
dc.title
Molecular Mechanism and Function of Endocytic Sorting of Synaptotagmin 1 at Central Synapses
de
dc.contributor.contact
Natalie.Kaempf@web.de
dc.contributor.gender
female
de
dc.contributor.firstReferee
Haucke, Volker
dc.contributor.furtherReferee
Freund, Christian
dc.contributor.furtherReferee
Ewers, Helge
dc.contributor.furtherReferee
Sigrist, Stephan
dc.date.accepted
2018-05-28
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-refubium-22191-0
dc.title.translated
Molekularer Mechanismus und Funktion der endozytischen Sortierung von
Synaptotagmin 1 in zentralen Synapsen
de
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000107326
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free
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