dc.contributor.author
Neuber, Anja
dc.date.accessioned
2018-06-08T00:44:32Z
dc.date.available
2008-11-04T08:55:33.309Z
dc.identifier.uri
https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/12388
dc.identifier.uri
http://dx.doi.org/10.17169/refubium-16586
dc.description
Zusammenfassung 6 Abstract 7 1\. Einleitung 8 1.1 Kerntransport 8 1.1.1
Bedeutung des Kerntransports 8 1.1.2 Die lösliche Phase: Transport-Rezeptoren
8 1.1.3 Die stationäre Phase: Nukleoporine 13 1.1.4 Ran-Gradient und
Energiebedarf 14 1.1.5 Import- und Exportsignale 16 1.2 Weitere Funktionen der
Kerntransport-Maschinerie 17 1.2.1 Einfluss von Ran-GTP auf die Mikrotubuli 17
1.2.2 Einfluss von Crm1 auf die Centrosomen 18 1.3 Der Spindelpolkörper 19
1.3.1 Generelle Struktur des Spindelpolkörpers 19 1.3.2 γ-Tubulin-Komplex-
bindende Proteine: Spc110 und Spc72 21 1.4 Ziele der Arbeit 23 2\. Ergebnisse
24 2.1 Charakterisierung von Xpo1-Mutanten 24 2.1.1 Übersicht über die
Mutanten 24 2.1.2 Wachstum und Zellzyklus 25 2.1.3 Protein- und mRNA-Export 27
2.2 Suche nach neuen Interaktionspartnern von Xpo1 29 2.2.1 Ungerichtete 2
-Hybrid-Analyse 29 2.2.2 Lokalisation der putativen Interaktionspartner 30
2.2.3 Gerichtete 2-Hybrid-Analyse 31 2.3 Lokalisation von Xpo1 32 2.3.1
Lokalisation von Xpo1-GFP und anderen Transport-Komponenten 32 2.3.2 Immuno-
Elektronenmikroskopie und Immuno-Fluoreszenz von Xpo1 33 2.3.3 Co-Lokalisation
von Xpo1-YFP und Spc29-CFP 35 2.3.4 Co-Fraktionierung von Xpo1 und Spc110 im
Sucrose-Gradienten 37 2.3.5 Lokalisation von Xpo1-GFP im SPC72-Deletionsstamm
38 2.3.6 Einfluss von Ran auf die Lokalisation von Xpo1 39 2.4 Spc72 in der
in-vitro-Bindungsanalyse 40 2.4.1 Reinigungsbeispiel und Test der
Bindungsanalyse 40 2.4.2 Analyse von Spc72433 41 2.4.3 Analyse N-terminaler
Fragmente von Spc72433 42 2.4.4 Vergleich von Spc72433 und Gesamtlänge-Spc72
44 2.5 Untersuchung von Spc72 als Xpo1-Substrat in vivo 45 2.5.1 2-Hybrid-
Analyse von Spc72 und spc72-NES* 45 2.5.2 Überexpression von Spc72-GFP 46
2.5.3 Reporter-Plasmid-Analyse der NES von Spc72 47 2.5.4 Reporter-Plasmid-
Analyse eines C-terminalen Fragments von Spc72 48 2.5.5 Überexpression eines
N-terminalen Fragments von Spc72-GFP 48 2.5.6 Lokalisation von spc72-NES*-GFP
50 2.5.7 Zytoplasmatische Mikrotubuli in spc72-NES* 52 2.5.8 Zytoplasmatische
Mikrotubuli in Xpo1-Mutanten 53 3\. Diskussion 55 3.1 Die Gesamtstruktur von
Xpo1 trägt zur Exportfunktion bei 55 3.2 Die 2-Hybrid-Analyse findet neue
Interaktionspartner von Xpo1 56 3.3 Xpo1 lokalisiert am Spindelpolkörper 58
3.4 Xpo1 wechselwirkt mit Spc72 60 3.4.1 Identifikation der NES von Spc72 60
3.4.2 Bedeutung der Spc72-NES in vivo 62 3.5 Funktion von Xpo1 in der Spindel-
Bildung 62 3.6 Offene Fragen 64 4\. Material und Methoden 65 4.1 Verwendete
Hefestämme und ihre Erzeugung 65 4.2 Verwendete Plasmide und ihre Herstellung
68 4.3 Grundlegende Methoden 71 4.3.1 Anzucht von Hefen 71 4.3.2 Sporulation
und Tetradenanalyse 71 4.3.3 Tüpfeltest zur Analyse des Zellwachstums 72 4.3.4
Immunoblotten 72 4.3.5 Mikroskopie 72 4.4 Methoden zur Charakterisierung der
Xpo1-Mutanten 73 4.4.1 Degradations-Analyse 73 4.4.2 Zellzyklus-Analyse 73
4.4.3 Untersuchung des Protein-Exports 73 4.4.4 Untersuchung des mRNA-Exports
73 4.5 Untersuchung der 2-Hybrid-Interaktionen 75 4.5.1 Ungerichtete und
gerichtete 2-Hybrid-Analyse 75 4.5.2 Leptomycin B-Test zur Lokalisation der
putativen NES-Substrate 75 4.6 Methoden zur Untersuchung der Lokalisation von
Xpo1 76 4.6.1 Immuno-Fluoreszenz von Xpo1 und xpo1-1 76 4.6.2 Einfluss von
Nocodazol 77 4.6.3 Co-Fraktionierung von Xpo1 und Spc110 im Sucrose-Gradienten
77 4.6.4 Überexpression von Ran 78 4.7 Methoden zur in vitro-Bindungsanalyse
78 4.7.1 Anzucht von Bakterien 78 4.7.2 Rekombinante Expression und Reinigung
His-markierter Proteine 78 4.7.3 Rekombinante Expression und Reinigung GST-
markierter Proteine 80 4.7.4 In vitro-Bindungsanalyse 81 4.8 Methoden zur
Charakterisierung der Spc72-Xpo1-Interaktion 82 4.8.1 Überexpression von Spc72
durch MET3 82 4.8.2 Analysen mit NES-NLS-Reporter-Plasmid 82 4.8.4 Vergleich
der Expression von Spc72-GFP und spc72-NES*-GFP 82 4.8.5 Quantifizierung der
SPB-Signale 83 4.8.6 Vergleich der zytoplasmatischen Mikrotubuli 83 5\.
