dc.contributor.author
Lehmann, Ingo Tobias
dc.date.accessioned
2018-06-07T15:33:51Z
dc.date.available
2002-11-28T00:00:00.649Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/1267
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-5469
dc.description
Titel und Inhaltsverzeichnis
1. Einleitung3
1.1. Signaltransduktion zum Zellkern3
1.2. Der Zellkern6
1.2.1.Die Kernmembran6
1.2.2.Der Kernporenkomplex9
1.2.3.Kernimport und Export11
1.3.PKC im Zellkern15
1.4.Substrate der PKC im Zellkern17
1.5.Spleißen19
1.6.Der PTB-assoziierte splicing Faktor (PSF)20
1.7.Zielsetzung der Arbeit22
2. Ergebnisse24
2.1.Suche nach dem NLS der PKCα24
2.1.1.Die pHMΔPKCα-Konstrukte24
2.1.2.Die pHMΔPKCαDiGFP-Konstrukte29
2.2.PSF als PKCα-bindendes Protein im Zellkern35
2.2.1.Charakterisierung der verwendeten Antikörper35
2.2.2.Untersuchung zum PTB-assoziierten Spleißfaktor (PSF)36
2.3.Substrate der PKCα an der inneren Kernmembran39
2.3.1.Phosphorylierung der Kernmembran39
2.3.2.Phosphorylierung der Triton X-100-resistenten Fraktion der Kernmembran42
3. Diskussion44
3.1.Das Kernlokalisationssignal der PKCα44
3.2.Physiologische Bedeutung der PSF-Bindung49
3.3.Nucleäre Substrate der PKCα52
3.4.Zusammenfassung60
3.5.Ausblick61
3.6.Summary61
4.Material und Methoden63
4.1.Analytik von Proteinen63
4.1.1.Proteinbestimmung nach Bradford63
4.1.2.Eindimensionale diskontinuierliche SDS-Polyacrylamid-Gelelektrophorese
nach Laemmli63
4.1.3.BAC-SDS-PAGE64
4.1.4.Blotting von Proteinen nach dem „Semidry"-Verfahren66
4.1.5.Ponceaufärbung von Proteinen auf der Nitrozellulosemembran66
4.1.6.SYPRO-Färbung von Proteinen auf der Nitrozellulosemembran66
4.1.7.Nachweis von Proteinen durch Immunoblotting (Western-Blotting)67
4.1.8.„Strippen" der Blotmembran68
4.1.9.Immunpräzipitation68
4.1.10.Bindungstest („Pull down assay")69
4.1.11.Phosphorylierung von Proteinen (in vitro)69
4.1.12.In Gel-Verdau mit Trypsin70
4.2.Molekularbiologische Methoden72
4.2.1.Anzucht von Bakterien72
4.2.2.Herstellung kompetenter E. coli72
4.2.3.Transformation kompetenter E. coli73
4.2.4.Mini/Midi-Präparation von Plasmid-DNA73
4.2.5.Ethanolfällung von DNA74
4.2.6.Konzentrationsbestimmung von DNA74
4.2.7.DNA-Spaltung mit Restriktionsenzymen75
4.2.8.DNA-Ligation75
4.2.9.Sequenzierung von DNA:75
4.2.10.Polymerase-Kettenreaktion (PCR) nach Arnheim und Ehrlich (1992)76
4.2.11.Agarose-Gelelektrophorese76
4.2.12.DNA-Elution aus Agarosegelen77
4.2.13.Herstellung der Vektoren77
4.3.Zellkultur82
4.3.1.Sf9-Zellen82
4.3.2.Transfektion von Sf9-Zellen82
4.3.3.Bestimmung des Virustiters83
4.3.4.Amplifikationsschritte und Expression des Fusionsproteins84
4.3.5.Isolierung und Aufreinigung des GST-Fusionsproteins85
4.3.6.Säugerzellen86
4.3.7.Transfektion von Säugerzellen86
4.3.8.Fluoreszenzmikroskopie87
4.3.9.Subzelluläre Fraktionierung: Kernpräparation87
4.3.10.Präparation von Kernmembranen und Nucleoplasma88
4.3.11. Tritonextraktion von Kernmembranen89
5. Literatur90
6.Anhang101
6.1.Abkürzungen101
6.2.Publikationen102
6.3.Danksagungen103
dc.description.abstract
Die Isozyme der Proteinkinase-C-Familie sind Schlüsselmoleküle in der
Signaltransduktion. Die klassische Isoform Proteinkinase Cα (PKCα) kann in den
Zellkern translozieren und wahrscheinlich Einflüsse auf die Genexpression
ausüben. Daher ist die Identifikation ihres Kernlokalisationssignals, ihrer
Interaktionspartner und Substrate von besonderem Interesse.
Im ersten Teil der vorliegenden Arbeit wurde der Versuch unternommen, das in
vorausgegangenen Arbeiten unseres Labors auf einen Teil der regulatorischen
Domäne der PKCα eingegrenzte Kernlokalisationssignal (Wagner 1999) genauer zu
definieren. Dazu wurden Zellen mit Expressionsvektoren transfiziert, die PKCα-
Deletionsmutanten codierten, die mit GFP-β Galaktosidase bzw. mit zwei GFP-
Molekülen fusioniert waren. Die erzielten Ergebnisse erlauben keine Aussage
bezüglich der Präsenz eines NLS innerhalb der C1-Domäne der PKC, da die
Fusionsproteine überraschenderweise eine ausgesprochen hohe Cytotoxizität
aufweisen und in Aggregaten variabler Gestalt und Größe assemblieren.
