dc.contributor.author
Tippelskirch, Philine von
dc.date.accessioned
2018-06-07T14:38:30Z
dc.date.available
2017-12-21T11:41:49.800Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/192
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-4396
dc.description.abstract
Ziel dieser Arbeit war es, die Prävalenz sowie die quantitative Belastung
verschiedener Probenmatrizes (Caecum, Haut, Filet) von sieben
Masthähnchenherden während der Schlachtung mit ESBL/AmpC-produzierenden
Enterobacteriaceae zu erfassen. Zudem wurde die Umgebung während der
Schlachtung der jeweiligen Herde beprobt, um Hinweise auf mögliche Quellen für
Kontaminationen bzw. Kreuzkontaminationen mit ESBL/AmpC-produzierenden
Enterobacteriaceae sowie deren mögliche Übertragungswege zu erhalten. Während
der Schlachtung aller sieben Herden konnten ESBL/AmpC-produzierende
Enterobacteriaceae nachgewiesen werden. Durchschnittlich wiesen 47 % (83/175)
der Caecum-, 55 % (96/175) der Haut-, 28 % (49/175) der Filet- und 28 %
(25/89) der Umgebungsproben ESBL/AmpC-produzierende Enterobacteriaceae auf.
Die Prävalenz ESBL/AmpC-produzierender Enterobacteriaceae variierte stark
zwischen den einzelnen Herden und den verschiedenen Probenmatrizes. In der
Umgebung konnten allerdings während der Schlachtung aller Herden ESBL/AmpC-
produzierende Enterobacteriaceae nachgewiesen werden. Bei der quantitativen
Untersuchung lagen bei ca. der Hälfte der Caecum- und Haut- sowie bei 85 % der
Filetproben die Keimzahlen der Cefotaxim-resistenten Enterobacteriaceae unter
der quantitativen Nachweisgrenze. Der Median der Cefotaxim-resistenten
Enterobacteriaceae lag, je nach Probenmatrix, 1-4 Logstufen unter dem Median
der Gesamt-Enterobacteriaceae. Jedoch ergab sich keine Korrelation zwischen
der Keimzahl der Gesamt- und der Keimzahl der Cefotaxim-resistenten
Enterobacteriaceae der Caecumproben. Die Keimzahl der Cefotaxim-resistenten
Enterobacteriaceae lag im Median bei 2,5 x 103 KbE/g (Caecum), 1,5 x 103 KbE/g
(Haut) und 1,5 x 102 KbE/g (Filet). Mittels qPCR konnte bei 82 % (629/767) der
Cefotaxim-resistenten Enterobacteriaceae mindestens eines der untersuchten
blaESBL/AmpC-Gene blaCTX-M, blaSHV, blaTEM, blaAmpC-CIT nachgewiesen werden.
Erneut zeigten sich Unterschiede zwischen den Herden. So wurde in den Herden
1, 3 und 4 blaAmpC-CIT mit 61 % bis 92 % am häufigsten nachgewiesen, während
in den Herden 5 und 6 blaSHV mit 84 % bzw. 42 % dominierte. In Herde 7 konnte
für mehr als die Hälfte der Cefotaxim-resistenten Isolate keines der
untersuchten bla-Gene detektiert werden. In dieser Herde wurden Gene vom
blaCTX-M-Typ mit 32 % am häufigsten nachgewiesen. Bei 322 Isolaten wurden die
bla-Gene sequenziert. blaCMY-2 war mit 48 %, gefolgt von blaSHV-12 mit 23 %,
die häufigste Gen-Variante. Es konnten teilweise Isolate derselben Spezies,
derselben Phylogruppe sowie mit demselben Resistenzgen in allen Probenmatrizes
einer Herde sowie in der Umgebung detektiert werden. Dies deutet auf einen
horizontalen Eintrag der Stämme über die Masthähnchen in den Schlachthof sowie
umgekehrt auf eine Kontamination der Masthähnchen während des
Schlachtprozesses durch Stämme aus der Umgebung.
de
dc.description.abstract
The aim of this study was to determine the prevalence as well as quantitative
load of ESBL/AmpC-producing Enterobacteriaceae in different sample matrices
(caecum, skin, filet) of seven broiler chicken flocks during slaughter. In
addition, environmental samples were taken during slaughter of the respective
flocks to gain insights into possible sources of cross contamination with ESBL
/AmpC-producing Enterobacteriaceae as well as their possible transmission
routes. ESBL/AmpC-producing Enterobacteriaceae were detected during slaughter
of all seven investigated flocks. On average, 47 % (83/175) of caecum, 55 %
(96/175) of skin, 28 % (49/175) of filet and 28 % (25/89) of environmental
samples harboured ESBL/AmpC-producing Enterobacteriaceae. Prevalence varied
widely between the flocks as well as between the different sample matrices.
However environmental samples of all flocks harboured ESBL/AmpC-producing
Enterobacteriaceae. In about half of the caecum and skin samples as well as 85
% (17/20) of the filet samples, the number of cefotaxime resistant
Enterobacteriaceae was below quantification limit. The median of cefotaxime
resistant Enterobacteriaceae was, depending on sample matrix, 1-4 log units
below the median of total Enterobacteriaceae. There was no correlation between
the number of total and the number of cefotaxime resistant Enterobacteriaceae
in all caecum samples. The median of cefotaxime resistant Enterobacteriaceae
was 2.5 x 103 cfu/g in caecum, 1.5 x 103 cfu/g in skin and 1.5 x 102 cfu/g in
filet samples. Using real-time PCR, in 82 % (629/767) of the cefotaxime
resistant Enterobacteriaceae at least one of the investigated beta-lactamase
genes blaCTX-M, blaSHV, blaTEM, blaAmpC-CIT was detected. Prevalence again
varied widely between the flocks. In flock 1, 3 and 4 blaAmpC-CIT was, with up
to 92 %, the predominant gene, while in flock 5 (84 %) and 6 (42 %) blaSHV was
most prevalent. For more than half of the cefotaxime resistant isolates of
flock 7 none of the investigated genes could be detected. In this flock,
isolates encoding blaCTX-M genes (32 %) were predominant. The respective
resistance genes of 322 isolates were further sequenced. The predominant bla
gene was blaCMY-2 (48 %), followed by blaSHV-12 (23 %). A contamination from
the broiler chicken to the slaughterhouse environment and vice versa seems
probable as partially isolates belonging to the same species and phylogroup
and encoding the same resistance genes could be detected in all matrices
during slaughter of the respective flock as well as in the environment.
en
dc.format.extent
100, VI Seiten
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
enterobacteriaceae
dc.subject
extended spectrum betalactamases
dc.subject.ddc
600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::630 Landwirtschaft::630 Landwirtschaft und verwandte Bereiche
dc.title
Prävalenz und Quantifizierung ESBL/AmpC-produzierender Enterobacteriaceae bei
Masthähnchen während des Schlachtprozesses
dc.contributor.firstReferee
Univ.-Prof. Dr. Thomas Alter
dc.contributor.furtherReferee
Univ.-Prof. Dr. Marcus Fulde
dc.contributor.furtherReferee
PD Dr. Markus Heimesaat
dc.date.accepted
2017-11-10
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000106020-7
dc.title.translated
Prevalence and quantification of ESBL/AmpC-producing Enterobacteriaceae in
broiler chicken during slaughter
en
refubium.affiliation
Veterinärmedizin
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000106020
refubium.note.author
Mensch und Buch Verlag
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FUDISS_derivate_000000022854
dcterms.accessRights.dnb
free
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open access