id,collection,dc.contributor.author,dc.contributor.firstReferee,dc.contributor.furtherReferee,dc.contributor.gender,dc.date.accepted,dc.date.accessioned,dc.date.available,dc.date.issued,dc.description.abstract[de],dc.description.abstract[en],dc.format.extent,dc.identifier.uri,dc.identifier.urn,dc.language,dc.rights.uri,dc.subject,dc.subject.ddc,dc.title,dc.title.translated[en],dc.type,dcterms.accessRights.dnb,dcterms.accessRights.openaire,dcterms.format[de],refubium.affiliation[de],refubium.mycore.derivateId,refubium.mycore.fudocsId "4d05e237-5b06-4070-ad88-835cdcde0b1b","fub188/13","Hoffmann, Peter","N.N.","N.N.","m","2017-06-25","2018-06-07T15:20:45Z","2017-05-29T09:26:19.009Z","2017","Einleitung: Für eine zuverlässige, qualitätsgesicherte Diagnostik ist es sehr wichtig, mögliche Einflussgrößen und Störfaktoren einer laboratoriumsmedizinischen Untersuchung zu erkennen. Störfaktoren müssen minimiert werden, Einflussgrößen sind bei der Beurteilung von Messergebnissen zu berücksichtigen. In dieser Arbeit wurden sowohl manuelle, als auch eine automatisierte routinediagnostische Methode auf das Vorhandensein von Störfaktoren untersucht. Die Auswirkungen einer hochgradig entzündlichen Erkrankung als Einflussgröße für etablierte und neue laboratoriumsmedizinische Parameter wurden analysiert. Methodik: Die Richtigkeit der Messungen des Urinchemie-Analysators iChem Velocity wurde getestet und mit den Ergebnissen des Clinitek Atlas verglichen. Es wurde untersucht, ob RNAund Proteinrückstände in DNA-Präparationen die Leseweite oder den Lesefehleranteil bei DNASequenzierungen beeinflussen. Des Weiteren wurde analysiert, mit welcher Methode kleinste Mengen an DNA optimal aufgereinigt werden können. Der Anstieg und das Absinken der Parameter C-reaktives Protein, Procalcitonin, Leukozyten- und Thrombozytenzahl, Granularitäts-Index und δ-Hämoglobin während einer hochgradig entzündlichen Erkrankung wurden untersucht. Ergebnisse: Der iChem Velocity detektierte Hämoglobin und Leukozyten mit einer AUC von 0,73 und 0,78. Bei der Analyse von 257 Urinproben traten 19 falsch-negative Messungen von Erythrozyten und 32 falsch-negative Leukozytenbestimmungen auf. Versuche zum Vergleich verschiedener DNA-Isolationsmethoden ergaben, dass in den Präparationen verbliebene Proteinrückstände mit dem Auftreten von Lesefehlern bei einer anschließenden DNA-Sequenzierung korrelierten (r = 0,63). Bei der Aufreinigung von Plasmid-DNA erzielte die Verwendung einer Säule mit Silika-Membran die besten Resultate in DNA-Rückgewinnung und Zeitaufwand. Es wurden Parameter-Verlaufskurven für Entstehung und Abklingen einer Entzündung erstellt. Schlussfolgerungen: In der weiteren Entwicklung des iChem Velocity sollte die Sensitivität erhöht werden. DNA-Präparationen für Sequenzierungsreaktionen sollten frei von Proteinrückständen sein. Die optimale Reinigungsmethode für Plasmid-DNA ist eine Säule mit Silika- Membran. Die Parameterkurven geben Aufschluss über den am besten geeigneten Zeitrahmen für die Entzündungsdiagnostik.","Background: Reliable, quality assured diagnostics require the detection of potential interferents and influencing variables. The presence of interferents has to be minimized, and influencing variables have to be taken into account when assessing measurement results. In this study, manual as well as automated routine diagnostic methods were examined for the presence of interferents. The effects of a high-grade inflammation as influencing variable for established and novel laboratory medicine parameters were analyzed. Methods: The accuracy of the urine chemistry analyzer iChem Velocity was tested and compared with the results of a Clinitek Atlas. It was investigated if RNA and protein remainders in DNA preparations affect the read length or the percentage of reading errors made during DNA sequencing. In addition, it was analyzed which method provides optimal results for the purification of small amounts of DNA. The increase and decrease of the parameters C-reactive protein, procalcitonin, leukocyte and thrombocyte count, granularity index, and δ-hemoglobin were examined during a high-grade inflammation. Results: The iChem Velocity detected hemoglobin and leukocytes with an AUC of 0.73 and 0.78. During the analysis of 257 urine samples, 19 false negative measurements of erythrocytes and 32 false negative results for leukocytes occurred. Experiments comparing different DNA isolation methods showed, that protein remainders in the DNA preparations correlated with the occurrence of reading errors during subsequent DNA sequencing (r = 0.63). For the purification of plasmid DNA, using a micro column with silica membrane achieved the best results in DNA recovery and time requirement. Trajectories for the parameters' dynamics during the onset and resolution of an inflammation were calculated. Conclusions: The sensitivity of the iChem Velocity should be increased in the ongoing development process. DNA preparations for sequencing reactions should be free of protein contaminants. The ideal purification method for plasmid DNA is a column with silica membrane. The parameter trajectories show the most suitable time frame for inflammation diagnostics.","43","https://refubium.fu-berlin.de/handle/fub188/929||http://dx.doi.org/10.17169/refubium-5131","urn:nbn:de:kobv:188-fudissthesis000000104287-2","ger","http://www.fu-berlin.de/sites/refubium/rechtliches/Nutzungsbedingungen","urinalysis||interferents||influencing variables||ascorbic acid||DNA sequencing||inflammatory markers","600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften::610 Medizin und Gesundheit","Auswirkungen von Störfaktoren und Einflussgrößen auf die Ergebnisse laboratoriumsdiagnostischer Methoden","Effect of interferents and influencing variables on the results of laboratory diagnostic methods","Dissertation","free","open access","Text","Charité - Universitätsmedizin Berlin","FUDISS_derivate_000000021123","FUDISS_thesis_000000104287"