Offensichtlich können also in diesem Fall GFP-Konstrukte nicht zur Klärung der
oben genannten Fragestellung verwendet werden.
Im zweiten Teil der Arbeit wurde auf der Grundlage von Vorarbeiten unseres
Labors (Rosenberger 1997) nachgewiesen, daß der PTB-assoziierte Spleißfaktor
(PSF) ein Bindungs-partner für PKCα ist. Dabei handelt es sich um das erste
nucleäre PKC-bindende Protein überhaupt. Die Bindung ist abhängig von der
Aktivierung der PKCα. Desweiteren wurde festgestellt, daß PSF ein schwaches
Substrat der PKCα ist.
Bei der Suche nach weiteren Substraten der PKCα wurden in vitro-
Phosphorylierungen von Kermembranen bzw. deren Triton X-100 resistenten
Fraktionen durchgeführt und die Proteine anschließend mittels
zweidimensionaler BAC-SDS-PAGE aufgetrennt. In der Auto-radiographie sichtbare
Spots konnten aus den Gelen ausgestochen und mittels MALDI-TOF-
Massenspektrometrie konnten 12 neue Substrate der PKCα zusätzlich zu dem
bereits erwähnten PSF identifiziert werden. Darunter sind unter anderem mit
dem Heterochromatin 2, dem Ott-Protein und einem putativen Protein drei neue
Proteine identifiziert worden, die bislang nur aufgrund genetischer Daten in
den Datenbanken zu finden waren und über deren Funktion demzufolge bislang
nichts bekannt ist.
Die biologischen Funktionen, die die anderen Proteine erfüllen, sind ebenso
wie mögliche Bedeutungen ihrer Modifikation durch PKCα vielfältig. Sie
erfüllen u.a. Aufgaben bei so wichtigen Prozessen wie Spleißen, beim mRNA-
Export, bei der Chromatinorganisation, bei der Genregulation und bei der
Ribosomenbiogenese.
de
dc.description.abstract
The family of protein kinase C (PKC) isozymes are key-players in many
signaltransduction pathways. The classical isoform PKCα is able to translocate
into the nucleus and probably to induce changes in gene expression. Therefore
identification of its nuclear localization signal, interacting proteins and
its substrates in the nucleus are of special interest.
Based on earlier work in our laboratory which led to prediction of a nuclear
localization signal NLS in the C1-region of PKCα (Wagner, 1999), fusion
proteins of deletion mutants of PKCα and either GFP-β-Galactosidase or two
GFP-molecules, respectively, were constructed and expressed in mammalian cell
lines by transient expression to exactly define the NLS of PKC&alpha.; The
localisation pattern of the fusion proteins were analysed by confocal laser
scan-ning microscopy. Surprisingly, the fusion proteins turned out to be
cytotoxic, assembling in multiple intracellular aggregates with different
shape and sizes. Based on these observations it was concluded that the
approach of expressing fusion proteins cannot be used to find the exact NLS of
PKCα.
The second part of this work was aimed to identify interacting partners and
substrates of nuclear PKCα. Nuclear extracts of mammalian cells were incubated
with GST-PKCα, immuno-precipitated and subsequently analysed with western blot
analysis, which reveals that PTB associated splicing factor (PSF) is a PKCα-
interacting protein. This interaction depends on the activation status of
PKCα. It was also shown that PSF is a weak substrate of PKCα.
In search for additional substrates of PKCα nuclear membranes and their
detergent insoluble fractions where phosphorylated in vitro. The proteins were
separated via 2D BAC-SDS-PAGE and gel spots corresponding to the
autoradiography were used to identify the proteins by MALDI-mass spectrometry.
With this method, we identified substrates, which are already known in
literature as well as 13 new substrates of PKC&alpha.; Three of these
proteins (heterochromatin 2, the Ott-protein and a putative protein) are known
only from sequence data. The other newly identified substrates of PKCα, which
include PSF, are known to be involved in many different processes including
splicing, the export of mRNA, chromatin organization, regulation of gene-
expression and biogenesis of ribosomes.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
Protein kinase C
dc.subject
signaltransduction
dc.subject
nuclear import
dc.subject
substrates, NLS
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::540 Chemie::540 Chemie und zugeordnete Wissenschaften
dc.title
Proteinkinase Cα im Zellkern
dc.contributor.firstReferee
Prof. Dr. Ferdinand Hucho
dc.contributor.furtherReferee
PD Dr. Mathias Ziegler
dc.date.accepted
2002-10-29
dc.date.embargoEnd
2002-11-29
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-2002002592
dc.title.subtitle
Kernimport, Interaktionspartner und Substrate
dc.title.translated
Protein kinase Cα in the nucleus
en
dc.title.translatedsubtitle
nuclear import, interacting proteins and substrates
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000000784
refubium.mycore.transfer
http://www.diss.fu-berlin.de/2002/259/
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000000784
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free
dcterms.accessRights.openaire
open access