Literaturverzeichnis 84 6\. Anhang 97 6.1 Abkürzungen 97 6.2 Übersicht der
orthologen Proteine 98 6.3 Veröffentlichungen 99 6.4 Danksagung 99
dc.description.abstract
Xpo1 ist das Ortholog des Kerntransport-Rezeptors Crm1 in der Bäckerhefe
Saccharomyces cerevisiae. In höheren Eukaryoten exportiert Crm1 Proteine wie
den Transkriptions-Faktor AP-1 und den Tumor-Suppressor p53 aus dem Zellkern
ins Zytoplasma. Eine Rolle von Crm1 im Export von messenger-RNA wird
gegenwärtig kontrovers diskutiert. Dagegen ist Xpo1 in der Bäckerhefe sowohl
am Protein- wie auch am mRNA-Export beteiligt. Trotz der essentiellen Funktion
von Xpo1 konnten erst wenige Transport-Substrate identifiziert werden. Xpo1
bindet im Kern kooperativ an Frachtmoleküle, die eine Kernexportsequenz
(nuclear export sequence, NES) besitzen, und an die GTPase Ran/Gsp1, die im
Kern in GTP-beladener Form vorliegt. Nach der Passage durch die Kernpore lösen
im Zytoplasma lokalisierte Faktoren die Hydrolyse von Ran-GTP zu Ran-GDP aus.
Dies bewirkt eine Konformationsänderung und führt zur Freisetzung des
Frachtmoleküls. Unbeladenes Xpo1 kehrt in den Kern zurück. Kerntransport-
Rezeptoren und Ran spielen auch eine Rolle in der Bildung einer bipolaren
Spindel: in höheren Eukaryoten ist Crm1 an der Kontrolle der Centrosomen-
Verdopplung beteiligt, und die Lokalisation von Ran-GTP an den Chromosomen
fördert die Bildung der Kernspindel. In der vorliegenden Arbeit wurde zunächst
versucht, die Bedeutung der verschiedenen Domänen von Xpo1 im Protein- und
mRNA-Export zu klären. Dazu wurden mehrere Mutationen in XPO1 eingefügt. Die
entstandenen xpo1-Allele verursachten unterschiedlich starke Defekte im
Protein- und mRNA-Export. Ein eindeutiger Zusammenhang zwischen den
beobachteten Defekten und den Änderungen in der Proteinsequenz war jedoch
nicht festzustellen. Zur Identifikation neuer Interaktionspartner von Xpo1
wurde eine ungerichtete 2-Hybrid-Analyse durchgeführt, in der u.a. das
Spindelpolkörper-Protein Spc72 gefunden wurde. Der Spindelpolkörper ist das
funktionelle Äquivalent der Centrosomen höherer Eukaryoten. Spc72 verankert an
der zytoplasmatischen Seite den γ-Tubulin-Komplex, von dem die Mikrotubuli
polymerisieren. In Analogie zur Bindung von Crm1 an die Centrosomen wurde auch
in der Bäckerhefe eine Lokalisation von Xpo1 an den Spindelpolkörpern
nachgewiesen. Sie kann durch Änderung des Ran-Staus der Zelle beeinflusst
werden. Sie ist jedoch nicht nur von Spc72 abhängig, da sich auch in einem
SPC72-Deletionsstamm Xpo1 an den Spindelpolkörpern befindet. Durch in vitro-
Bindungsstudien konnte gezeigt werden, dass Xpo1, Spc72 und Ran-GTP einen
trimeren Komplex bilden, der die Kriterien eines Export-Komplexes erfüllt.
Eine NES in Spc72 wurde identifiziert und ihre Funktion in einer 2-Hybrid-
Analyse und in Reporter-Plasmid-Analysen bestätigt. Die Mutation der NES von
Spc72 führt in der Zelle zu einer Verringerung der Spc72-Menge an den
Spindelpolkörpern. Dies verursacht eine Reduktion der zytoplasmatischen
Mikrotubuli. Dieser Phänotyp wurde auch in xpo1-Allelen gefunden. Damit
konnten erste Hinweise auf eine funktionelle Wechselwirkung zwischen Xpo1 und
Spc72, die von der NES in Spc72 abhängt, geliefert werden. Darüber hinaus
zeigt diese Arbeit zum ersten Mal eine Lokalisation von Xpo1 am
Spindelpolkörper in der Bäckerhefe. Xpo1 könnte an Prozessen wie der
Spindelpolkörper-Verdopplung, der Regulation der Mikrotubuli-Polymerisation
oder der Verteilung des γ-Tubulin-Komplexes beteiligt sein.
de
dc.description.abstract
Xpo1 is the orthologue of the nuclear transport receptor Crm1 in the budding
yeast Sac-charomyces cerevisiae. In higher eukaryotes, Crm1 exports proteins
such as the transcription factor AP-1 or the tumor suppressor p53 from the
nucleus to the cytoplasm. A role of Crm1 in messenger RNA export is discussed
contoversely. In contrast, Xpo1 is involved in protein and mRNA export in the
budding yeast. Despite Xpo1's essential function, only few transport
substrates have been identified so far. Xpo1 binds in the nucleus
cooperatively to cargo molecules containing a nuclear export sequence (NES)
and to the GTPase Ran/Gsp1, which exists in the nucleus in its GTP-bound form.
After passage through the nuclear pore, factors localized in the cytoplasm
trigger the hydrolysis of Ran-GTP to Ran-GDP. This causes a conformational
change which leads to cargo release. Unloaded Xpo1 travels back into the
nucleus. Nuclear transport receptors and Ran also play a role in the formation
of a bipolar spindle: in higher eukaryotes, Crm1 is involved in the control of
centrosome duplication, and the localization of Ran-GTP at the chromosomes
promotes the formation of the nuclear spindle. In the present work, at first
the importance of the different Xpo1 domains in protein and mRNA export was
analyzed by introducing several mutations in the XPO1 coding region. The
resulting xpo1 alleles showed various defects in protein and mRNA export, but
a clear correlation between the observed defects and the alterations in the
protein se-quence was not obvious. To identify new proteins interacting with
Xpo1, an undirected 2-hybrid assay was performed. Among other proteins Spc72
was found, a component of the spindle pole body, the functional equivalent of
the centrosomes in the budding yeast. Spc72 anchors the γ-tubulin complex from
which microtubules polymerize at the cytosolic face of the spindle pole body.
By analogy of Crm1 binding to centrosomes in mammalian cells, the localization
of Xpo1 was determined. Also in the budding yeast, Xpo1 can be found at the
spindle pole bodies, and this localization can be affected by changing the Ran
status of the cell. However, Xpo1's localization is not solely dependent on
Spc72 as it still binds to the spindle pole bodies in a SPC72 deletion strain.
The interaction of Xpo1 with Spc72 was analyzed further by in vitro binding
assays. Xpo1, Spc72, and Ran-GTP form a trimeric complex that fulfills the
criteria of a nuclear export complex. A NES could be identified in Spc72 and
its function was confirmed by a 2-hybrid assay and reporter plasmid assays.
Mutations in this NES decrease the amount of Spc72 at the spindle pole bodies
in the cell and cause a reduction of cytoplasmic microtubules. This phenotype
was also observed in Xpo1 alleles. This work shows first hints to a functional
interaction between Xpo1 and Spc72 in the cell that is dependent on the NES of
Spc72. Moreover, a localization of Xpo1 at the spindle pole bodies in the
budding yeast was proved for the first time. Xpo1 could participate in
processes such as spindle pole body duplication, regulation of microtubule
polymerisation or distribution of the γ-tubulin complex.
en
dc.rights.uri
http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen
dc.subject
nuclear transport
dc.subject
spindel pole body
dc.subject.ddc
500 Naturwissenschaften und Mathematik::570 Biowissenschaften; Biologie
dc.title
Der Kerntransport-Rezeptor Xpo1 ist beteiligt an der Spindelbildung in der
Bäckerhefe Saccharomyces cerevisiae
dc.contributor.contact
anja_neuber@freenet.de
dc.contributor.firstReferee
Thomas Blankenstein
dc.contributor.furtherReferee
Udo Heinemann
dc.date.accepted
2008-10-22
dc.identifier.urn
urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000005906-8
dc.title.translated
The nuclear export receptor Xpo1 is involved in the spindle formation in the
baker's yeast Saccharomyces cerevisiae
en
refubium.affiliation
Biologie, Chemie, Pharmazie
de
refubium.mycore.fudocsId
FUDISS_thesis_000000005906
refubium.mycore.derivateId
FUDISS_derivate_000000004600
dcterms.accessRights.dnb
free
dcterms.accessRights.openaire
open access